۲۳۲۴۵پ
per
بررسی in silico تاثیر لیکوپن ( Lycopene) بر روی بیان برخی ژن های خانواده ی HSPو پروتئین های مهارگر دخیل در سرطان پروستات
In silico investigation of the effect of lycopene on the expression of certain HSP family genes and inhibitory proteins involved in prostate cancer
/غلامرضا داداشی اورنج
: دامپزشکی
، ۱۳۹۹
، میرزائی
۱۰۳ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
دامپزشکی
۱۳۹۹/۰۶/۳۰
تبریز
سرطان یک بیماری ژنتیکی است که به دنبال جهش در ژن های کنترل کننده فعالیت های سلول بروز می کند .سرطان پروستات یکی ازشایع ترین انواع سرطان هایی است که در مردان دیده می شود .برای درمان این بیماری از جراحی، پرتو درمانی، هورمون درمانی و شیمی درمانی استفاده می‌گردد، در این تحقیق جهت یافتن را ه های درمانی جدید وکم هزینه، ترکیب کارتنوئیدی لیکوپن مورد مطالعه قرارگرفت .در بیشتر سرطان ها بیان ژن های پروتئین های شوک حرارتی بالا می‌رود و سلول های سرطانی را نسبت به دارو و درمان مقاوم می‌سازد .از طرف دیگر محصول ژن هایBRCA۲ ،BRCA۱ ، PTENو P۵۳ به عنوان پروتئین سرکوب کننده سلول های سرطانی، نقش بسیار مهمی در سرکوب سرطان از طریق آپوپتوز و مرگ سلولی دارند .در این پروژه با استفاده از روش In silicoو با بهره گیری از نرم افزار هایی نظیر متلب، تاثیر ترکیب لیکوپن بر بیان ژن های مورد نظر موثر بر سرطان پروستات، موردمطالعه و بررسی قرار گرفت .برای این منظور داده های بیان ژن با حجم بالا از پایگاه داده NCBI، بخش GEO دریافت، و برای آنالیز بهینه این داده ها، از توانمندی های نرم افزار matlab و همچنین برای بررسی ارتباطات ژن-ژن و ترسیم شبکه مولکولی، از ابزار های سیستم بیولوژی، از جمله ژن مانیا و نرم افزار سیتواسکپ استفاده گردید .در نهایت، با آنالیز داده ها و ترسیم کلاسترگرام و هیستوگرام، تغییرات بیان ژن هایHSP۴۰ ، Hsp۷۰،BRCA۲ ، BRCA۱، PTEN و p۵۳تحت تیمار با ترکیب لیکوپن، اندازه گیری ومشخص گردید که تیمار بیماران سرطان پروستات با لیکوپن باعث افزایش بیان وکاهش بیان برخی ژن ها به نفع درمان، در سرطان پروستات می گردد
Cancer is a genetic disease that occurs after mutations in genes that control cell activity. Prostate cancer is one of the most common types of cancer seen in men. Surgery, Radiotherapy, hormonetherapy and chemotherapy are used to treat this disease. In this study, we studied the lycopene to find new and low-cost treatments. Lycopene is one of the carotenoid compounds. In most cancers heat shock proteins are elevated, making cancer cells resistant to drugs and treatment. On the other hand, the products of the BRCA2, BRCA1, PTEN and P53 genes, as a protein that suppresses cancer cells, play a very important role in suppressing cancer through cell apoptosis. In this project, using in silico methods, we studied the effect of lycopene on the expression of the desired genes affecting prostate cancer. The gene expression Big data is received from GEO section of the NCBI database. For optimal analysis of this Big data, we used the capabilities of matlab software, as well as for gene-gene communication, and molecular network drawing, System Biology tools such as genmania and cytoscape were used. By drawing the clustergram and histogram, we determined and specified the changes in the expression of HSP40, Hsp70, BRCA2, BRCA1, PTEN and p53 genes under treatment with lycopene
In silico investigation of the effect of lycopene on the expression of certain HSP family genes and inhibitory proteins involved in prostate cancer
داداشی اورنج، غلامرضا
dadashi oranj, Golamreza
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
