عنوان

چندشکلی ژن ‮‭BRCA۱‬ و ارتباط آن با بیماری ورم پستان درگاوهای هلشتاین,‮‭SF‬

‭۱۳۸۲۳پ‬

per

چندشکلی ژن ‮‭BRCA۱‬ و ارتباط آن با بیماری ورم پستان درگاوهای هلشتاین

‮‭SF‬

/مریم کرمی

: کشاورزی

، ‮‭۱۳۹۳‬

، راشدی

چاپی

کارشناسی ارشد

علوم دامی گرایش ژنتیک و اصلاح دام

‮‭۱۳۹۳/۱۱/۲۰‬

تبریز

در راستای انتخاب ژنتیکی علیه بیماری ورم پستان می توان از چند شکلی ژن های کاندیدا برای ارتباط آنها با صفات کمی و درک بهتر اثر آنها و همچنین استفاده از آنها در برنامه انتخاب به کمک" مارکر "بهره برد .در این مطالعه هدف بررسی ارتباط احتمالی بین چندشکلی های قطعه ای شامل ‮‭۲۱۹‬ جفت باز از اگزون شماره ‮‭۹‬ ژن ‮‭BRCA۱‬ به عنوان یک ژن کاندیدا) مارکر ژنی (مرتبط با صفت مقاومت به بیماری ورم پستان در گاوهای نژاد هلشتاین ایرانی بود .بدین منظور تعداد ‮‭۶۰‬رأس گاو هلشتاین واحد گاوداری صنعتی دشت آذرنگین آذربایجان شرقی بر اساس سوابق دفاتر بیماری این واحد گزینش شده و نمونه خون و نمونه شیرآنها جمع آوری شد .جهت برآورد شمار سلول های سوماتیک، نمونه های شیر به اداره جهاد کشاورزی تبریز انتقال داده شد .به منظور برآورد فراوانی آللی و ژنوتیپی چندشکلی های این جایگاه ژنی و همچنین بررسی ارتباط آن ها با صفت مقاومت به بیماری ورم پستان ، با استخراج ‮‭DNA‬ ژنومی از نمونه های خون در نهایت این جایگاه ژنی موجود در اگزون‮‭۹‬ ژن ‮‭BRCA۱‬ تعیین ژنوتیپ شد .الکتروفورز محصولات ‮‭PCR‬ بر اساس روش‮‭RFLP - PCR‬و توالی یابی منجر به شناسایی الگوهای باندهای متفاوت در جمعیت گاوهای مورد مطالعه گردید .درجمعیت مورد مطالعه فراوانی های آللی برای آلل های‮‭K‬ و ‮‭L‬این جایگاه ژنی به ترتیب برابر با ‮‭۴۸/۰‬ و ‮‭۵۲/۰‬و فراوانی ژنوتیپی‮‭KK‬ ،‮‭KL‬ ، ‮‭LL‬به ترتیب برابر‮‭۲۷/۰‬و‮‭۴۴/۰‬و ‮‭۲۹/۰‬با نرم افزار ‮‭۳۲ PopGene‬برآوردشدند .آنالیز خطی ارتباط ژنوتیپ های حاصل از ‮‭SNPs‬و شکم زایش با شمار سلول های سوماتیک به روش رگرسیون لجستیک نرم افزار ‮‭SAS‬ تفاوت معنی داری را بین ژنوتیپ ‮‭KK‬ با کاهش شمار سلول های سوماتیک شیر نشان داد .مقایسه میانگین اثر ژنوتیپ نشان داد که افرادی که دارای ژنوتیپ‮‭KL‬ و‮‭LL‬ هستند شمار سلول های سوماتیک شیر بیشتری داشتند (>‮‭(۰۵/۰ P‬و .(>‮‭(۰۱/۰P‬ مقایسه میانگین شکم زایش با شمار سلول های سوماتیک شیر نیز حاکی از آن بود که افراد شکم های زایش چهارم و پنجم و ششم و هفتم درصد سلول های سوماتیک بیشتری در مقایسه با افراد شکم زایش اول داشتند . (>‮‭(۰۵/۰ P‬مقدار هتروزیگوتی مشاهده شده و مورد انتظار برای این جایگاه به ترتیب‮‭۴۳/۰‬ و ‮‭۵۰/۰‬ به دست آمده است .آزمون مربع کای نشان داد که بین فراوانی های ژنوتیپی بین دو گروه سالم و بیمار اختلاف معنی دار وجود دارد که نشان دهنده رد فرض عدم اختلاف معنی دار در این جامعه است .نتایج ارتباط بین شکم زایش و شمار سلول های سوماتیک نشان داد که شکم های زایش چهارم و پنجم و ششم و هفتم با شمار سلول های سوماتیک معنی دار بود .‮‭(۰۱/۰

Candidate gene polymorphism is one of the potential approaches for search of association between SNP within this gene phenotype of animals, particularly in MAS for mastitis of large dairy cattle populations. In this aspect, the main objective of the present study was evaluation of current known polymorphism of the BRCA1 gene and its relationship with SCC data on Azar Nagin farm. For this purpose, 60 individuals of cows with history of measurement records for SCC were randomly selected and simultaneously in molecular study part, whole blood sample was collected from the jugular vein of animal and subsequent amplification of 219 PCR product within exon 9 was conducted using specific suitable primers and then each PCR p [products were treated with specific restriction enzymes for PCR-RFLP technique. Observe genotype frequencies for KK, KL, LL were 0.27,0.44 and 0.29 respectively, and allele frequencies for observed K and L allele were 0.48 and 0.52 accordingly. For analysis of variance, normality test and transformation of raw data for SSC records was performed based on previous main reports and literature reviews.GLM and logistic regression methods was used for association study between genotype and collected phenotype and those results was significantly different on genotype was followed in Duncan post-hoc. As a final message of the present report, KK genotype was showed significantly affect SCC data and has tendency for low SCC score than other two genotypes. Perhaps using high number of individuals and investigation of polymorphism on other candidate genes could help to reach high accuracy test for identification of resistant and susceptible animals for mastitis disease.