طراحی و راه اندازی روش تشخیصی Real Time PCR برای ویروس Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome
General Material Designation
[پایان نامه]
First Statement of Responsibility
زهرا فریدونی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۳۹۸
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۲ص.
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
زیست فناوری پزشکی
Date of degree
۱۳۹۸/۱۱/۰۸
Text preceding or following the note
۱۸
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
سندروم تب به همراه ترومبوسیتوپنی یا SFTS (Severe Fever with Thrombocytopenia) یک بیماری عفونی نوپدید است که اخیرا در آسیا کشف شده است. عامل این بیماری ویروس SFTSV (Severe Fever with Thrombocytopenia Virus) می باشد که از طریق کنه و دام به انسان منتقل می شود و تا کنون درمان قطعی یا واکسنی برای آن وجود ندارد. با توجه به گزارش سازمان بهداشت جهانی در ارتباط با ریسک اپیدمی شدن گروهی از بیماری های ویروسی، این ویروس به عنوان یکی از عوامل عفونی مورد توجه قرار دارد. بدین سبب، راه اندازی روش تشخیصی سریع برای شناسایی این ویروس به طور اختصاصی از اولویت های آزمایشگاه مرجع کشوری محسوب می شود. به منظور تشخیص سریع بیماری SFTS، طراحی و راه اندازی تست به روش مولکولی Real Time PCR انجام شد. توالی های مربوط به کل قطعات ژنوم ویروس به کمک نرم افزار Mega4 بررسی شد تا نواحی حفاظت شده یافت شوند. در قطعه کوچک ژنوم ویروس ناحیه ی حفاظت شده ای برای طراحی پرایمر و پروب انتخاب شد و به کمک نرم افزار های GeneRunner و Allele ID طراحی و مطالعه ترمودینامیکی آنها انجام شد. توالی مربوطه و همچنین توالی پرایمر ها و پروب از نظر اختصاصی بودن در NCBI بررسی شدند. از پلاسمید استخراج شده رقت های مختلفی تهیه و تست SYBR Green و Real Time PCR انجام شد.بررسی تست رقت های ساخته شده نشان داد توانایی تشخیص ویروس از 6.8 تا میزان 68 کپی است. در آزمایش اختصاصیت روش تشخیصی، هیچ یک از کنترل های مثبت تکثیر نشدند که نشان دهنده100% اختصاصی بودن تست برای ویروس SFTSV می باشد. روش Real-Time RT-PCR راه اندازی شده در طرح می تواند به عنوان یک روش قابل اعتماد برای تشخیص به موقع عفونت SFTS استفاده شود.