تعیین پروفایل و بیان lncRNAهای مرتبط با سرطان در بافتهای توموری و حاشیه توموری بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال جمعیت شمالغرب ایران
مینا خواجه دهی
علوم طبیعی
۱۴۰۱
۱۰۱ص.
سی دی
دکتری
زیست شناسی گرايش ژنتیک مولکولی
۱۴۰۱/۰۴/۰۱
نقش گسترده lncRNAها در تنظیم فرایندهای مختلف سلولی، اختلالات بیانی آنها را در شروع و پیشروی بیماری¬های مختلف از جمله سرطان، مورد توجه ویژه¬ای قرار می¬دهد. تغییرات بیانی این مولکول¬های تنظیمی در شناسایی و ارائه نشانگرهای زیستی مناسب برای تشخیص و پیش¬آگهی سرطان¬های مختلف از جمله سرطان کلورکتال، به عنوان یکی از رایج¬ترین و بدخیم¬ترین نوع تومورها، اهمیت بسیاری دارد. در مرحله گزینشی مطالعه حاضر، با استفاده از آرایه q-PCR پروفایلر lncRNAهای انسانی مخصوص شرکت SBI و با در نظر گرفتن معیارهایی همچون شدت افزایش بیان، میزان معنی¬داری و عدم مطالعه قبلی در سرطان کلورکتال، چهار lncRNA شامل HAR1B، KRASP1، JPX و SNHG4 از میان 90 lncRNA مرتبط با سرطان برای بررسی¬های بیشتر در مرحله تائیدی انتخاب گردید. از این بین، افزایش بیان سه lncRNA شامل HAR1B، JPX و SNHG4 و توانایی آنها در تمییز بین بافت¬های توموری، پولیپ¬های آدنومای کلورکتال و نمونه¬های حاشیه¬ای این بافت¬ها در کل نمونه¬ها، مورد تایید قرار گرفت. در ادامه تحقیق، بر اساس بررسی¬های بیوانفورماتیکی، ارتباطی مابین این سه lncRNA با برخی میکروRNAهای مهارگر تومور برقرار شد که در کل پیش¬بینی می¬شود از طریق تاثیر بر مسیرهای مرتبط با FoxO، ErbB و متابولیسم کولین در پیشروی سرطان کلورکتال درگیر باشند. در ادامه، مطالعات سلولی در مورد SNHG4، خاصیت تومورزایی این lncRNA را متاثر از اهمیت آن در تحریک مهاجرت و چرخه سلولی و ممانعت از مرگ سلولی به ویژه کنترل بروز آپوپتوز اولیه نشان داد.
The widespread role of lncRNAs in regulating various cellular processes draws much attention to their expression disorders in the onset and progression of multiple diseases, including cancer. Changes in the expression level of these regulatory molecules have great importance in identifying and providing appropriate biomarkers for the diagnosis and prognosis of various cancers, including colorectal cancer, as one of the most common and malignant types of tumors. In the exploratory phase of this study, four lncRNAs, including HAR1B, KRASP1, JPX, and SNHG4, were selected from 90 cancer-associated lncRNAs for further confirmatory testing. For this purpose, the Human LncProfiler qPCR Array from SBI company and some criteria such as the severity of expression, significance, and lack of the previous study in colorectal cancer were exploited. Among those, increased expression of three lncRNAs, including HAR1B, JPX, and SNHG4, and their ability to differentiate between tumor tissues, adenomatous colorectal polyps, and their marginal samples were confirmed, in all specimens. Further research, based on bioinformatics studies, linked these three lncRNAs to some tumor suppressor microRNAs, predicted to be involved in the progression of colorectal cancer by influencing pathways related to FoxO, ErbB, and choline metabolism. Subsequently, cellular studies on SNHG4 showed that the tumorigenicity of this lncRNA is due to its importance in stimulating migration and cell cycle progression and inhibiting cell death, especially by controlling the onset of primary apoptosis.
Cancer-related lncRNA profiling and expression analysis in tumoral and marginal tissues of patients with colorectal cancer from northwest of Iran