پ۲۶۰۴۶
per
بررسی بیان ژن RNA بلند غیر کدکننده BANCR در بافت توموری و حاشیه غیرتوموری بیماران مبتلا به سرطان معده
رها نیکان‌فر
علوم طبیعی
۱۴۰۰
۸۷ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
ژنتیک
۱۴۰۰/۱۰/۱۳
چکیده: سرطان معده؛ پنجمین سرطان شایع و چهارمین علت مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است. همچنین سرطان معده، شایع‌ترین سرطان در مردان و سومین سرطان شایع در زنان استان آذربایجان شرقی است. به علت اینکه اغلب بیماران با بیماری پیشرفته مراجعه می‌کنند، پیش آگهی این بیماران نامطلوب باقی مانده است. بنابراین شناسایی بیومارکرهای جدید که با پیش آگهی و تشخیص زودرس و بهبود درمان این بیماران ارتباط داشته باشد، ضروری است. lnc RNAها، در ایجاد و پیشرفت انواع سرطان نقش دارند. بنابراین می‌توانند بعنوان یک شاخص مناسب تشخیصی و درمانی در سرطان استفاده شوند. مطالعات زیادی نشان داده است که BANCR که یک lnc RNA به طول bp 693 است، در انواع مختلف سرطان انسان اختلال تنظیم پیدا می‌کند که جهت این اختلال، اختصاصی هر بافت می‌باشد که در آن BANCR می‌تواند بعنوان یک اونکوژن یا ژن مهار کننده‌ی تومور باشد. در تعدادی از مطالعات، تفاوت در میزان بیان ژن BANCR در بافت‌های سرطانی مختلف، در مقایسه با بافت‌های حاشیه‌ای غیرتوموری بررسی شده است. با توجه به این که مطالعات و تعداد نمونه‌ها در سرطان معده کم می‌باشد، نیاز به تحقیقات بیشتر در این زمینه وجود دارد. این مطالعه با هدف آنالیز و مقایسه بیان ژن BANCR در بافت توموری و نرمال حاشیه تومور افراد مبتلا به سرطان معده انجام شد.مواد و روش‌ها: در این مطالعه، 100 جفت از نمونه‌های توموری و نرمال حاشیه توموری بیماران مبتلا به سرطان معده تهیه و پس از استخراج RNA، سنتز cDNA از تمامی نمونه‌ها انجام شده و برای بررسی تفاوت در میزان بیان ژن BANCR از تکنیک Real time PCR استفاده شده است. در نهایت آزمون‌های Mann-Whitney و Independent sample test توسط نرم‌افزارهای SPSS و Graphpad برای آنالیز داده‌های بیان ژن و همچنین تست ROC برای ارزیابی عملکرد ژن مورد نظر بعنوان بیومارکر انجام گردیده است.یافته‌ها: طبق نتایج بدست آمده از آنالیز بیان ژن، افزایش بیان، معنادار BANCR در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان معده در مقایسه با بافت‌های نرمال حاشیه تومور، مشاهده شد. (0001/0pvalue<) پس از آنالیز داده‌ها برای منحنی ROC، مقدار AUC، حساسیت و اختصاصیت ژن BANCR به ترتیب 67/0، 60%، 56% تعیین شد.نتیجه‌گیری: با توجه به افزایش قابل توجه بیان ژن BANCR در بافت‌های توموری سرطان معده نسبت به بافت‌های حاشیه‌ی غیرتوموری، می‌توان نتیجه گرفت که ممکن است BANCR بعنوان یک اونکوژن در سرطان معده نقش داشته باشد..
Abstract: Background: Gastric cancer is thefifth most common malignancy and the fourth cause of cancer related deaths in the world. It's also the most common cancer of men and third common cancer in women in east Azerbaijan province of Iran. Since it is detected late in most patients, the prognosis remains poor. Thus, it is necessary to find new biomarkers, related to prognosis, early diagnosis and cure in these patients. Long non- coding RANs (Lnc RNAs) play a role in emergence and progress of cancers, so they can be used as an appropriate indicator for diagnosis and treatment of malignancy. Several studies have shown that BANCR- a Lnc RNA with 693 bp length- is disregulated in different types of human malignancies either as an oncogene or as a tumor suppressor which is specific for each tissue. In some studies, the difference of BANCR gene expression between various tumoral tissues and marginal non tumoral tissues have been evaluated. Considering the few number of specimens and studies in gastric cancer, more research in this field is needed. This study is done with the aim of analysis and comparison of BANCR expression in tumoral and non- tumoral tissues in patients with gastric cancer.Materials and methods: In this study 100 pairs of tumoral and non- tumoral tissues of gastric cancer patients were prepared and after RNA extraction, CDNA synthesis was done for all specimens for evaluation of differences of BANCR gene expression real time- PCR technique was used. Finally independent sample test and Mann- whitney test were done via SPSS and Graphpad softwares for data analysis of gene expression. Also ROC test was done for evaluation of the gene function as a biomarker.Results: According to data analysis of gene expression, increased BANCR expression in tumoral tissues of gastric cancer patients comparing to non- tumoral marginal tissues was observed which was statistically signi ficant. (p value < 0.0001) ROC curve analysis showed AUC and BANCR gene sensitivity and specificity to be 0.67, 60% and 56% respectively.Conclusion: significant increase of considering BANCR gene expression in tumoral tissues compared to non- tumoral tissues of gastric cancer patients, it can be concluded that BANCR may play a role as an oncogene in gastric cancer.
Study of Lnc RNA BANCR gene expression in tumor tissue and marginal non- tumor tissue of Gastric cancer patients
نیکان‌فر،
رها
تهيه کننده
صفرعلیزاده،
برادران،
هاشم‌زاده،
رضا
بهزاد
شهریار
استاد راهنما
استاد مشاور
استاد مشاور
تبریز
