پ۲۸۶۶۸
per
بررسی بیان lncRNA EMX2OS دربافت های توموری وحاشیه توموری بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال
سیده سپیده ایرانی پور
علوم طبیعی(پردیس)
۱۴۰۱
۷۴ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
ژنتیک
۱۴۰۱/۰۴/۱۴
سرطان کولورکتال(CRC) یکی از سرطان های شایع دستگاه گوارش بوده که22% تا 25% تمام سرطان‌ها را شامل می‌شود و دومین علت مرگ ناشی ازسرطان در اکثرکشورهای غربی است. این سرطان پس ازسرطان ریه وپستان، شایع‌ترین سرطان دربین زنان بوده ودر مردان پس ازسرطان ریه وپرستات رتبه‌ی سوم را دارد. با وجود تمامی پیشرفت‌های درمانی، بیماران مبتلا به این تومورکماکان برای ارتقای کیفیت زندگی خود با چالش‌های بزرگی روبه‌رو هستند. عوامل ژنتیکی در ایجاد سرطان نقش برجسته‌ای دارند که در این میان Lnc RNAها از مواردی می‌باشندکه درسال‌های اخیرتوجه پژوهشگران رابه خودجلب کرده‌اند. این مطالعه با هدف بررسی بیان ژنEMX2OS در افراد مبتلا بهCRC انجام شد. در این پژوهش50 نمونه‌ی توموری وحاشیه‌ی تومور ازبیمارانCRC جمع‌آوری گردید. سنتزcDNA بعداز استخراجRNA از نمونه‌ها به وسیله‌ی محلولTrizol انجام شد. سپس جهت بررسی میزان بیان ژن مذکور ازتکنیکReal Time PCR واز ژنU6 به عنوان ژن کنترل داخلی استفاده شد. داده‌های بدست آمده به کمک نرم‌افزارهای GraphPad Prism و SPSS با استفاده از آزمون t-test آنالیز گردید. بر این اساس میزان بیان ژنEMX2OS در نمونه‌های توموری نسبت به حاشیه‌ی تومور افزایش معنی‌داری مشاهده شد((P-value =0.0023. با این وجود در مقایسه‌ی میزان بیان ژنEMX2OS با مشخصات پاتوبیولوژیکی بیماران اختلاف معنی‌داری مشاهده نشد. منحنی ROC با اختصاصیت 74.5% و حساسیت 59.5% و مساحت زیر نمودار (AUC) 0.72 بدست آمد. با توجه به افزایش معنی دار بیان ژنEMX2OS در بافت توموری، درمقایسه با بافت حاشیه توموری ونتایج حاصل از بررسی منحنیROC، ژنEMX2OS را می‌توان به عنوان یکی از بیومارکرهاي تشخیصی یا پیش‌بینی کننده برایCRC استفاده کرد.
olorectal cancer is one of the most common cancers of the gastrointestinal tract, accounting for 22% to 25% of all cancers, and is the second leading cause of cancer death in most Western countries. It is the most common cancer among women after lung and breast cancer and is the third most common cancer in men after lung and prostate cancer. Despite all therapeutic advances, patients with this tumor still face great challenges in improving their quality of life. Genetic factors play a prominent role in the development of cancer, including Lnc RNAs, which have attracted the attention of researchers in recent years. The aim of this study was to investigate the expression of EMX2OS gene in people with CRC. In this study, 50 tumor samples and tumor margins were collected from CRC patients. CDNA synthesis was performed after extraction of RNA from the samples with Trizol solution. Then, to evaluate the expression of the gene, Real Time PCR and U6 gene were used as internal control genes. Data were analyzed using GraphPad Prism and SPSS software using t-test. Accordingly, the expression of EMX2OS gene in tumor samples was significantly increased compared to the tumor margin (P-value = 0.0023. However, there was no significant difference in the expression of EMX2OS gene with the pathobiological characteristics of patients. ROC curve with 74.5% specificity and sensitivity 59.5% and the area under the chart (AUC) was 0.72. Therefore, due to the significant increase in the expression of EMX2OS gene in tumor tissue, in comparison with tumor margin tissue and the results of ROC curve examination, EMX2OS gene can be used as one of the diagnostic or predictive biomarkers for CRC.
Expression analysis of lncRNA EMX2OS in tumorous and marginal tissues of patients with colorectal cancer
ایرانی پور،
سیده سپیده
تهیه کننده
خلج کندری،
حسینپور فيضی،
محمد
محمدعلی
استاد راهنما
استاد مشاور
تبریز
