عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
۳۱۸۳پ
فارسی
شناسایی ژن ها و جهش های نادردر30 خانواده ايراني با ناشنوایی ارثی که در ژن های شناخته شده جهشی نداشته اند با استفاده ازروش های توالی یابی نسل جدید و آنالیز پیوستگی
[پایان نامه]
Identification of rare mutations and genes related to hereditary hearing loss by next generation sequencing and linkage analysis in 30 Iranian families for whom no mutations in known genes been detected
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation
۱۳۹۹
۱۰۱ص.
پیوست
دکترا
ژنتیک پزشکی medical genetics
۱۳۹۹/۱۲/۱۷
عيوب شنيداري ارثي در تقريباً 500/1 از نوزادان مشاهده مي شود و عامل بيش از 50% از موارد متوسط، پيشرفته و عميق كل ناشنوايي هاي نوزادي است. اين عيوب ممكن است همراه با ساير صور باليني ارثي و فنوتيپ هاي شناخته شده باشد ناشنوايي هاي سندرمي) Syndromic Hearing Loss(SHL) ( و همچنين ممكن است بصورت مواردي مجزا و بدون علائم ديگر باشد که ناشنوايي هاي ارثي غيرسندرميNSHL)) ) ( Non Syndromic Hearing Loss نامیده می شود . ناشنوايي هاي ارثي غيرسندرمي تقريباً عامل 70% از كل ناشنوايي هاي ژنتيكي هستند كه عمدتاً تك ژني و هتروژن مي باشند.شیوع ناشنوایی در ایران بسیار بالا است. برخی از مطالعات شیوع ناشنوایی در کودکی را در حدود 3 در هر 1000 کودک ذکر کرده اند. علاوه بر این، این بیماری بسیار هتروژن می باشد. در طی بررسی ها و آزمایشات متعددی که بر روی اساس ژنتیکی این بیماری و عمدتا نوع غیرسندرمی اتوزومی مغلوب در مرکز تحقیقات ژنتیک، صورت گرفته است حدود 80% از علل ایجاد کننده این بیماری شناسایی گردیده است.لذا با توجه به شیوع بالای ناشنوایی که به عنوان یکی از معضلات کشور محسوب می شود، شناسایی علل این بیماری با روشی دقیق، سریع و کم هزینه به منظور ارتقای روش های پیشگیری از جایگاه ویژه ای برخوردار است.در این تحقیق 30 خانواده از یک کوهورت بزرگ از بیماران HHL ایرانی جمع آوری شده در مرکز تحقیقات ژنتیک که با بررسی پنل OtoSCOPE V5,V6 در آنها هیچ جهشی در 89 ژن شناخته شده ناشنوایی پیدا نشده بود با روش توالی یابی کل اگزوم مورد بررسی قرار گرفتند. در 16 مورد از این خانواده ها ، ما به 18 تغییر بیماریزا دست پیدا کردیم ، که 11تا از آنها در ژن های شناخته شده بودند: (MYO3A, TMIE, NARS2, CDC14A, PCDH15, DIAPH1, PTPRQ, (COL9A1 و 7 مورد دیگر در ژنهای کاندید جدید در ناشنوایی شناخته شدندTOP3A) ، COX18، USP31، TCF19، SCP2، CARMIL1 (PLSCR4,.به طور کلی ، ما توانستیم علت ژنتیکی ابتلا به ناشنوایی را در 53٪ از خانواده ها حل کنیم.این مطالعه بزرگترین در نوع خود تا به امروز است و این تأیید را نشان می دهد که توالی یابی DNA با توان بالا در جمعیت هایی که میزان بالایی از ازدواج های خویشاوندی دارند ، بیانگر یک راهکار برتر برای روشن کردن ژن ناشناخته در زمینه بیماری های هتروژن مانند کاهش شنوایی استكلمات كليدي: ناشنوایی ارثی، توالی یابی کل اگزوم، پانل ناشنوایی،آنالیز پیوستگی، جهش جدید.
Hereditary hearing impairment is observed in approximately 1 in 500 neonates and isresponsible for more than 50% of the moderate, advanced and profound cases of totalneonatal hearing loss. This defect may also be associated with other hereditary clinicalfeatures and known phenotypes (syndromic hearing loss (SHL)), and may also be isolatedwithout any other symptoms (non syndromic hereditary hearing loss (NSHL)). Nonsyndromic hereditary hearing loss is responsible for almost 70% of all genetic deafness,which is mostly monogeneous and heterozygous.The prevalence of deafness in Iran ishigh. Some of the studies have reported the prevalence of childhood deafness in about 3per 100 children. In addition, this defect is very heterogeneous. According to previousstudies performed at Genetics Research Center, mostly on non-syndromic autosomalrecessive form, 80% of deafness causes in Iran has been discovered.Therefore, due to the high prevalence of deafness as one of the most important country'shealth challenges, identifying the causes of HHL with accurate, fast and cost effectivemethods, to improve prevention of the diseasehas a special place.In this study, weperformed whole-exome sequencing on 30 families selected from a large cohort of IranianHHL patients in the Genetics Research Center, for which the targeted OtoSCOPE V5 andV6 panels for 89 genes had not yielded any HHL-implicated mutations.In 18 of these families, we identified likely causal variants, located in 11 known(MYO3A, TMIE, NARS2, CDC14A, PCDH15, DIAPH1 ,COL9A1, PTPRQ) and 7 novelcandidate genes (TOP3A, COX18, USP31, TCF19, SCP2, CARMIL1 , PLSCR4). Overall,we could resolve the underlying genetic cause for 53% of the previously unresolvedfamilies.This study is the largest of its kind to date and corroborates the observation that highthroughput DNA sequencing in populations with a high rate of consanguineous marriagesrepresents a superior strategy to elucidate the unknown gene underlying heterogeneousdiseases such as hearing loss.Keywords: Hereditary hearing impairment, Whole exome sequencing, deafness panel,linkage analysis, novel mutation
ناشنوایی ارثی
محسنی، مرضیه
Mohseni, Marziye
نجم آبادی، حسین
کهریزی، کیمیا
ایران
دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی
20210613
D
TF
279226
a
Y
