بررسی همزمان بیان۲۰۵ - miRو یکی از اهداف پیش بینی شده ی آن،NOK/STYK۱ ، در نمونه های گرفته شده از بیماران مبتلا به آدنوکارسینومای کولورکتال
/آیلا ولی نژاداورنگ
: دانشکده علوم طبیعی
۹۸ص
چاپی
کارشناسی ارشد
در رشتة ژنتیک
۱۳۹۲/۰۸/۱۱
تبریز
مقدمه سرطان کولورکتال (CRC) از جمله شایع ترین نئوپلاسم ها در سراسر جهان است و زمانی که در مراحل اولیه تشخیص داده شود، این سرطان درمان پذیر است miRNA .ها یک کلاس ازRNA های کوچک غیرکدکننده هستند که نقش عمدهای در تنظیم و در اغلب موارد کاهش بیان ژن دارند .در سالهای اخیر تجزیه و تحلیل الگوهای بیانmiRNA ها منجر به ظهور دیدگاههای کاملا جدیدی در بیولوژی سرطان شده است .به علاوه این الگوها یک ابزار نوید دهنده برای پیشرفت مارکرهای جدید تشخیصی و پیش آگاهی است۲۰۵ -. miRدر بافتهای اپیتلیال به صورت اختصاصی بیان میشود و انتظار میرود الگو بیان آن در سرطانهای مربوط به دستگاه گوارش از جمله سرطان کولورکتال ویژه ی همان سرطان باشد .سرین/ترئونین/تیروزین کیناز ( ۱( NOK/STYK۱انکوژن جدیدی است که با میل ترکیبی بالا به لیگاندهای خود) فاکتورهای رشد، سایتوکاین ها و هورمونها (متصل شده و با به راه انداختن آبشارهای سیگنالینگ درون سلولی فرایندهای متنوع سلولی و نیز مراحل تکوین) نمو (جنین انسان) از جمله تزاید سلولی، تمایز و بقای سلولها (را پیش می برد .ابزار های بیوانفورماتیکی متنوعی NOK/STYK۱ را به عنوان یکی از اهداف۲۰۵ - miRپیش بینی کرده اند .اهداف انتظار می رود با تایید کاهش بیان۲۰۵ - miRو افزایش STYK۱ در نمونه های توموری نسبت به سالم از طرفی نقش تومور مارکری۲۰۵ - miRو STYK۱تائید شده و با تائید همبستگی معکوس بیان این دو ژن، STYK۱ به عنوان یکی از اهداف احتمالی۲۰۵ - miRمعرفی گردد و از طرف دیگر نقش۲۰۵ - miRبه عنوان مهارکننده تومور و STYK۱ به عنوان یک انکوژن تائید گردد .مواد و روش ها ۳۸ نمونه ی توموری و ۳۸ نمونه ی سالم حاشیه توموری از همان بیمار جمع آوری گردیده و پس از مطالعه ی مشخصات ، نتایج پاتولوژی بیماران و جداسازی نمونه های مثبت از نظر آدنوکارسینومایی، آزمایش Real time PCR برای بررسی میزان بیان۲۰۵- miRو STYK۱ در نمونه های توموری و سالم انجام شد و در نهایت ار نرم افزار Sigma Plot و GraphPad Prism برای آنالیز داده ها استفاده شد .نتایج بر خلاف انتظار بیان۲۰۵ - miRاختلاف معنی داری بین نمونه های توموری و سالم نشان نداد .بنابراین نقش احتمالی تومور مارکری آن برای تشخیص سرطان کولورکتال رد شد .اما از طرفی بیان STYK۱ در نمونه های توموری به طرز چشمگیری بالاتر از میزان بیان در نمونه های سالم بود .از طرفی بیان این ژن در نمونه های توموری با گرید بالا در مقایسه با نمونه ها با گرید پایین اختلاف معنی داری دارد .بحث STYK۱ به عنوان یک انکوژن در فرایند تومورزایی کولورکتال شناخته شد و نشان داده شد که پتانسیل تومور مارکری بالایی برای تشخیص سرطان کولورکتال دارد .به علاوه از میزان بیان این ژن با درجه اطمینان بالایی می توان برای طبقه بندی گرید های بالا و پایین این سرطان استفاده کرد .اما بر خلاف انتظار میزان بیان۲۰۵ - miRپتانسیل قابل قبولی برای عملکرد به عنوان تومور مارکری نداشته و متعاقبا احتمال STYK۱ به عنوان یکی از اهداف پیش بینی شده ی۲۰۵ - miRرد می شود
205 was however found to have no prognostic value in CRC prediction and no capability to target STYK1 -tumor tissues as a control with a high degree of sensitivity and specificity in the Iranian population using an expression analysis of. In addition, the STYK1expression level may be utilized as a tool for classification of different histological grades. miR-205 expression aberration was observed between tumor and normal tissue samples. Conclusions We could differentiate colorectal cancer from the adjacent non-tumor tissue from each patient as a control. The expression analyses were performed using GraphPad Prism and Sigma Plot softwares. Results STYK1 expression was frequently upregulated in the CRC tissues compared to their non tumor counterparts. Moreover, the high expression of STYK1 was found to be correlated with histoligical grade. However, no significant miR-205 and STYK1 expression levels in tumor tissue from 38 CRC patients using non-time polymerase chain reaction was used to evaluate miR-205 prognostic value in CRC prediction with the aim to develope new biomarkers for early detection and effective clinical management of CRC. Methods Real-205 and STYK1 expression level; also, to validate STYK1 and miR-205's target mRNAs. Objectives The objectives of this study are to confim the correlation between miR-205 expression is proved to be specific to epithelial cell lines; thus, expected to have a deep role in Gasterointestinal tract, including Colon and rectum tumorigenesis. NOK/STYK1 is a serine/thronine kinase receptor which inagurates an intracellular signaling cascade with its high affinity to ligands, such as growth factors, cytokines and hormones. It has been proved to be a novel oncogene in many cancer types. Various computational algorithms predicted STYK1 to be one of the miR-coding RNAs which mostly reduce gene expression by targetting them. Expression studies also offer intriguing new perspectives on the involvement of miRNAs in human cancer. Furthermore, miRNA expression patterns are a very promising tool for the development of new diagnostic and prognostic markers. miR-Background Colorectal cancer (CRC) is one of the most commonly diagnosed cancers worldwide. CRC is treatable and curable if it is caught early enough. miRNAs are a new class of small non