عنوان

شناسایی واریانت‌های ژنی نادر اختلال طیف اوتیسم از نوع فامیلیال در ۵ خانواده در جمعیت آذری آذربایجان شرقی با روش توالی یابی کل اگزوم

IR

۲۷۳۵پ

فارسی

IR

شناسایی واریانت‌های ژنی نادر اختلال طیف اوتیسم از نوع فامیلیال در ۵ خانواده در جمعیت آذری آذربایجان شرقی با روش توالی یابی کل اگزوم

[پایان‌نامه]

Identification of rare genetic variants in Familial Autism Spectrum Disorder in five families from Azeri population in East Azarbaijan using Whole Exome Sequencing technique

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

، ۱۳۹۷

۲۰۷ص.

پیوست

چاپی

کارشناسی ارشد

ژنتیک انسانی Genetic))

۱۳۹۷/۰۷/۰۸

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

مقدمه و اهداف :اختلال طیف اوتیسم (ASD) با سه علامت اصلی شامل اختلال در تعامل و ارتباطات متقابل اجتماعی، الگوی رفتار تکراری و یا علایق محدود در اوایل دوران کودکی مشخص می‌شود .شیوع ASD در کودکان مذکر بیشتر از مونث است .اوتیسم به عنوان یک اختلال پیچیده رشد عصبی، به علت هتروژنی بالا، شدت و فنوتیپ‌های آن از یک بیمار به بیمار دیگر متفاوت است .ژنتیک نقش مهمی( ۶۲) در علل اوتیسم دارد .در این مطالعه، ما خانواده‌های ترک آذری دارای ASD فامیلیال را جهت شناسایی واریانت‌های ارثی احتمالی ایجاد کننده بیماری های مرتبط با ASD را مورد بررسی قرار دادیم .روش اجرا :ما افراد مبتلا به بیماری را کاریوتایپ کردیم تا مواردی که دارای اختلالات کروموزومی هستند را حذف کنیم .سپس، توالی یابی کل اگزوم (WES) را در پنج مورد از شکل فامیلیال ASD غیر سندرمی انجام دادیم .در مرحله بعد، با استفاده از روش توالی یابی سنگر آنالیزsegregation - coبرای ژن‌های نامزد در پروباند و دیگر افراد خانواده انجام دادیم .یافته ها :با استفاده از تکنیک توالی یابی کل اگزوم، ما سه واریانت احتمالی مسبب بیماری و مرتبط با فنوتیپ بیمار را در یک خانواده شناسایی کردیم .این سه واریانت از نوع بدمعنی و هوموزیگوت در ژنFBN ۱_(NM ۰۰۰۱۳۸c.G ۵۴۴۳A:p.G۱۸۱۵_S) TF (NM۰۰۱۰۶۳c.C ,۱۰۲۷T:p.R۳۴۳ W)وPLOD ۲_(NM ۱۸۲۹۴۳c.A ,۳۸۲G:p.K۱۲۸ E)قرار دارند .هر سه واریانت در اعضای خانوادهsegregate - coشدند و هر دو برادر مبتلا فنوتیپ‌های مرتبط با این سه واریانت را نشان می‌دهند .همچنین نقشه برداری ژنتیکی با استفاده از آرایه SNP یافته‌های ما را تایید کرد .نتیجه گیری :در این مطالعه، استفاده از تکنیک WES را در افراد مبتلا به بیماری های پیچیده و هتروژن نظیر اوتیسم را توصیف کردیم .از همه مهمتر نشان دادیم زمانی که فنوتیپ پیچیده است، WES می‌تواند تعداد قابل توجهی از واریانت‌های مربوطه را شناسایی کند که نشان دهنده فنوتیپ رشد عصبی و سایر فنوتیپ‌های حاضر در بیماران است .با این حال، استفاده از خانواده‌های بزرگ با چندین فرد مبتلا می‌تواند در شناسایی واریانت‌ها مسبب چنین بیماری‌های هتروژن و پیچیده مفید باشد .کلید واژه‌ها :اختلال طیف اوتیسم،FBN ۱،PLOD ۲،TF ، SNPژنوتایپینگ، توالی یابی کل اگزوم

Introduction and Objectives: Autism spectrum disorder (ASD) is characterized by three core symptoms with impaired reciprocal social interaction and communication, a pattern of repetitive behavior and/or restricted interests in early childhood. The prevalence is higher in male children than in female children. As a complex neurodevelopmental disorder, the phenotype and severity of autism are extremely heterogeneous with differences from one patient to another. Genetics has a key role (62 ) in the etiology of autism. In this study, we investigated Azeri Turkish families with familial ASD to identify possible inherited disease-causing variants related to ASD. Methods: We karyotyped the affected individuals in order to exclude the cases having chromosomal abnormalities. Then, we carried out whole exome sequencing (WES) in the five familial form of the non-syndromic ASD cases and implemented co-segregation analysis for the candidate genes in the proband and other individuals of the families using Sanger sequencing. Results: Using whole exome sequencing technique, we identified three possible causative variants in one family. These three homozygous missense variants NM_000138 c.G5443A:p.G1815S, NM_001063 c.C1027T:p.R343W and NM_182943 c.A382G:p.K128E lie in FBN1, TF and PLOD2 genes, respectively. All of the variants co-segregated in the family and both affected siblings manifest the phenotypes associated with these three variants. Homozygosity mapping using SNP array also confirmed our findings. Conclusions: Our study highlights the utility of WES in individuals of highly heterogeneous complex disease like autism. Importantly, we showed that when the phenotype is complex, WES can help identifing towards relevant variants that explain neurodevelopmental and other phenotypes of patients. However, larger family sibs with affected branch family members can be of benefit in narrowing down the causative variants in such heterogeneous and complex disorders. Keywords: Autism spectrum disorder, FBN1, PLOD2, TF, SNP genotyping, whole exome sequencin

ba

Identification of rare genetic variants in Familial Autism Spectrum Disorder in five families from Azeri population in East Azarbaijan using Whole Exome Sequencing technique

Autism spectrum disorder

اختلال طیف اوتیسم

Autism spectrum disorder

فرج زاده ولیلو، سعید

Farajzadeh Valilou,Saeed

بهجتی، فرخنده

کروزبی، اندر

شفقتی، یوسف

علوی، آفاق

ایران

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

2735t.pdf

محرمانه

محرمانه

2735t.pdf

6406088

مرجع

متن

0

۵۳۷۲پ

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y