بررسی میزان آهن سرم و پلی مورفیسم ژنتیک اگزون های شماره۱ و ۲ و ۳از ژن فروپروتئین در گاو میش
The Investigation of the Level of iron in Serum and Genetic Polymorphisms of Exon ۱, ۲ and ۳ from Ferroprotein gene in Buffalo
/اسماعیل حبیبی
: دامپزشکی
، ۱۳۹۹
، میرزائی
۱۲۲ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناس ارشد
دامپزشکی
۱۳۹۹/۱۱/۱۵
تبریز
زمینه تحقیق :هدف اول این مطالعه تعیین تغییرات آهن درسرم ۲۱ راس گاومیش است هدف دوم شناسایی پلی مورفیسم تک نوکلئوتید (SNP) در اگزونهای شماره۱ ، ۲ ، ۳و مناطق جانبی ژن فروپروتئین گاومیش (Fpn) و بررسی ارتباط بینSNP ها شناسایی شده و محتوای آهن سرم است تظاهرات بالینی اختلال در ذخیره آهن به دلیل جهش های فروپروتئین را میتوان به دو دسته تقسیم نمود دسته اول با توجه به اینکه آیا بارگذاری آهن به شکل انتخابی در ماکروفاژها صورت گرفته یا خیر بررسی خواهد شد اما دسته دوم با در نظر گرفتن تجمع آهن در سلول های اپیتلیال روده مورد بررسی قرار خواهد گرفت بیان فروپروتئین بوسیله دو مکانیسم نظارتی کنترل میشود تنظیمات بعد رونویسی تحت تعامل IRP / IRE و نیز تنظیم پس از ترجمه توسط هپسیدین کبدی کنترل میشود گزارش شده است که mRNA فروپروتئین یک موتیف کاربردی IRE است که بیش از حد بیان فروپروتئین در سلولهای کشت سلولی باعث فعال شدن اتصال IRP به IRE درUTR ۵ ، آغاز ترجمه را با دخالت در مونتاژ ریبوزوم در کدون شروع میکند این آزمایشات IRP / IREتضمین میکند که بیان فروپروتئین در شرایط پایین آهن برای حفظ تعادل آهن سلولی را سرکوب میکند مواد و روش کار :دراین پایانامه بر پایه استخراج DNA ازخون گاومیش سپس تکثیر DNA نمونه ها توسط عمل PCR و بارگذاری محصول PCR برروی ژل الکتروفورز۵/۰ ،۲/۱ ، ۵/۱ می باشد در مراحل بعدی عمل توالی یابی جهت بررسی جهش دراگزون های مورد مطالعه صورت گردید و نمونه های خون را برای تعیین میزان آهن سرم برپایه کیت پارس آزمون به روش مستقیم طبق بروشور جهت تغییرات فیزولوژیکی و پاتولوژیکی بررسی و مقایسه گردید و مکانیسمهای مولکولی مسئول نگهداری آنها درهموستاز آهن در ارگانیسم جهت جهش هایی در اگزون های شماره۱ ، ۲ ، ۳در ژن فروپروتئین بررسی شد نتایج :توالی یابی را با نرافزار BLASTاز بانک جهانی ژن و دانلود ژنوم با نرافزار FAST آنالیز گردید نتایج و مقدارآهن اندازه گیری شده در مقایسه با سایر منابع و اطلاعات مقدار پایین تری را نشان میداد با میانگین (۶۰.۰۱) میکرو گرم بر دسی لیترکه این امر ممکن است پدیده فیزیولوژیکی و سوء تغذیه و عدم دسترسی کافی به ریز مغذی ها باشد اما نتایج واکنش زنجیره پلیمراز و توالی یابی نشان داد هیچ تفاوتی بین اگزونهای مورد آزمایش با ژن رفرنس ثبت شده در بانک جهانی ژن مشاهده نگردید
Background: The first aim of this study was to determine iron concentrations in 21 buffalos. The second aim was to determine single-nucleotide polymorphism (SNP) in exons 1, 2 and 3 from Feroprotein gene in buffalo. Also investigation of the relationships among those SNPs and iron concentrations in sera of the animals. Clinical presentations of iron mal-metabolism could be divided into two categories: first; selective loading of iron in macrophages and second; considers iron accumulation in enterocytes. Feroprotein gene expression is controlled by two investigatory mechanisms; post-transcription is under the control of IRE/IRP, moreover post-transcription of the gene is under control of Hepsidin. It has been reported that Feroprotein mRNA is a functional motif of IRE that in cell culture, binding of IRP to IRE at UTR5 results in translation of mRNA in ribosoms. The cooperation of these elements (IRE/IRP) grantees the most efficient hemostasis of Iron even when the concentrations of iron in under the needed levels in cellular level. Material and Methods: in this study; DNA was extracted from Buffalos' blood and then targeted exons from Feroprotein were amplified using PCR methodology and finally PCR products investigated by gel electrophoresis. DNA sequencing was the next step to determine the possible mutations in exons under study. Moreover, blood samples were investigated for iron concentration using a biochemical method (Iron Kit, ParsAzmoon, Iran). Mutations in Feroprotein exons I, II and III related to any abnormalities in iron concentration were assessed. Results: DNA sequencing results were homology searched by a standard Feroprotein gene sequences through BLAST in NCBI. In general all buffalos showed low level of iron concentration in blood compare to available reports (Mean=60.01ug/dl). This is might be related to malnutrition and low levels of trace minerals in the animal diet. PCR and sequencing results showed there is no significant difference and mutations between Feropeotein exons and standard gene in NCBI
The Investigation of the Level of iron in Serum and Genetic Polymorphisms of Exon ۱, ۲ and ۳ from Ferroprotein gene in Buffalo