بررسی علل ژنتیکی در ۸ خانواده مبتلا به سندرم میکروسفالی complex Deficiency۱۳۹۱-۱۳۹۲Adaptor Protein4
[پایاننامه]
Investigation of Genetic Causes of Microcephaly Syndrome: Adaptor Protein 4 Deficiency Syndrome in 8 Iranian Families (2012-2013)
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social welfare and Rehabilitation Sciences))
، ۱۳۹۲
۱۲۴ص.
پیوست
چاپی
کارشناسی ارشد
ژنتیک انسانی Human Genetic
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social welfare and Rehabilitation Sciences))
ناتوانی ذهنی رایج ترین ناهنجاری تکاملی در انسان است .شیوع این بیماری با در نظر گرفتن جمعیت های مختلف1 - 3می باشد .این بیماری به علل گوناگون از جمله عوامل محیطی و ژنتیکی ایجاد می شود، که عوامل ژنتیکی نقش بسزایی در ایجاد آن دارد .عقب ماندگی ذهنی به دو نوع سندرمی و غیرسندرمی تقسیم بندی می شود .در این تحقیق سعی بر آن است که علل ژنتیکی در خانواده های ایرانی که دارای فرزند یا فرزندان مبتلا به عقب ماندگی ذهنی سندرمی همراه با میکروسفالی با علائم شبیه به سندرم نقص کمپلکس Adaptor protein4 هستند،بررسی شود .روش بررسی :در این مطالعه از بین خانواده های ارجاع داده شده به مرکز تحقیقات ژنتیک که دارای فرزند یا فرزندان مبتلا به عقب ماندگی ذهنی سندرمی بودند، خانواده هایی که فرد مبتلا دارای علائم شبیه به سندرم نقص کمپلکس Adaptor protein 4 یعنی مبتلا به میکروسفالی، عقب ماندگی ذهنی شدید، فنوتیپ شبیه بیماران cerebral palsy و اتساع بطنی در نوار مغزی بود، انتخاب شدند .نمونه گیری از تمام افراد مبتلا، پدر، مادر و حداقل دو فرد سالم) در صورت وجود (صورت گرفت .پس از استخراج DNA نمونه ها، واکنش زنجیره ای پلیمرازی برای تکثیر ماده ژنتیکی افراد انجام شد .تعیین توالی با روش های Sanger sequencing و Next generation sequencing صورت گرفت و در نهایت آنالیز داده ها انجام شد .یافته ها :از 8 خانواده مورد بررسی، تغییر ژنتیکی در 2 خانواده شناسایی شد.در فرد مبتلای یک خانواده یک جهش گزارش شده در اگزون 7 ژن AP4M1 یافت شد .فرد مبتلای خانواده دیگر دارای یک جهش جدید در اگزون 4 همان ژن بود .در 6 خانواده دیگر، هیچ جهشی که موجب نقص عملکرد کمپلکس پروتئینی AP4 شود، یافت نشد .نتیجه گیری :با توجه به مقالات چاپ شده در سال های اخیر، تنها جهش در 4 ژن کدکننده 4 زیرواحد کمپلکس AP4 موجب ایجاد سندرم AP4 deficiency می شود .در کشور ما تا به حال 3 جهش فقط در یکی از این ژن ها یعنی AP4M1 پیدا شده است .این یافته شاید بیانگر این موضوع باشد که شیوع جهش در زیر واحد متوسط کمپلکس AP4 ، کدشونده توسط AP4M1 ، در جمعیت ایران شایع تر از جهش در سایر زیرواحدهای این کمپلکس می باشد .کلیدواژه :ناتوانی ذهنی، میکروسفالی، سندرم نقص کمپلکسAdaptor protein4 ،AP4M1 ، واکنش زنجیره ای پلیمرازی، توالی یابی، جمعیت ایران .
subunit of AP4, encoded by AP4M1, is more frequent than mutations in other subunits of AP4 in the Iranian population Key words: intellectual disability, microcephaly, adaptor protein 4 deficiency syndrome, mutation, AP4M1, polymerase chain reaction, sequencing, Iranian population ق Title: Investigation of Genetic Causes of Microcephaly Syndrome: Adaptor Protein 4 Deficiency Syndrome in 8 Iranian Families Introduction: Intellectual Disability (ID) is the most common developmental disorder in human, with a prevalence of 1-3 in different populations. Two causes of ID are: genetics and environment; genetics has an important role to create ID. Intellectual disability divides to syndromic ID and nonsyndromic ID. In this study we try to investigate genetic causes of syndromic ID, specifically Adaptor Protein 4 (AP4) deficiency syndrome, in Iranian families with one or more affected children. Methods: In this study, among the families referred to Genetics Research Center of University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences, those who have affected child/children with symptoms similar to AP4 deficiency syndrome which are microcephaly, severe ID, CP like phenotype and ventriculomegaly in brain MRI, were chosen. Sampling was performed for all of affected, parents and at least two healthy siblings if there were. After DNA extraction, polymerase chain reaction amplified genetic matter. To determining sequences, we used Sanger sequencing and next generation sequencing and then analyzed the data. Results: From 8 families, genetic changes were identified in 2 ones. In first family a reported substitution mutation was found in exon 7 of AP4M1 gene and in the other family a novel deletion of G was identified in exon 4 of the same gene. No more mutations were found in the remaining 6 families. Conclusion: According to the recent studies, only mutations in four AP4 subunit genes cause AP4 deficiency syndrome. In our country, three mutations have been found just in one subunit gene that is AP4M1. Our findings suggest that the incidence of mutations in the
ba
Investigation of Genetic Causes of Microcephaly Syndrome: Adaptor Protein 4 Deficiency Syndrome in 8 Iranian Families (2012-2013)