شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های باکتری scabies Streptomyces عامل اسکب معمولی سیب زمینی در آذربایجان شرقی و کردستان
/علی احمدی
تبریز: دانشگاه تبریز، دانشکده کشاورزی، گروه گیاهپزشکی
۱۰۸ص
چاپی
کارشناسی ارشد
گیاهپزشکی - بیماری شناسی گیاهی
۱۳۹۰/۱۱/۲۵
تبریز: دانشگاه تبریز، دانشکده کشاورزی، گروه گیاهپزشکی
بیماری اسکب معمولی سیب زمینی) (common scab یکی از بیماریهای مهم است که به وسیله ی باکتری Streptomyces scabies و سایرگونه های مشابه دیگر بر روی سیب زمینی و سایر سبزیجات غده ای)تربچه ، شلغم وغیره (ایجاد میشود .این بیماری به وسیله ی باکتری خاکزی گرم مثبت Streptomyces ایجاد میشود .ایجاد علایم زخم های نکروتیک برجسته ، سطحی یا فرورفته از علایم مشخص اسکب معمولی بر روی غده های سیب زمینی است که ارزش بازارپسندی و کیفیت غده های سیب زمینی را کاهش داده و باعث خسارت اقتصادی به محصول میشود .طی سال ۱۳۸۹ از مناطق مختلف استانهای آذربایجان شرقی و کردستان غده های دارای علایم اسکب جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل گردید .و براساس ویژگیهای مورفولوژیکی ، فیزیولوژیکی و تستهای بیوشیمیایی ۳۰ جدایه استرپتومایسس جداسازی شد .همچنین واکنش زنجیره ای پلی مراز برای شناسایی ژن txtA که در بیماریزایی بیشتر استرینهای گونه های S.scabies ، S.acidiscabies و S.turgidiscabies نقش اساسی ایفا میکند انجام شد .واکنش زنجیره ای پلی مرازکه برای شناسایی جنس Streptomyces و گونه ی S. scabies انجام شد منجر به شناسایی ۳۰ جدایه به عنوان استرپتومایسس شناسایی گردید)اندازه باند ( ۱۰۲۷ و ۲۶ جدایه نیز به عنوان گونه ی S. scabies تعیین شد) .اندازه باند . ۴۷۵) به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایه های S. scabies ، DNA ژنومی جدایه ها استخراج ودر واکنش زنجیره ای پلی مراز با روشهای ERIC ، REP وPCR - BOXو با آغازگرهایERIC ۲F ، ERIC ۱R ،REP۲F، REP۱R وAIR - BOXبه کار برده شدند .محصولهای تکثیر شده در ژل آگارز ۵/۱ درصد الکترورز و با اتیدیوم بروماید رنگ آمیزی شدند .از ضریب تشابه جاکارد (Jaccard) برای تعیین تشابه جدایه ها واز روش UPGMA و نرم افزار NTSYS نسخه ۲.۰۲ برای آنالیز خوشه ای استفاده شد .آنالیز خوشه ای نتایج بدست آمده با آغازگرهایERIC ۲F ، ERIC ۱R نشان داد که در سطح تشابه۷۵ درصد،بر اساس آغازگرهای ERIC ۲F ، ERIC ۱R جدایه ها به ۸ گروه ، با آغازگرهای ،REP۲F، REP۱R به ۵ گروه ، و با آغازگرAIR -BOXبه ۷ گروه تقسیم شدند .بدین ترتیب نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه های S.scabies عامل بیماری جرب معمولی سیب زمینی بود.