Measurement of the changes in lncRNA-HIT and lncRNA-XIST genes expression in cancerous lung tissue and evaluation of Chlamydia pneumoniae infection symptoms
Dissertation
Noor Muhsin Hadi
Natural Sciences
1401
81p.
cd
M.S.
Cellular and Molecular Biology
1401/04/04
Lung cancer, which in some sources is known as the most common cancer in the world, is one of the main areas of discussion in public health. The most well-known risk factor for this disease is tobacco, which despite knowing this fact, the rate of infection and death by this disease is still very high. In addition to this risk factor, other factors such as contaminants, genetic predispositions as well as chronic infections are known for this disease. Among these infections is the bacterium, which has a very high prevalence.Our goal in this study is to find out part of the molecular function involved in this type of cancer. Long non-coding RNAs have recently received a great deal of attention from researchers, especially in the field of genetics and oncology. Therefore, by studying different databases, we selected two genes, lncRNA-HIT and lncRNA-XIST, which may be associated with lung cancer. In order to measure their expression rate in cancerous tissue and marginal tissue, we used real-time PCR method.After taking samples and performing the process of RNA extraction from cancerous and marginal tissues, we employed the real-time PCR method to measure the expression of these two genes. In order to analyze the impact of Chlamydia pneumoniae infection, we also examined the samples for Chlamydia pneumoniae presence by serological methods.Results of this research show that both LncRNA-HIT and LncRNA-XIST has different expression rate in tumoral and marginal tissue. Also, there is significant relation between sex and expression rate of LncRNA-XIST as well as tumor size and LncRNA-HIT. No relation between presence of C. pneumoniae and expression of the studied genes were found.The results of this study can help us better understand the molecular function of lung cancer and give us new diagnostic and therapeutic goals. It also clarifies the role of the bacterial agent in the process of cancer.
چکیده: سرطان ریه که در برخی منابع به عنوان شایع ترین سرطان در جهان شناخته می شود، یکی از حوزه های اصلی بحث در بهداشت عمومی است. شناخته شده ترین عامل خطر برای این بیماری تنباکو است که با وجود آگاهی از این واقعیت، میزان ابتلا و مرگ و میر ناشی از این بیماری همچنان بسیار بالاست. علاوه بر این عامل خطر، عوامل دیگری مانند آلاینده ها، استعدادهای ژنتیکی و همچنین عفونت های مزمن برای این بیماری شناخته شده اند. از جمله این عفونت ها می توان به باکتری اشاره کرد که شیوع بسیار بالایی دارد.هدف ما در این مطالعه کشف بخشی از عملکرد مولکولی درگیر در این نوع سرطان است. اخیراً RNA های طولانی غیر کدکننده توجه زیادی از سوی محققان به ویژه در زمینه ژنتیک و انکولوژی جلب شده است. بنابراین، با مطالعه پایگاههای اطلاعاتی مختلف، دو ژن lncRNA-HIT و lncRNA-XIST را انتخاب کردیم که ممکن است با سرطان ریه مرتبط باشند. برای اندازه گیری میزان بیان آنها در بافت سرطانی و بافت حاشیه ای از روش Real-time PCR استفاده شد.پس از نمونه برداری و انجام فرآیند استخراج RNA از بافت های سرطانی و حاشیه ای، از روش Real-time PCR برای اندازه گیری بیان این دو ژن استفاده کردیم. به منظور تجزیه و تحلیل تاثیر عفونت کلامیدیا پنومونیه، نمونهها را از نظر حضور کلامیدیا پنومونیه نیز با روشهای سرولوژیکی بررسی کردیم.نتایج این تحقیق نشان می دهد که هم LncRNA-HIT و هم LncRNA-XIST میزان بیان متفاوتی در بافت تومورال و حاشیه دارند. همچنین بین جنس و میزان بیان LncRNA-XIST و اندازه تومور و LncRNA-HIT ارتباط معنی داری وجود دارد. ارتباطی بین حضور C. pneumoniae و بیان ژن های مورد مطالعه مشاهده نشد.نتایج این مطالعه می تواند به ما در درک بهتر عملکرد مولکولی سرطان ریه کمک کند و اهداف تشخیصی و درمانی جدیدی به ما بدهد. همچنین نقش عامل باکتریایی در روند سرطان را روشن می کند.
اندازه گیری تغییرات در بیان دو ژن lncRNA-HIT و lncRNA-XIST در بافت سرطانی ریه و ارزیابی اثرات آلودگی به باکتری Chlamydia pneumoniae