پ۲۶۰۹۲
per
بررسی بیان RNA غیر کد کننده linc-POU3F3 در سرطان معده
الهه ملک عباسلو
علوم طبیعی
۱۴۰۰
۷۱ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
زیست شناسی گرایش سلولی مولکولی
۱۴۰۰/۰۹/۲۲
سرطان معده چهارمین سرطان شایع در جهان و سومین علت اصلی مرگ در اثر سرطان است. مطالعات انجام شده حاکی از نقش مهم RNAهای بلند غیر کد کننده در پیشرفت سرطان می¬باشد. همچنین در سال¬های اخیر طی چندین مطالعه به این نتیجه رسیدند که lncRNA¬ها می¬توانند به¬عنوان بیومارکر و تنظیم کننده¬های مهمی در متاستاز و تومورزایی در سرطان معده معرفی شوند. Linc-POU3F3 در سرطان¬های مختلفی از جمله کبد، روده، گلیوما و سرطان سلول¬های سنگفرشی مری مورد بررسی قرار گرفته و نقش آن به¬عنوان انکوژن مشخص شده است. هدف مطالعه¬ی حاضر مقایسه میزان بیان ژن Linc-POU3F3 در سلول¬های تومور و حاشیه تومور سرطان معده بود. علاوه بر این میزان بیان این ژن در زنان و مردان، گروه¬های مختلف سنی، نوع روده¬ای و منتشر سرطان معده، سایز¬های مختلف تومور، عفونت ناشی از هلیکوباکترپیلوری در بیماران سرطانی و درگیری غددلنفاوی در سرطان معده مورد مطالعه قرار گرفت. برای این منظور، نمونه¬های توموری و سالم حاشیه توموری از 100 بیمار مبتلا به سرطان معده از بیمارستان ولیعصر تبریز جمع¬آوری شد. RNA نمونه¬ها به کمک محلول Trizol استخراج شد و پس از سنتز cDNA، آزمایش qRT- PCR برای مقایسه¬ی میزان بیان ژن در دو گروه از نمونه¬ها انجام گرفت. مقایسه¬ی میزان بیان این ژن در زنان و مردان، دو گروه¬ سنی بالای 50 و پایین 50 سال، نوع روده¬ای و منتشر سرطان معده، سایز¬های مختلف تومور، عفونت ناشی از هلیکوباکترپیلوری در بیماران سرطانی و درگیری غدد لنفاوی در سرطان معده نیز صورت پذیرفت. داده¬های به-دست آمده توسط آزمون t و به کمک نرم¬افزار¬های GraphPad Prisim و SPSS آنالیز شدند. براین اساس افزایش معنی¬دار میزان بیان ژن Linc-POU3F3 در سلول¬های سرطانی نسبت به سلول¬های نرمال حاشیه تومور مشاهده شد (P-value< 0.0001). با وجود این در مقایسه میزان بیان این ژن درسایر موارد اختلاف معنی¬داری مشاهده نشد. بررسی منحنی ROC نیز، اختصاصیت 91%، حساسیت 73%، و AUC 93% را نشان داد. بنابراین با توجه به افزایش معنی¬دار بیان Linc-POU3F3 در بافت توموری در مقایسه با بافت سالم حاشیه توموری و نتایج حاصل از بررسی منحنی ROC، ژن Linc-POU3F3 می¬تواند به ¬عنوان یک انکوژن در سرطان معده و محصول آن یک بیومارکر تشخیصی در این بیماری باشد.
AbstractGastric cancer is the fourth most common cancer worldwide and the third leading cause of cancer death. Previous studies have shown the important role of long non-coding RNAs in cancer progression. Also, several studies have shown that lncRNAs having important role in metastasis and tumorigenesis in gastric cancer, can be introduced as biomarkers. linc-POU3F3 has been studied in various cancers, including liver, clorectal, glioma, and esophageal squamous cell carcinoma, and its role as an oncogene has been identified. The aim of this study was to evaluate the expression of Linc-POU3F3 gene in tumor and normal cells. In addition, the expression of this gene was studied in men and women, different age groups, type of intestinal and diffuse gastric cancer, different tumor sizes, Helicobacter pylori infection in cancer patients and lymph node involvement in gastric cancer. In order to investigate of linc-POU3F3 gene expression in gastric cancer, tumor and healthy margin tissues were collected from 100 patients with gastric cancer from Valiasr Hospital in Tabriz. RNA of the samples were extracted using Trizol solution and after synthesis, real-time PCR was performed to compare the level of gene expression in tumor and normal tumor margin samples. Data were analyzed by T-test using GraphPad Prisim and SPSS softwares. Based on the results, a significant increase of Linc-POU3F3 gene expression was observed in tumor tissue compared to normal tumor margin cells (P-value <0.0001). However, there was not significant difference in expression of this gene between men and women, two age groups older and younger than 50, two type of gastric cancer including intestinal and diffuse, different tumor sizes, Helicobacter pylori infection in cancer patients and lymph node involvement in gastric cancer. Analysis of ROC curve showed 91% specificity, 73% sensitivity, and 93% AUC. Due to significant increase of Linc-POU3F3 gene expression in tumor cells compared to normal tumor margin cells, the Linc-POU3F3 gene can be introduce as an oncogenic agent and important biomarker in gastric cancer.
Investigation of Long non-coding RNA POU3F3 Expression in Gastric cancer
ملک عباسلو،
الهه
تهيه کننده
فرساد اختر،
صفرعلیزاده،
هاشم زاده،
نادر
رضا
شهریار
استاد راهنما
استاد راهنما
استاد مشاور
تبریز
