۱۱۱۶۶پ
per
بررسی تغییرات متیله شدن DNA در دو رقم ج‍ـو طی مراحل رشد و نمو
/ناهید فرهمند
: دانشکده علوم طبیعی
۱۲۵ص
چاپی
کارشناسی ارشد
رشته علوم گیاهی گرایش سلولی تکوینی
۱۳۹۲/۰۶/۱۳
تبریز
متیله شدن DNA یکی از مکانیسم‌صهای اصلی تنظیم بیان ژن‌صها در یوکاریوت‌صها طی رشد و نمو و تحت شرایط محیطی مختلف می‌صباشد .برای بررسی تغییرات الگوی متیله شدن DNA جو طی مراحل رشد و نمو، دو رقم Clipper و Sahara۳۷۷۱ با الگوی رشدی مختلف در پنج مرحله دانه رستی، پنجه‌صزنی، طویل شدن ساقه، ظهور سنبله و رسیدگی دانه با تکنیکRA - CREDو با استفاده از نه آغازگر تصادفی و دو آنزیم برشی ایزوشیزومر HpaII و MspI مورد مطالعه قرار گرفت .در مجموع ۳۴۲ نوار چند شکل با ۲۳۲ الگوی متیله شدن متفاوت در دو رقم در پنج مرحله رشدی براساس نه آغازگر با استفاده از DNA ژنومی برش یافته با دو آنزیم تکثیر یافت .بیشترین و کمترین تعداد قطعات تکثیری به ترتیب مربوط به آغازگرهای MT۱۰و MT۱۱ بود .نوارهای ۹۱۰ و ۸۹۰ جفت بازی حاصل از آغازگر MT۲۰ به ترتیب در رقام Sahrara۳۷۷۱ و Clipper دارای الگوی متیله شدن متمایز در مراحل رویشی و زایشی بودند .در آغازگرMT۲ ، قطعه ۱۲۰۰ جفت بازی در رقمSahrara۳۷۷۱ الگوی متیله شدن متمایز در دو مرحله نشان داد ولی در رقم Clipper این ناحیه ژنومی متفاوت نبود .نوارص ۱۱۰۰تکثیر شده با آغازگر MT۳ الگوی متیله شدن اختصاصی در مراحل رشد رویشی و زایشی رقم Clipper داشت .این خصوصیت برای نوارص ۴۰۰ جفت بازی حاصل از آغازگر MT۱۵ در رقم Sahara۳۷۷۱ مشاهده گردید .بیشترین تعداد نواحی ژنومی با الگوی متیله شدن متمایز در مراحل رویشی و زایشی با استفاده از آغازگر MT۴ تکثیر شد .به این ترتیب که درSahara۳۷۷۱ ، نوار ۱۲۰۰جفت بازی و درClipper ، نوارهای۱۶۰۰ ،۱۵۵۰ ،۱۵۰۰ ،۱۴۰۰ ،۱۳۰۰ ،۱۲۰۰ ، ۵۵۰ و ۵۲۰جفت بازی متمایز بودند .متیله شدن متمایز بین مراحل رویشی و زایشی در قطعات تکثیری با آغازگر MT۱۰ در ارقام Sahara۳۷۷۱ و Clipper به ترتیب مربوط به نوارهای ۳۵۰ جفت بازی و ۹۸۰ و ۸۰۰ بود .بر اساس آغازگرMT۱۱ ، فقط نوار ۳۵۰جفت بازی الگوی متیله شدن متفاوت در رقم Sahrara۳۷۷۱ نشان داد .بررسی الگوی متیله شدن قطعات تکثیری حاصل از نه آغازگر تصادفی نشان دهنده کاهش متیله شدن DNA در مرحله رسیدگی دانه بود
RA technique using nine random primers and two isoschizomers restriction enzymes HpaII and MspI. In total, 342 polymorphic bands with 232 different methylation patterns at five developmental stages of two varieties were amplified using nine primer and genomic DNA restricted with two enzymes. The minimum and maximum of bands were amplified using MT10 and MT11 primers, respectively. Using MT20 primer, 910 and 890 bp bands showed differential DNA methylation pattern in Sahara3771 and Clipper during vegetative and reproductive stages, respectively. The 1200 bp band amplified using MT2 primer displayed different methylation pattern at vegetative and reproductive stages of Sahara3771, but not in Clipper. For MT3 primer, 1100 bp band showed this pattern in Clipper. Using MT15 primer, 400 bp band had different methylation pattern in Sahara3771. The maximum genomic regions with differential DNA methylation patterns at vegetative and reproductive stages were amplified using MT4 primer. In Sahara3771, 1200 bp band and in Clipper 1600, 1550, 1500, 1400, 1300, 1200, 550, 520 bp bands were different. Differential methylation pattern at vegetative and reproductive stages in the fragments amplified using MT10 primer were 350 bp in Sahara3771 and 980 and 800 bp bands in Clipper. Using MT11 primer, only 350bp band showed differential methylation pattern in Sahara3771. Analysis of methylation patterns of the fragments amplified using nine primers showed reduced methylation pattern at grain maturity stage-DNA methylation is one of the main mechanisms of gene expression regulation in eukaryotes during development and under different environmental conditions. To analysis DNA methylation pattern variation in barley during growth and developmental stages, two varieties Sahara3771 and Clipper with different developmental stage was evaluated at seedling, tillering, stem elongation, heading and grain maturity with CRED
فرهمند، ناهید
علی موافقی
سید ابوالقاسم محمدی
دادپور، محمدرضا، استاد راهنما
صالحی لیسار، سید یحیی، استاد راهنما
استاد مشاور
استاد مشاور
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
