کاربرد مدل توأم طولی و بقا به روش اسپلاین تاوانیده در دادههای پزشکی
[پایاننامه]
Application of joint model for survival and longitudinal with penalized spline approach in medical data
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfar and Rehabilitation))
، ۱۳۹۷
ه،۶۷ص.
پیوست
چاپی
کارشناسی ارشد
آمار زیستی Biostatistics
۱۳۹۷/۰۶/۳۱
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfar and Rehabilitation))
مقدمه :در برخی مطالعات، اطلاعاتی درباره پیشامدهای زمان تا وقوع حادثه همراه با اندازههای طولی از یک نشانگر بیماری جمعآوری میشود .بررسی جداگانه دادههای طولی و بقا نمیتواند وابستگی این دو نوع متغیر را در مدل لحاظ کند .یکی از روشهای مناسب برای رفع این مشکل، مدلهای توأم طولی و بقا است .زیر مدلهای طولی و بقا متنوعی تا کنون بررسی شدهاند .این مطالعه با هدف کاربرد مدل توأم طولی و بقا به روش اسپلاین تاوانیده در دادههای پیوند کلیه طرح ریزی شده است .مواد و روش ها :در این مطالعه طولی گذشتهنگر، اطلاعات ۱۶۵ گیرنده پیوند کلیه در بیمارستان بقیه الله تهران که از سال ۱۳۸۵ تا ۱۳۹۵ تحت عمل جراحی پیوند کلیه قرار گرفتهاند، از پرونده بیماران ثبت شد .کراتینین خون تا زمانی که اطلاعات در پرونده بیمار موجود بود و زمان بقای پیوند به عنوان پاسخ در نظر گرفته شدند .مدل توأم طولی و بقا با زیر مدل ناپارمتری اسپلاین تاوانیده برای پاسخ طولی کراتینین و مدل پروبیت برای زیر مدل بقا برازش شد .نتایج آن با مدل توأم با زیرمدل طولی آمیخته مقایسه گردید .تحلیل دادهها در نرمافزار آماری R نسخه ۳ .۴. ۳ انجام شد .یافتهها :داشتن منبع عضو اهدایی از مرگ مغزی، سابقه دیالیز و سابقه تزریق خون قبل پیوند با خطر رخداد رد پیوند ارتباط دارد و باعث کاهش بقای کلیه پیوندی میشود .داشتن سابقه تزریق خون قبل پیوند(۰/۰۱۰۴)=p، روند افزایشی و مقدار بالای کراتینین، شانس رد پیوند را به طور معنی داری افزایش میدهد(۰/۰۰۰۱ .)>pنتیجهگیری :استفاده از تحلیل توأم به روش اسپلاین تاوانیده در مقایسه با مدل توأم با زیر مدل طولی آمیخته در دادههای پیوند کلیه نشان داد که مقدار خطای معیار براورد پارامترها در مدل توأم به روش اسپلاین تاوانیده کمتر از مدل توأم با مدل طولی آمیخته است .بعد از تعدیل متغیرهای سن،جنسیت، سابقه دیالیز و منبع عضو پیوندی، مشاهده گردید متغیرهای سابقه تزریق خون قبل پیوند، سطح کراتینین در آغاز فواصل زمانی و شیب زمانی کراتینین درون فواصل زمانی با احتمال بقای شرطی کلیه پیوندی درون همان فواصل ارتباط معنیداری دارند کلید واژهها :مدل پارامتری مشترک، رد پیوند، کراتینین، پیوند کلیه، مدل توأم طولی و بقا، اسپلاین، تاوانیده
Background and Objective: In some studies, information on time-to-event along with longitudinal marker were gathered. Separate models of longitudinal and survival cannot consider the dependence of these two response. An appropriate method for solving this problem is joint longitudinal and survival models. Different Sub-models of longitudinal and survival have been studied so far. This study was designed with the aim of applying the longitudinal and survival joint by a penalized spline in kidney transplant data. Materials and Methods: In this retrospective study, information of 165 recipients of renal transplant in Baqiyatallah Hospital (Tehran) from 2009 to 2016 were gathered from patients file. Available blood creatinine and the survival time of the transplant rejection were considered as responses. Joint longitudinal and survival model was fitted with penalazed nonparametric spline sub-model for longitudinal creatinine response and probit model for the survival sub-model and was compared joint model with mixed sub-model for longitudinal creatinine response. Data analysis was performed on R 3. 4.3. Results: the donation member of brain death, the dialysis history, and the blood transfusion history prior to transplantation were associated with the risk of the transplantation rejection and it causes the decreasing in maintaining the transplanted kidney. Blood transfusion history prior to transplantation (p=0.0104), increasing in trend of creatinine, and the high level of creatinine, increase the chance of transplantation rejection strongly significant (p=0.0001). Conclusion: The use of joint analysis by penalized spline in comparison with the joint model with mixed sub-longitudinal model showed that standard error is less. After adjusting age, gender, dialysis history prior to the transplantation and the source of the transplant, blood transfusion history, creatinine level at the beginning specific intervals, and the rate of creatinine change at specific intervals is significantly associated with the conditional survival of the kidney transplantation at the same intervals. Key Words: Shared Parameter Model, Transplant Rejection, Creatinine, Kidney Transplant, Longitudinal and Survival joint model, spline, Penalized
ba
Application of joint model for survival and longitudinal with penalized spline approach in medical data