بررسی علل ژنتیکی ناشنوایی ارثی همراه با distal Renal Tubular Acidosis در ۱۰ خانواده ایرانی
[پایاننامه]
Investigation of Ggenetic Causes of Hereditary Hearing Loss associated with Distal Renal Tubular Acidosis in 10 Iranian Families
دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی
، ۱۳۹۲
۱۶۳ص
چاپی
کارشناسی ارشد
ژنتیک
دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی
مقدمه :نقص ناشنوایی به عنوان شایع ترین ناهنجاری حسی، 0 نوزاد از هر 011 تولد را درگیر میکند .تخمین زده می شود حداقل 01 موارد ناشنوایی پیش زبانی در اثر تغییرات ژنتیکی ایجاد می شود که از این میان 91 آن به صورت سندرمی می باشد .ناشنوایی حسی-عصبی ارثی همراه با اسیدوز لوله های کلیوی دیستال در اثر جهش در زیر واحدهای B1 و a4 پمپATPase -+ Hکه توسط ژن های001692) - ATP6V1B1(NMو020632) - ATP6V0A4(NMکد می شوند، ایجاد می گردد .پمپATPase -+ Hمسئول پایدار نگه داشتن همئوستازی اسید-باز در کلیه و ساک ارگانل های مختلف ازجمله سلول های جمع کننده اندولنفاتیک گوش داخلی می باشند .اسیدوز لوله های کلیوی دیستال با نقص در اسیدی سازی ادرار مشخص می گردد که این نقص باعث ایجاد نفروکلسینوزیز، نفرولیتیازیز، اسیدوز هایپرکلرمیک و ... می گردد .روش بررسی :در این مطالعه 21 خانواده با ناشنوایی حسی- عصبی همراه با Drta تایید شده، انتخاب شدند .پس از نمونه گیری و استخراج DNA نمونه ها، واکنش زنجیره ای پلیمرازی برای تکثیر ماده ژنتیکی افراد انجام شد .تعیین توالی با روش Sanger sequencing صورت گرفت و در نهایت آنالیز داده ها انجام شد .یافته ها :با بررسی مستقیم تعیین توالی یک جهش تغییر قالب در ژن ATP6V1B1 در دو فرد مبتلای غیروابسته به دست آمد .) P385fsX441 (همچنین در سه خانواده غیر وابسته دیگر جهش بدمعنی (missense) P346R در ژن ATP6V1B1 به دست آمد .تعیین توالی در یک خانواده یک تغییر نوکلئوتیدی جدید G>C منجر به جهش گزارش شده ی G78R را در ژن ATP6V1B1 نشان داد .همچنین یک تغییر نوکلئوتیدی a>g در جایگاه splice site اگزون 7 در یک خانواده مشاهده شد.این تغییر نوکلئوتیدی تاکنون گزارش نشده است .نتیجه گیری :مطالعه ما نشان می دهد که ژن ATP6V1B1 شایع ترین ژن ایجادکننده ناشنوایی همراه با dRTA می باشد لذا توانستیم در بیش از نیمی از خانواده ها جهش در این ژن را شناسایی کنیم .کلیدواژه:ناشنوایی ارثی، اسیدوز لوله های کلیوی دیستال، توالی یابی DNA ، ATP6V1B1 ، ATP6V0A4 ، ایران
intercalated cells of kidney and inner ear endolymphatic sac. DRTA is characterized by failure to urine acidification leading to nephrocalcinosis, nephrolithiasis, hyperchloraemic acidosis, hypercalciuria and hypocitraturia. Twelve unrelated Iranian families with confirmed hearing loss (HL) associated with dRTA have been referred to Genetics Research Center. DNA sequencing was performed for all families for all of the exons of the ATP6V1B1 and ATP6V0A4 genes. We identified a previously reported frame shift mutation (P385fsX441) in two of the families, which leads to a stop codon. A nucleotide substitution in exon 10 (P346R) of ATP6V1B1 gene identified in three other families. One patient was homozygous for a novel nucleotide substitution in exon 3: G>A lead to a known mutation (G78R). Also a novel splice site donor mutation in exon7 was observed in one family. Our report shows that ATP6V1B1 is the most prevalent gene causing HL associated with dRTA so we could detect the mutation in this gene in more than half of the studied families.Keywords: Hereditary hearing loss, dRTA, DNA sequencing, ATP6V1B1, ATP6V0A4, Iran-ع coding by ATP6V1B1 (NM-001692) and ATP6V0A4 (NM-020632) genes. H+_ATPase pumps are responsible for maintaining acid-base homeostasis in different organelles such as ت intercalated cells of kidney and inner ear endolymphatic sac. DRTA is characterized by failure to urine acidification leading to nephrocalcinosis, nephrolithiasis, hyperchloraemic acidosis, hypercalciuria and hypocitraturia. Twelve unrelated Iranian families with confirmed hearing loss (HL) associated with dRTA have been referred to Genetics Research Center. DNA sequencing was performed for all families for all of the exons of the ATP6V1B1 and ATP6V0A4 genes. We identified a previously reported frame shift mutation (P385fsX441) in two of the families, which leads to a stop codon. A nucleotide substitution in exon 10 (P346R) of ATP6V1B1 gene identified in three other families. One patient was homozygous for a novel nucleotide substitution in exon 3: G>A lead to a known mutation (G78R). Also a novel splice site donor mutation in exon7 was observed in one family. Our report shows that ATP6V1B1 is the most prevalent gene causing HL associated with dRTA so we coulHearing defect is the most common sensory disorder, affects 1 of every 500 newborns. At least 50 of pre-lingual HL is estimated to be caused by genetic changes with about 30 of genetic HL being syndromic. Hereditary sensorineural deafness associated with distal renal tubular acidosis (dRTA) is caused by mutation in B1 and a4 subunits of H+_ATPase pump-ع coding by ATP6V1B1 (NM-001692) and ATP6V0A4 (NM-020632) genes. H+_ATPase pumps are responsible for maintaining acid-base homeostasis in different organelles such as ت Hearing defect is the most common sensory disorder, affects 1 of every 500 newborns. At least 50 of pre-lingual HL is estimated to be caused by genetic changes with about 30 of genetic HL being syndromic. Hereditary sensorineural deafness associated with distal renal tubular acidosis (dRTA) is caused by mutation in B1 and a4 subunits of H+_ATPase pump
ba
Investigation of Ggenetic Causes of Hereditary Hearing Loss associated with Distal Renal Tubular Acidosis in 10 Iranian Families