بررسی بیان ژن های FCGRIIA، SYK، PLCG و RAF1 در سلول های تک هسته ای خون محیطی بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس(MS) در مقایسه با افراد سالم
General Material Designation
[پایان نامه]
First Statement of Responsibility
احسان احمدی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۴۰۱
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۵ص.
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
دکتری تخصصی(PHD)
Discipline of degree
ایمنی شناسی پزشکی
Date of degree
۱۴۰۱/۰۹/۱۵
Text preceding or following the note
۱۸.۷۵
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
مقدمه: بیماری MS یک بیماری التهابی مزمن و اتوایمیون می باشد که در سیستم عصبی مرکزی رخ می دهد و با دمیلینه شدن آکسون ها همراه است. علاوه بر سیستم عصبی مرکزی، سلول های ایمنی محیطی نیز تحت تاثیر این بیماری قرار می گیرند. هدف از این مطالعه بررسی تغییر پروفایل ژنی بیماران MS و شناسایی ژن های جدید با استفاده از آنالیز داده های ریزآرایه که بر روی PBMC افراد مبتلا به MS انجام شده اند می باشد. علاوه بر این، این مطالعه به بررسی بیان ژن های FCGRIIA، SYK، PLCG و RAF1 که از نتایج مطالعات قبلی انتخاب شده اند نیز پرداخته است.روش کار: بررسی دیتاست میکرواری با استفاده از نرم افزار R انجام گردید. ژن های با بیان تغییر یافته با استفاده از کتابخانه ی Limma و معیار p.value < 0.05 و |logFC|>1 انتخاب شدند. بررسی فرآیند ها و مسیر های بیولوژیک در ژن های با بیان تغییر یافته با استفاده از کتابخانه ی clusterProfiler در نرم افزار R انجام شد و برای نشان داده نتایج از کتابخانه ی enrichplot استفاده گردید. دیتا های مورد استفاده برای آنالیز های شبکه از دیتابیس STRING مستخرج گردید و نتایج با استفاده از نرم افزار Cytoscape نشان داده شد.به منظور بررسی بیان ژن های انتخاب شده، RNA از سلول های PBMC بیماران MS در فاز Remisssion (n=18)، فاز Relapse (n=20) و افراد سالم (n=18) استخراج گردید و سنتز cDNA انجام شد. بیان ژن های FCGRIIA، SYK، PLCG و RAF1 در گروه های مورد مطالعه با استفاده از تکنیک SYBR Green Real-Time PCR انجام شد. آنالیز داده های بیان ژن با استفاده از روش 2- ΔΔCT انجام گردید.نتایج: بررسی ها نشان داد که ژن های با بیان افزایش یافته در بیماران MS بیشتر در فرآیند های مربوط به پاسخ های ایمنی همورال و سلول های B نقش دارند. همچنین، ژن های با بیان کاهش یافته بیشتر در فرآیند های تنظیمی سلول و فرآیند های متابولیک مربوط به mRNA ها نقش دارند. نتایج این مطالعه نشان داد که سطح بیان ژن های FCGRIIA، SYK و RAF1 در بیماران MS مصرف کننده ی اینترفرون بتا نسبت به افراد سالم افزایش می یابد اما این افزایش از نظر آماری معنادار نبود.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه اهمیت سلول های پاسخ های سلول های B و ویروس EBV را در بیماران MS نشان می دهد. علاوه بر این نشان دهنده اهمیت پپتید های ضد میکروبی چون دفنسین ها و کاتلسیدین در بیماری MS می باشد. افزایش بیان ژن های FCGRIIA، SYK و RAF در بیماران MS نشان دهنده ی اهمیت این ژن ها در بیماران MS در پاسخ به کمپلکس های ایمنی می باشد که نیازمند مطالعات بیشتر می باشد.