بررسی تغییرات تعداد کپی و الگوی بیانی انکوژن های خانواده ی ژنی HER در زنان ایرانی مبتلا به سرطان پستان تک گیر و ارتباط آن با شاخص های بالینی و ایمنوهیستوشیمی
[پایاننامه]
Investigation of copy number variation and expression pattern of HER oncogene family members in Iranian women affected by sporadic breast cancer and its relationship with clinical and immunohistochemical parameters
علوم بهزیستی وتوانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
، ۱۳۹۸
۱۴۲ص.
پیوست
چاپی
دکترا
ژنتیک پزشکیMedical Genetics
۱۳۹۸/۰۳/۰۷
علوم بهزیستی وتوانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
هدف از انجام این مطالعه، ارزیابی قابلیت استفاده از روش MLPA برای تعیین تغییرات تعداد کپی و روش Syber Green Real Time PCR برای تعیین پروفایل بیان اعضای خانواده ژنی HER در سرطان پستان Invasive ductal و کشف ارتباط ژن هایHER ۴-۱ با ویژگی های کلینیکوپاتولوژیک بیماران مبتلا به سرطان پستان می باشد .روش بررسی :ویژگیهای بالینی و ایمونوهیستوشیمی در بیماران مبتلا به سرطان پستان مورد ارزیابی قرار گرفت و برای هر نمونه ی توموری ساب تایپ مولکولی تعیین شد .تعداد کپی ژن هایHER ۴-۱ توسط روش MLPA بررسی شد و الگوی بیان ژن هایHER ۴-۱ به وسیله Syber Green Real Time PCR ارزیابی شد .یافته ها :بر اساس نتایج تحلیلCNV ، ما مشاهده کردیم که ۲۵ درصد از همه بیماران، با استفاده ازMLPA ، در ژنHER ۲ تقویت ژنی نشان دادند .افزون بر این، تنها ۸.۲ و ۹.۱ از بیماران به ترتیب در ژن هایHER ۱ وHER ۴ تقویت ژنی نشان دادند .تغییرات تعداد نسخه در ژنHER ۳ در هیجیک از بیماران مشاهده نشد .نتایج ما نشان داد که ارتباط معنی دار بین تعداد کپیHER ۲ و = (p value ۰۱.۰( Histological grade، = value p ( ۰۲.۰ ( Stageو( ۰۰۱.۰ p<( Tumor subtype وجود دارد .همچنین نتایج ما نشان داد که بیانHER ۱ با پارامترهای کلینیکوپاتولوژیک از جمله(p=- (ER ۰۰۵.۰P = ،(p=- PR ۰۱۳.۰ P) = و = triple negative Subtype (p ۰۰۲.۰) همبستگی دارد و بیانHER ۴ با عوامل پیش آگهی خوب از جمله ساب تایپ=Luminal A ) (P ۰۳.۰، اندازه تومور کوچکتر یا مساوی ۲ سانتیمتر = (p ۰۲.۰) و شاخصKi ۶۷ کمتر از ۱۵ درصد = )(p ۰۱.۰ ارتباط دارد .نتیجه گیری :با توجه به یافته های ما، MLPA یک تکنیک سریع، دقیق و کم هزینه برای تشخیص تقویت ژنیHER ۲ است .ما MLPA را به عنوان یک روش با همبستگی بالا با IHC و FISH یافتیم .ما تأیید کردیم که بیان بیش از حدHER ۱ با پارامترهای کلینیکوپاتولوژیک پیش آگهی بد و بیانHER ۴ با عوامل پیش آگهی خوب ارتباط دارد .کلید واژه ها :سرطان پستان،ERBB ۴-۱، تغییر تعداد نسخه،MLPA ، Syber Green Real Time PCR
Background: The aim of this study was to assess the usability of multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) for copy number determination and Syber green Real Time PCR for expression profiling of HER gene family members (including ERBB1, ERBB2, ERBB3 and ERBB4) in invasive ductal breast carcinoma and to explore the association of HER1-4 genes with clinicopathological characteristics of breast cancer (BC) patients. Patients and Methods: Clinical and immunohistochemical characteristics were assessed in BC patients and the molecular subtype was determined for each tumor sample. The copy numbers of HER1-4 genes were determined by MLPA and expression pattern of HER1-4 genes were assessed by Syber green Real Time PCR. Results: Based on CNV analysis results, we observed that 25 percent of all patients showed HER2 gene-amplification by MLPA. Moreover, only 2.8 and 1.9 of patients showed amplification in HER1 and HER4 genes, respectively. No copy number changes were observed in ERBB3 gene. Our results indicated a significant association between HER2 copy number gain and histological grade (p value= 0.01), stage (p value= 0.02), and tumor subtypes (p <0.001). Our results showed that HER1 expression has a correlation with poor prognostic clinicopathological parameters (ER negativity (p= 0.005), PR negativity (p=0.013) and triple negative subtype (p= 0.002)) and HER4 expression has a correlation with good prognostic factors (Luminal A subtype (p=0.03), tumor size=<2cm (p=0.02) and Ki 67<15 (p=0.01)). Conclusion: According to our findings, MLPA is a fast, precise and low-cost technique to detect ERBB2 amplification. We found MLPA as a technique with high concordance with IHC and FISH. We confirmed that HER1 overexpression has a correlation with poor prognostic clinicopathological parameters. We also confirmed that HER4 expression has a correlation with good prognostic factors. Keywords: Breast Cancer, ERBB1-4, copy number variation, MLPA, Real time RT-PCR
ba
Investigation of copy number variation and expression pattern of HER oncogene family members in Iranian women affected by sporadic breast cancer and its relationship with clinical and immunohistochemical parameters