عنوان

شناسایی ژن های عامل انواع مختلف بیماری دیستروفی عضلانی در 12 فرد مبتلا با تکنیک توالی یابی نسل بعدی

IR

۲۲۶۱پ

فارسی

IR

شناسایی ژن های عامل انواع مختلف بیماری دیستروفی عضلانی در 12 فرد مبتلا با تکنیک توالی یابی نسل بعدی

[پایان‌نامه]

Identification of the causative genes for different types of muscular dystrophy in 12 probands with next generation sequencing techniques

دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

، ۱۳۹۴

ر،۱۹۸ص.

پیوست

چاپی

کارشناسی ارشد

ژنتیک انسانی Genetic Human

دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

بیماری های عصبی-عضلانی یک گروه از اختلالات هتروژن پیشرونده هستند .از هر 3000 تا 4000 نوزادی که متولد شده یک نفر دچار یکی از بیماری های عصبی- عضلانی شده است .دیستروفی های عضلانی شایعترین فرم بیماری های عضلات می باشند .تظاهرات بالینی و شدت انواع مختلف دیستروفی عضلانی بسیار متفاوت، و اعم از میوپاتی خفیف تا نارسایی قلبی می باشد .از آنجا که تجانس و فنوتیپ بیماران با هم تداخل دارند، باید قبل از دریافت تشخیص بالینی و مولکولی، آزمایشات الکترومیوگرافی (EMG) و ایمونوهیستوشیمی (IHC) و بیوپسی عضلات و سطح کراتین کیناز بررسی شود .پیشرفت های اخیر در تکنولوژی تعیین توالی شناسایی تعداد زیادی ژن عامل بیماری با هزینه نسبتا کم و در مدت زمان کمتر را ممکن ساخته است .مواد و روش ها در این مطالعه 12 خانواده مشکوک به هتروژن ترین انواع دیستروفی عضلانی شامل LGMD و CMD و EMD بدون علل ژنتیکی شایع در ژنDMD افراد مذکر مشکوک به دوشن مورد بررسی قرار گرفتند .برای شناسایی جهش های تاثیرگذار در این خانواده ها، افراد مبتلا با استفاده از روش توالی یابی کل اگزون های 62 ژن شناخته شده در بیماری های دیستروفی عضلانی با استفاده از کیت Agilent SureSelect V4همراه با Illumina Hiseq 2000 آنالیز گردیدند .نتایج 9 جهش در ژن های(SGCA ،DYSF ،CAPN3 ، ISPD ،LAMA2، COL6A1، ( LMNAدر 9 خانواده شناسایی شد، شش جهش شناخته شده جدید می باشد .برای سه خانواده مشکوک به LGMD با استفاده از پانل 62 ژن مرتبط با بیماری های دیستروفی عضلانی نتوانستیم جهش عامل بیماری را شناسایی کنیم .این 3 خانواده با روش توالی یابی کل ژنوم ( Whole genome Sequencing) در حال بررسی می باشد .بحث با کاربرد روش WES می توان برای شناسایی جهش ها عامل بیماری هتروژن گامی رو به جلو برداشت، رویکرد مناسبتری برای ارتباط ژنوتیپ- فنوتیپ و تشخیص مولکولی سایر خانواده های مبتلا ارائه داد .کلمات کلیدی

Introduction: Neuromuscular disorders are a progressive heterogeneous group with considerable heterogeneity. The frequency of these diseases is one in 3000 to 4000 live births. Clinical demonstrations and severity of different types of muscular dystrophy are vary widely, ranging from mild myopathy to heart failure. Because of the heterogeneity and phenotypic demonstrations in patients before doing clinical diagnosis and appropriate molecular tests, Electromyography (EMG) and immunohistochemistry tests (IHC) and muscle biopsy and creatine kinase levels have been checked. Recent advances in sequencing technology by using next generation sequencing and microarrays, identified a large number gene in diseases with relatively low cost and in less time is possible. Materials and Methods: In this study, We ascertained the most heterogeneous types of muscular dystrophy, including 12 suspected family and CMD , LGMD without common genetic causes of DMD gene in males suspected of DMD that were examined. To identify the causal mutations in these families WES of all exons 62 known genes in muscular dystrophies was performed on affected individuals using Agilent SureSelect V4 exome enrichment kit combined with Illumina Hiseq2000 sequencing. Results: 9 mutations in genes (SGCA, DYSF, CAPN3, ISPD, LMNA, LAMA2, COL6A1), of which six were novel mutations. For three families suspected LGMD no causative mutations could be detected using a panel of 62 genes linked to muscular dystrophies. These 3 families are under study by Using whole-genome sequencing. Discussion: By using WES for identifying mutations responsible for heterogenous disease, we can obtain better understanding of the genotype-phenotype correlation and provide more focused approach for molecular diagnosis of other families who suffered from these diseases. Keywords: Muscular Dystrophy, LGMD, DMD, next generation sequencing, mutation detection, Iran.

ba

Identification of the causative genes for different types of muscular dystrophy in 12 probands with next generation sequencing techniques

Muscular Dystrophy

دیستروفی عضلانی

Muscular Dystrophy

کلهر، زهرا

Kalhor,Zahra

کهریزی، کیمیا

نجم آبادی، حسین

ایران

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

2261t.pdf

محرمانه

محرمانه

2261t.pdf

5774742

مرجع

متن

0

۱۶۲۲پ

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y