پ۲۶۰۹۳
per
بررسی بیان ژن RNA بلند غیر کد کننده CASC21 در بافت توموری و حاشیه غیر توموری بیماران مبتلا به سرطان معده
آیدا هوشمند
علوم طبیعی(پردیس)
۱۴۰۰
۷۵ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
ژنتیک
۱۴۰۰/۰۶/۳۱
سرطان معده چهارمین سرطان شایع و دومین علت مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است. مطالعات متععدی نشان داده اند که RNA های بلند غیر کد کننده که طولی بیش از 200 نوکلئوتید دارند، نقش مهمی در پیشرفت سرطان دارند. همچنین مطالعاتی در سال های اخیر نشان داده است که RNA های بلند غیرکد کننده (lncRNA) با تنظیم متاستاز و آنژیوژنز در پیشرفت سرطان معده شرکت می کنند. با وجود اینکه نقش CASC21 در برخی از سرطان ها مشخص شده است ، با این حال هنوز نقش و مکانیسم آن در سرطان معده ناشناخته باقی مانده است. در مطالعه حاضر، هدف ما آنالیز و مقایسه بیان ژن lncRNA CASC21 در بافت توموری و نرمال حاشیه تومور در افراد مبتلا به سرطان معده است.مواد و روش ها: در این مطالعه میزان بیان ژن LncRNA CASC21 در 100 جفت نمونه ی بافت توموری و نرمال حاشیه تومور سرطان معده پس از استخراج RNA و سپس سنتز cDNA با استفاده از تکنیک Real-time PCR مورد بررسی قرارگرفته است. درنهایت آزمون های Independent Sample Test و Mann-Whitney توسط نرم افزار های Graphpad و SPSS برای آنالیز داده های بیان ژن و تست ROC به منظور ارزیابی عملکرد ژن مورد نظر به عنوان بیومارکر انجام شده است.یافته ها: بر اساس نتایج بدست آمده از آنالیز بیان ژن، افزایش بیان معنا دار CASC21 در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان معده در مقایسه با بافت نرمال حاشیه توموری مشاهده شد (p-value < 0.0001). همچنین بررسی ارتباط بین تغییرات بیان ژن CASC21 در نمونه های توموری سرطان پس از انجام آنالیز داده ها برای منحنی ROC، اختصاصیت، حساسیت و مقدار AUC ژن CASC21 به ترتیب 60%، 59% و 70% تعیین شد.نتیجه گیری: با توجه به افزایش بیان قابل توجه CASC21 در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان معده نسبت به بافت نرمال حاشیه توموری، ممکن است ژن CASC21 بتواند به عنوان یک lncRNA انکوژن در سرطان معده در نظر گرفته شود. به علاوه، بررسی های بیشتری برای معرفی کردن ژن CASC21 به عنوان یک بیومارکر در تشخیص بین توموری بودن و توموری نبودن بافت سرطان معده نیاز است.
AbstractGastric cancer is the fourth most common cancer and the second leading cause of cancer death in the world. Numerous studies have shown that long non-coding RNAs with a length of more than 200 nucleotides play an important role in cancer progression. Studies in recent years have also shown that long non-coding RNAs (lncRNAs) contribute to the progression of gastric cancer by regulating metastasis and angiogenesis. Although the role of CASC21 in some cancers has been identified, its role and mechanism in gastric cancer remains unknown. In the present study, we aimed to analyze and compare the expression of CASC21 lncRNA gene in tumor tissue and normal tumor margins in patients with gastric cancer.Materials and methodsIn this study, the expression level of LncRNA CASC21 gene in 100 pairs of tumor tissue samples and normal gastric cancer tumor margins after RNA extraction and then cDNA synthesis was investigated using real-time PCR technique. Finally, Independent Sample Test and Mann-Whitney tests were performed by Graphpad and SPSS software to analyze gene expression data and ROC test to evaluate the function of the gene as a biomarker.ResultBased on the results of gene expression analysis, a significant increase in CASC21 expression was observed in tumor tissue of patients with gastric cancer compared to normal tumor margin tissue (p-value <0.0001). Also, the relationship between the different levels in CASC21 gene expression in cancer tumor samples after analyzing the data for ROC curve, specificity, sensitivity and AUC of CASC21 gene was determined to be 60%, 59% and 70%, respectively.ConclusionDue to the significant increase in CASC21 expression in the tumor tissue of patients with gastric cancer compared to normal tumor margin tissue, the CASC21 gene may be considered as an oncogen lncRNA in gastric cancer. In addition, further studies are needed to introduce the CASC21 gene as a biomarker in distinguishing between tumor and non-tumor gastric cancer tissue.
Study of LncRNA CASC21 gene expression in tumor tissue and margin of patients with gastric cancer
هوشمند،
آیدا
تهيه کننده
صفرعلیزاده،
حسینپور فیضی،
برادران،
رضا
محمدعلی
بهزاد
استاد راهنما
استاد مشاور
استاد مشاور
تبریز
