Analysis of H. pylori cagA and vacA promoter sequence in Iranian strains and their association gastrointestinal disease
Dissertation
Sajjad Alnajar
Natural science
1401
123p.
cd
Ph.D.
Animal Biology
1401/06/30
Background and Aims: Helicobacter pylori (H. pylori) is the main cause of various gastroduodenal diseases. It is estimated that app roximately, more than half of the adult population in developed countries and 90% of people in developing countries infected with H. pylori. H. pylori infection may be related to Genetic of virulence factors and environmental factors. The aim of this study was to assess of frequency cagA and vacA genes of H. pylori isolated from patients with gastrointestinal disorders.Materials and Methods: This cross-sectional descriptive study was conducted on 65 patients with gastrointestinal diseases (gastritis (75.38%), gastric ulcer (15.38%) and gastric cancer (9.23%)) who were hospitalized in Al-Zahra Hospital (Tabriz-Iran). After genomic DNA extraction, PCR was performed using H. pylori specific primers.Results: Phylogenetic analysis using cagA and vacA gene sequences showed four and three separate lineages, respectively. The gene lineage of 4 cagA genes showed a wide genetic diversity in comparison with the lineage of other lineages. Also, the strains with lineage 3 genotype of vacA gene showed a very high frequency compared to other lineages.Conclusion: According to the results of this study, it can be said that there are different lineages of H. pylori in Iran that have been created due to exchange with other geographical regions, which shows a strong evolutionary trend.
مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری عامل اصلی انواع بیماریهای گوارشی است. تخمین زده می¬شود که تقریباً بیش از نیمی از جمعیت بزرگسال در کشورهای توسعه یافته و 90 درصد از افراد در کشورهای در حال توسعه آلوده به هلیکوباکتر پیلوری هستند. عفونت هلیکوباکتر پیلوری ممکن است به ژنتیک فاکتورهای حدت و عوامل محیطی مرتبط باشد. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی ژنهای cagA و vacA هلیکوباکتر پیلوری جدا شده از بیماران مبتلا به اختلالات گوارشی بود.مواد و روشها: این مطالعه توصیفی مقطعی بر روی 65 بیمار مبتلا به بیماریهای گوارشی [(گاستریت (38/75%)، زخم معده (38/15%) و سرطان معده (23/9%)] بستری در بیمارستان الزهرا (س) تبریز انجام شد. پس از استخراج DNA ژنومی، PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی هلیکوباکتر پیلوری انجام شد. یافتهها: آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از توالیهای ژن cagA و vacA به ترتیب چهار و سه دودمان جداگانه را نشان داد. دودمان ژنی 4 مربوط به ژن cagA تنوع ژنتیکی وسیعی در مقایسه با سایر دودمان¬ها نشان داد. همچنین، سویههای دارای ژنوتیپ دودمان 3، ژن vacA نسبت به سایر دودمانها فراوانی بسیار بالایی داشتند.نتیجه گیری: با توجه به نتایج این مطالعه می¬توان گفت که دودمان¬های مختلفی از هلیکوباکتر پیلوری در ایران وجود دارد که به دلیل تبادل با سایر مناطق جغرافیایی ایجاد شده¬اند که روند تکاملی قوی را نشان می¬دهد.
بررسی توالی پروموتری ژن¬های cagA و vacA در سویه های ایرانی هلیکوباکتر پیلوری و ارتباط آنها با بیماری های گوارشی