#شناسایی اپیتوپهای ایمونوژن IgG انسان با استفاده از ایمونوانفورماتیک
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
#، ۱۶۹ ص.: شکل
Specific Material Designation and Extent of Item
1
EXTERNAL INDEXES/ABSTRACTS/REFERENCES NOTE
Name of source
#مقدمه :ایمونوگلوبولین G (IgG) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و بین سطح IgG سرم و شدت برخی بیماریها از قبیل نقائص ایمنی، بیماریهای عفونی و بیماریهای خود ایمنی ارتباط وجود دارد بنابراین IgG از ارزش تشخیصی بالایی برخوردار است .ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخ های ایمنی، نقش آنها در سلامت و بیماری و تشخیص دقیق تر بیماری ها کمک می کند .هدف این پژوهش استفاده از ابزار ایمونوانفورماتیک برای تعیین اپی توپ های ایمونوژن IgG انسان در جهت بهینه سازی تکنیک های تشخیصی IgG انسان است .روش ها :توالی مرجع IgG انسان در پایگاه داده PDB و ساختار دوم و سوم آن توسط نرم افزار Phyre2 و پایگاه داده PDB تعیین شد .از نرم افزارهای Profunc در شناسایی شکاف های سطحی، Interpro surf در تعیین اسیدآمینه های عملکردی، IEDB در تعیین خصوصیات فیزیکوشیمیایی اسیدآمینه ها، Antigenic index درتعیین مناطق آنتی ژنیک، Ellipro و IEDB در تعیین اپی توپ های خطی و نرم افزارهایEllipro ،DiscoTop ،Seppa ، Epitopia و CEP در تعیین اپی توپ های فضایی IgG انسان، استفاده شد .نتایج :در این مطالعه ۱۱ اپی توپ خطی در دومین های ثابت IgG انسان شناسایی شد که یکی از آنها مربوط به ناحیه Fab و ۰۱ اپی توپ دیگر در دومین های ثابت و زنجیره های سنگین (CH2 و CH3) به طور مساوی واقع شده اند و شاخص ترین این اپی توپ ها( ۵ عدد )در دومین CH3 هستند .همچنین ۲ اپی توپ فضایی در دومین CH2 زنجیره سنگین توسط نرم افزار Ellipro و۹۳ اپی توپ فضایی در دومین های ثابت IgG انسان توسط نرم افزار CEP شناسایی شد که ۳۱ اپی توپ مربوط به ناحیهFab ، ۱۲ اپی توپ مربوط به ناحیه Fc و ۵ اپی توپ به صورت مشترک بین نواحی Fab و Fc واقع شده اند .در بخش Fc دومینCH2 ، دومین غالب در تشکیل اپی توپ هاست .نتیجه گیری :در این مطالعه تعداد قابل توجهی از اپی توپ های خطی و فضایی IgG انسان توسط چندین نرم افزار بررسی و معرفی شدند که مطالعات آزمایشگاهی که قبلا در این زمینه به عمل آمده اند، تایید کننده این نتایج هستند .ضمنا اپی توپ های تعیین شده در این مطالعه ابزار مناسبی جهت تولید آنتی بادی های مونوکلونال اختصاصیIgG ، تعیین نقشه اپی توپ های IgG و مطالعات فیلوژنیک مربوط می باشند .