عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
IR
۲۳۰۴پ
فارسی
IR
بررسی تمایل اتصال فاکتور نسخه برداری RUNX1 به توالی پالیندرومی 5HS4 در ناحیه ی تنظیم لوکوس بتا
[پایان‌نامه]
Assaying the binding affinity of RUNX1 transcription factor to the palindromic sequence of 5HS4 in Beta globin locus control region
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
، ۱۳۹۵
ح،۷۰ص.
چاپی
کارشناسی ارشد
ژنتیک Genetics
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))
فاکتور نسخه برداری RUNX1یکی از تنظیم کننده های اصلی در سیستم خونسازی می باشد .یکی از موتیف هایی که قبلا نشان داده شده به فاکتور نسخه برداری RUNX1 متصل می شود، با توالی ناحیه پلی مورفیک پالیندرومی5HS4 (TGGG(G/A)CCCCA) - LCRکه حاوی پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) rs16912979 در مرکز پالیندروم است ، همپوشانی دارد .درمطالعات قبلی انجام شده در مرکز نشان داده شده که این پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی در عدم تعادل پیوستگی باHBG2 - Xmn1می باشد و با میزان نیاز دریافت خون بیماران بتاتالاسمی ایرانی در ارتباط است .با این وجود، بررسی نقش پلی مورفیسم این ناحیه در تعدیل فنوتیپ نیاز به تحقیقات بیشتری دارد .بنابراین حضور موتیف متصل شونده به RUNX1 درون ناحیه پلی مورفیک پالیندرومی جالب است زیرا می تواند کلیدی برای شناخت این مکانیسم باشد .در این راستا در تحقیق حاضر به بررسی احتمال تعامل بین RUNX1 و ناحیه ی تنظیم لوکوس بتا گلوبین پرداخته شده است .در این تحقیق جهت نشان دادن تعامل RUNX1 و ناحیه ی تنظیم لوکوس بتا از روش EMSA استفاده شد .نتایج ما نشان دادند که یک الیگونوکلئوتید 29 بازی که نماینده ی ناحیه ی پلی مرفیک پالیندرومیLCR - 5HS4حاوی آلل A در مرکز پالیندروم است، می تواند با الیگونوکلئوتید توافقی RUNX1 که یک الیگونوکلئوتید 20 بازی است، در اتصال به این پروتئین رقابت کند .بنابراین در ادامه مطالعات بیشتر برای تایید تعاملات بینLCR - 5HS4حاوی تک نوکلوئوتید پلی مرف rs16912979 و همچنین بررسی اختصاصی بودن این تعامل به آلل پلی مرف برای درک تاثیرات فنوتیپی این SNP در بیماران تالاسمی پیشنهاد می شود .کلمات کلیدی بتا تالاسمی،HBG2- Xmn1، ناحیه ی تنظیم لوکوس بتا،
Transcription factor RUNX1 is a master regulator of haematopoiesis. One of the motifs that have been previously shown to bind RUNX1, overlaps with a sequence in 5HS4-LCR palindromic region, harboring the rs16912979 single nucleotide polymorphism (SNP) at its center. Previously, we have shown that this SNP is in linkage disequilibrium with Xmn1-HBG2 and is associated with blood transfusion requirements of the Iranian thalassemia patients. However, the phenotype modifying role for this SNP remained unknown. The presence of a RUNX1 binding motif within this palindromic polymorphic site could provide a clue for understanding this mechanism. In here we investigated the possibility of an interaction between RUNX1 and beta globin LCR by Electromobility Shifting Assay (EMSA). Our results showed that a 29 base pair oligonucleotide representing the 5HS4-LCR polymorphic palindromic region could compete with a 20 base pair oligonucleotide representing RUNX1 consensus sequence, in binding to this protein. Consequently, further studies are proposed to confirm interaction between 5HS4-LCR and RUNX, as well as determining the allele specificity of this interaction, which could have phenotypical implications in thalassemia patients. Keywords Betathalassemia, Xmn1-HBG2, Locus control region, 5HS4 LCR
ba
Assaying the binding affinity of RUNX1 transcription factor to the palindromic sequence of 5HS4 in Beta globin locus control region
Betathalassemia
بتالاسمی
Betathalassemia
قبانلو، سپیده
Ghobakhloo,Sepideh
نیشابوری، مریم
نجم آبادی، حسین
ایران
دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی
2304t.pdf
محرمانه
محرمانه
2304t.pdf
2019102
مرجع
متن
0
۴۰۳۲پ
محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی
نمایه‌سازی قبلی
چاپی-الکترونیکی
TF
1
a
Y
