بررسی عملکردی ناحیه ی) 7kb از SNP rs6706648 تا SNP rs6545816) در enhancer ژن BCL11A با استفاده از سیستمCas9 - CRISPRدر سلول هایK562
[پایاننامه]
Functional Analysis of the 7kb region (from SNP rs6706648 to SNP rs6545816) in the BCL11A Enhancer by Using the CRISPR-Cas9 System in K562 Cells
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
، ۱۳۹۵
ک،۱۲۴ص.
چاپی
کارشناسی ارشد
ژنتیک انسانیGenetics
۱۳۹۵/۱۲/۱۴
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
در مطالعه ی پیشین مرکز تحقیقات ژنتیک نشان داده شد که هاپلوتایپ شاملSNP (rs4671393 5 ،rs1427407 ، و rs766432 که هر کدام با پاسخ به داروی هیدروکسی اوره همراهی نشان می دهند و دو SNP مجاو rs6545816 و rs6706648 با پاسخ به دارو در ارتباط نبودند (با پاسخ به داروی هیدروکسی اوره در بیماران بتاتالاسمی وابسته به تزریق همراهی نشان می دهد .(OR=20.3, p<0.01) (n=81) این هاپلوتایپ یک ناحیه ی7 کیلوبازی را شامل میشود و در enhancer ژن BCL11A قرار دارد .در این مطالعه با استفاده از سیستمCas9 - CRISPRاین ناحیه ی7 کیلوبازی در سلول های K562 حذف شد و نشان داده شد که در سلول هایی که این ناحیه در آنها حذف شده بود، بیان ژن BCL11A 95 کاهش یافته است .(p<0.001) یافته های این مطالعه نشان می دهد که این ناحیه7 کیلوبازی نقش اساسی در بیان ژن BCL11A و همچنین پاسخ به داروی هیدروکسی اوره در بیماران بتا تالاسمی داراست .کلیدواژه ها :بتاتالاسمی، BCL11A ، هیدروکسی اوره ،Cas9 - CRISPR، K562
Previous study of GRC demonstrated that a haplotype harboring the rs1427407, rs766432, and rs4671393 SNP minor alleles (termed +++), and flanked by rs6545816 and rs6706648 located in the BCL11A enhancer , correlates significantly with the HU-response in a cohort of - thalassemia patients (n=81) (OR=20.3, p<0.01). This study showed that deletion of this haplotype (7kb) by CRISPR/Cas9 in K562 erythroid cells resulted in 95 (p<0.001) reduction in BCL11A transcript levels. our data suggest an essential role for this LD block in both BCL11A expression levels and the response to HU in - thalassemia patients. Key words: - thalassemia , BCL11A, Hydroxyurea, CRISPR-Cas9, K562
ba
Functional Analysis of the 7kb region (from SNP rs6706648 to SNP rs6545816) in the BCL11A Enhancer by Using the CRISPR-Cas9 System in K562 Cells