بررسی بیان RNA ی غیرکدکننده بلند LINC00261 در بافتهای توموری و حاشیه توموری بیماران مبتلا به سرطان کولون
نگین چمنی هولاسو
علوم طبیعی(پردیس)
۱۴۰۱
۶۸ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
ژنتیک
۱۴۰۱/۰۵/۱۰
سرطان کلورکتال دومین علت شایع مرگ ناشی از سرطان در جهان می¬باشد. این سرطان معمولا با تشکیل تودههای کوچک و خوشخیمی به نام پولیپ در قسمت داخلی روده بزرگ آغاز میشود. تنظیم بیان ژنها از روندهای اساسی تنظیم کننده انواع مکانیسم¬های سلولی می¬باشد که تغییر در برخی از این روند¬¬ها می¬تواند سلول¬ها را دستخوش تکثیر کنترل نشده نماید. طیف گسترده¬ای از مولکول¬های دخیل در تنظیم بیان ژن وجود دارد که از میان آن¬ها مولکول¬های RNA غیر کد کننده طویل (lncRNAs) در تنظیم بیان ژن نقش بسزایی دارند. مطالعات نشان می¬دهد که lncRNAها در غربالگری، تشخیص، پیش آگاهی و نتایج درمانی می¬توانند دخیل باشند. از جمله این lncRNAها، lncRNA LINC00261می باشد. که با تولید یک RNA طولانی غیر کد کننده، به عنوان تنظیم کننده منفی رشد سلولی عمل کرده و می تواند تمایز و آپوپتوز را ترویج دهد. در این پژوهش میزان بیان ژن lncRNA LINC00261 در 47 بیمار مبتلا به سرطان کلورکتال و با استفاده از Real_Time PCR و همچنین ارتباط بین میزان بیان این ژن و علائم کلینیکی و پاتولوژیکی مبتلایان بررسی شد. طبق نتایج به دست آمده از آنالیز داده¬ها مشخص شد که میزان بیان ژن lncRNA LINC00261در بافتهای توموری نسبت به بافت حاشیه توموری کاهش یافته و میزان کاهش بیان این ژن ارتباط معناداری با علائم کیلینیکوپاتولوژیکی نشان نداده. منحنی ROC با اختصاصیت 68.09% و حساسیت 65.96% و مساحت زیر منحنی 0.67(AUC) به دست آمد.با توجه به کاهش معنی دار بیان ژن LINC00261در بافت توموری در مقایسه با بافت حاشیه توموری و نتایج به دست آمده از بررسی منحنی ROC،ژن LINC00261 را می توان به عنوان یکی از بیومارکرهای تشخیصی یا پیش بینی کننده برای سرطان کلورکتال در نظر گرفت.
Colorectal cancer is the second most common cause of cancer death in the world. This cancer usually begins with the formation of small and benign masses called polyps in the inner part of the large intestine. The regulation of gene expression is one of the basic processes that regulate all kinds of cellular mechanisms, and changes in some of these processes can cause cells to undergo uncontrolled proliferation. There is a wide range of molecules involved in gene expression regulation, among which long non-coding RNA molecules (lncRNAs) play a significant role in gene expression regulation. Studies show that lncRNAs can be involved in screening, diagnosis, prognosis and treatment results. Among these lncRNAs, lncRNA LINC00261 is. By producing a long non-coding RNA, it acts as a negative regulator of cell growth and can promote differentiation and apoptosis. In this study, the expression level of lncRNA LINC00261 gene in 47 patients with colorectal cancer was investigated using Real_Time PCR, as well as the relationship between the expression level of this gene and the clinical and pathological symptoms of the patients. According to the results obtained from the data analysis, it was found that the level of lncRNA LINC00261 gene expression in tumor tissues was decreased compared to tumor peripheral tissue and the decreased expression of this gene did not show a significant relationship with clinicopathological symptoms. The ROC curve was obtained with 68.09% specificity and 65.96% sensitivity and 0.67 area under the curve (AUC). Considering the significant decrease in LINC00261 gene expression in tumor tissue compared to the tumor margin tissue and the results obtained from examining the ROC curve, the gene LINC00261 can be considered as one of the diagnostic or predictive biomarkers for colorectal cancer.
Expression analysis of lncRNA LINC00261 in tumorous and marginal tissues of patients with colorectal cancer