ردیابی جهش تک نوکلئوتیدی FecB در ژن کاندیدای گیرنده پروتئین مورفوژنتیک استخوان در گوسفندان برولا - افشاری و قزل - رومانوف
مهدی درخشان
کشاورزی
۱۴۰۰
۶۷ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
مهندسی علوم دامی گرایش اصلاح نژاد دام
۱۴۰۰/۱۱/۱۲
صفت دوقلوزایی درگوسفند، یک صفت پیچیدهی اقتصادی است که تحت تاثیر نرخ تخمک گذاری، زنده-مانی جنین و ظرفیت رحم میش میباشد. این صفت از دیدگاه علم اصلاح نژاد یک صفت آستانهای با فنوتیپگسسته، محدود به جنس و با وراثتپذیری پایین میباشد که انتخاب فنوتیپی برای آن پیشرفت ژنتیکی قابلنیز معروف است، دارای یک جهش است که ALK که به 6 BMPR1B یا FecB ملاحظهای در بر ندارد. ژنباعث افزایش میزان تخمکگذاری در حاملین میگردد. در این جهش، نوکلئوتید گوانین بجای آدنین درقرار گرفته است که سبب جایگزینی اسیدآمینهی آرژینین بجای DNA جایگاه 746 جفتبازی توالیگلوتامین در جایگاه 249 پروتئین میگردد. در تحقیق حاضر، تعداد 50 رأس قوچ و میش از دورگهایبرولا- افشاری و 30 رأس از دورگهای قزل- رومانوف انتخاب شد و نمونهها با استفاده از آنزیم اندونوکلئازتعیین ژنوتیپ شدند. هضم آنزیمی قطعات 30 و 160 جفتبازی ایجاد نمود PCR-RFLP در روش AvaⅡمرتبط با دوقلوزایی( بود و عدم برش قطعهی مذکور، قطعهی 190 جفت بازی ایجاد کرد ( B که معرف آللبود. نتایج این تحقیق به روشنی نشان داد که، کلیهی 30 رأس گوسفند دورگ قزل- A که نشانگر آللبودند و از 50 رأس گوسفند دورگ برولا- افشاری که )FecB+ / FecB+( رومانوف دارای ژنوتیپ وحشیداشته یعنی دو نسخه از جهش )FecBB / FecBB( دارای شجره بودند فقط دو رأس ژنوتیپ هموزیگوترا داشتند یعنی دارای یک نسخه )FecB+ / FecBB ( مرتبط با ژن برولا را داشته و بقیه، ژنوتیپ هتروزیگوتاز این جهش مرتبط با ژن بودند. بر روی تعدادی از نمونهها توالی یابی انجام شد که بعد از اخذ نتایج مشخصکه توسط آنزیم، هضم شده بودند و بر روی ژل به نمایش درآمدند با نتایج PCR شد که تمامی محصولاتبه درستی انجام شده است. بطور خلاصه، نتایج این تحقیق کم و PCR-RFLP توالی یابی مطابقت داشته وتوسط محققان داخل کشور و خارج مطابقت داشت. FecB بیش با مطالعات انجام یافته برای شناسایی جهشتوانایی تشخیص ژنوتیپها را دارد و این PCR-RFLP با توجه به نتایج این تحقیق، به نظر میرسد نشانگردر نژاد گوسفند رومانوف و دورگهای آن وجود ندارد و مکانیسم متفاوتی FecB تحقیق نشان داد که جهشبرای واریاسیون دوقلوزایی در گوسفند معروف رومانوف وجود دارد. همچنین، مدارک علمی مبتنی بر آزمونمولکولی نشان داد که در نسل اول دورگهای برولا- افشاری یک نسخه از این الل مطلوب وجود دارد.
Abstract: Litter size in sheep is a complex economic trait that is affected byovulation rate, fetal survival and ewe uterine capacity. From the perspective ofbreeding science, this trait is a threshold trait with a discrete phenotype, limitedto sex and low heritability, for which the choice of phenotype does not involvesignificant genetic improvement. The FecB or BMPR1B gene, also known asALK6, has a mutation that increases the rate of ovulation in carriers. In thismutation, the guanine nucleotide replaces the adenine nucleotide at position 746of the DNA sequence, which replaces the amino acid arginine instead of glutamineat position 249 of the protein. In the present study, 50 rams and ewes from Broola-Afshari and 30 Ghezel-Romanov were selected and the samples were genotypedusing AvaⅡ endonuclease enzyme by PCR-RFLP method. Enzymatic digestionproduced 30 and 160 bp fragments representing the B allele (associated with littersize), and failure to cut the fragment produced 190 bp fragments representing theA allele. The results of this study clearly showed that all 30 Ghezel-Romanov sheephad wild genotype (FecB + / FecB +) and out of 50 Broola-Afshari sheep that hadpedigree, only two homozygous genotypes (FecBB / FecBB) Had two copies of themutation associated with the Breula gene and the rest had the heterozygousgenotype (FecB + / FecBB), meaning they had one copy of the mutation associatedwith the gene. Sequencing was performed on a number of samples and afterobtaining the results, it was found that all PCR products that were digested by theenzyme and displayed on the gel corresponded to the sequencing results and PCRRFLPwas performed correctly. In summary, the results of this study were moreor less consistent with studies performed to identify FecB mutations byresearchers at iran and abroad. Based on the results of this study, it appears thatthe PCR-RFLP marker is capable of detecting genotypes. Also, scientific evidencebased on molecular testing showed that in the first generation of Broola-Afsharihybrids there is a copy of this desirable allele
Screening of FecB mononucleotide mutation in bone morphogenetic protein receptor candidate gene in Broola-Afshari and Ghezel-Romanov sheep