عنوان

بررسی بیان RNA غیر کدکننده PCGEM1 و MIF-AS1 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال

پ۲۸۲۵۴

per

بررسی بیان RNA غیر کدکننده PCGEM1 و MIF-AS1 در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال

مهسا شیرعلی‌زاده

علوم طبیعی (پردیس دانشگاه تبریز)

۱۴۰۱

۸۳ص.

سی دی

کارشناسی ارشد

ژنتیک

۱۴۰۱/۰۶/۰۷

سرطان کولورکتال (CRC) یکی از شایع‌ترین سرطان‌ها در سراسر جهان است. بطوریکه به‌عنوان سومین سرطان شایع و چهارمین علت شایع مرگ‌ومیر ناشی از انواع سرطان‌ها در سراسر جهان شناخته می‌شود. این بیماری به دلیل رشد و تکثیر غیرطبیعی سلول‌ها اتفاق می‌افتد. این سلول‌ها می‌توانند به بافت‌های دیگر بدن انتشاریافته (متاستاز) یا در آن‌ها تکثیر یابد. سازمان بهداشت جهانی تخمین می‌زند که سالانه 945000 مورد جدید با 492000 مرگ‌ومیر رخ می‌دهد. در اکثر موارد CRC، عوامل ژنتیکی و محیطی در ایجاد بیماری دخیل هستند اما ارثی نیستند. در سرطان کولورکتال برخی از ناهنجاری‌های ژنتیکی و اپی‌ژنتیکی شناسایی شده است که عبارت‌اند از تغییرات در توالی DNA، تغییرات کروموزومی و تغییرات کروماتینی. LncRNAها به‌عنوان تنظیم‌کننده‌های کلیدی مسیرهای سرطان و همچنین به‌عنوان نشانگرهای زیستی بیماری ظاهر شده‌اند. LncRNA PCGEM1 و Lnc RNA MIF-AS در چند سال گذشته، به طور گسترده در سرطان‌های مختلف انسانی مطالعه شده اند. در مطالعه حاضر نیز ما به دنبال ارتباط بیان RNAغیر کدکننده PCGEM و MIF-AS1 در بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال بودیم. به این منظور، در مجموع 100 جفت بافت توموری و سالم از بیماران مبتلا به سرطان روده¬ی بزرگ نمونه برداری شد. از تمامی نمونه ها جداسازی RNA صورت گرفت و سنتز cDNA انجام شد .بیان LncRNA PCGEM1 و Lnc RNA MIF-AS توسط qRT-PCR اندازه¬گیری شد. علاوه بر این، نقش نشانگرهای زیستی lncRNAها و همچنین روابط بین بیان آنها و ویژگی‌های آسیب‌شناسی بالینی مورد بررسی قرار گرفت. داده¬های به¬دست آمده توسط آزمون t-test و به کمک نرم¬افزار¬های GraphPad Prisim و SPSS آنالیز شدند. براین اساس میان بیان ژن‌های مذکور در بافت‌های توموری نسبت به بافت حاشیه‌ای افزایش بیان معنی داری مشاهده گردید (P-value< 0.0001). با این وجود در مقایسه میزان بیان این ژن در دو گروه¬ سنی ، دو نوع مختلف سرطان کلورکتال ، در دو مکان مختلف (رکتوم و کولون)، درگیری غدد لنفاوی، عفونت ناشی از ویروس HPV ، در مردان و زنان، بر اساس مراحل مختلف تومور، تمایز توموردر نمونه های سرطانی و سالم حاشیه ای اختلاف معنی¬داری مشاهده نشد. نمودار ROC رسم شده برای ژن‌های PCGEM1 و MIF_AS1 به ترتیب مساحت زیر منحنی 68/0 و 69/0 را نشان داد. بنابراین با توجه به افزایش معنی¬دار بیان این ژن ها در بافت توموری در مقایسه با بافت سالم حاشیه توموری و نتایج حاصل از بررسی منحنی ROC، بنابراین PCGEM1 وMIF_AS1 می‌تواند به¬عنوان بیومارکر ضعیف در سرطان روده در نظر گرفته شود.

Colorectal cancer (CRC) is one of the most common type of cancers worldwide. It is the third most known cancer and the fourth most common cause of death from all types of cancer worldwide. This disease occurs due to the abnormal growth and proliferation of cells. These cells can spread to other tissues of the body (metastasize) or multiply in them. The World Health Organization estimates that 945,000 new cases occur annually, with 492,000 deaths. In most cases of CRC, genetic and environmental factors are involved in the development of the disease, but they are not hereditary. Some genetic and epigenetic abnormalities have been identified in colorectal cancer, which includes DNA sequence, chromosomal changes, and mutational changes. LncRNAs have emerged as key regulators of cancer pathways as well as disease biomarkers. LncRNA PCGEM1 and LncRNA MIF-AS have been specifically studied in various cancers in the past few years. In the present study, we also looked for the correlation between PCGEM1 and MIF-AS1 non-coding RNA expression in colon cancer patients. For this purpose, a total of 100 pairs of tumor and healthy tissues were sampled from patients with colon cancer. RNA was isolated from all the samples and cDNA was synthesized. The expression of LncRNA PCGEM1 and LncRNA MIF-AS was measured by qRT-PCR. In addition, the role of lncRNAs as biomarkers as well as the relationships between their expression and clinicopathological features were investigated. The obtained data were analyzed by t-test test and with the help of GraphPad Prisim and SPSS software. There was a significant increase in the expression of the mentioned genes in tumor tissue compared to the peripheral tissue (P-value < 0.0001). However, comparing the expression level of this gene in two age groups, different types of colorectal cancer, different locations (rectum and colon), involvement of lymph nodes, infection caused by HPV virus, their gender, cancer stages, and tumor differentiation, no significant difference was observed in cancer tissue compared to healthy marginal tissue. The ROC diagram drawn for PCGEM1 and MIF_AS1 genes showed the area under the curve of 0.68 and 0.69, respectively. In conclusion, according to the significant increase in the expression of these genes in the tumor tissue compared to the healthy tissue of the tumor margin, and considering the results of the ROC curve analysis, PCGEM1 and MIF_AS1 can act as weak biomarkers in colon cancer.

Investigation of Long non-coding RNA PCGEM1& MIF-AS1 Expression in patients with Colorectal cancer

‏شیرعلی‌زاده،

‏‏مهسا

تهیه کننده

‏صفرعلیزاده،

حسینپور فیضی،

‏‏رضا

‏ محمدعلی

استاد راهنما

استاد راهنما

‏تبریز