انتقالپذیری نشانگرهایSSR - ESTگندم برای بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت نمونههای Aegilops tauschii
Transferability of wheat EST-SSR markers in analysis of Aegilops tauschii accessions genetic diversity and population structure
/بهناز شاهی خلف انصار
: کشاورزی
، ۱۳۹۸
، میرزائی
۵۷ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
بیوتکنولوژی کشاورزی
۱۳۹۸/۰۶/۱۲
تبریز
پایه ژنتیکی محدود ارقام امروزی گندم، استفاده از تودهصهای بومی و خویشاوندان وحشی را جهت شناسایی ژنوتیپصهای مطلوب برای استفاده در برنامهصهای اصلاحی گندم اجتنابصناپذیر کرده است .هدف از این پژوهش، بررسی انتقالصپذیری نشانگرهایSSR - ESTگندم برای مطالعه تنوع ژنتیکی ۸۲ نمونه Aegilops tauschii جمعصآوری شده از استانصهای گیلان، گلستان، مازندران، آذربایجانصشرقی، آذربایجانصغربی و سه نمونه با منشأ نامشخص بود .از ۴۸ جفت آغازگر مورد استفاده، ۱۸ جفت آغازگر دارای تکثیر بودند .در مجموع ۵۶ الل با دامنه تغییرات ۲ تا ۹ و میانگین ۷۳/۳ به ازای هر جایگاه تکثیر شد .بیشترین و کمترین محتوای اطلاعات چندصشکلی به ترتیب ۸/۰ و ۰۷/۰ با میانگین ۲۹۶/۰ بود .میانگین شاخص تنوع ژنی نی ۳۰/۰ به دست آمد .در تجزیه واریانس مولکولی، واریانس درون و بین گروهی به ترتیب ۸۰ و ۲۰ درصد از واریانس مولکولی کل را تبیین کردند .تجزیهصی خوشهصای با استفاده از الگوریتمJoining - Neighborو ضریب فاصلهparameter - Kimura ۲نمونهصها را به پنج گروه منتسب کرد که با منشأ جغرافیایی آنصها مطابقت نداشت .ولی در تجزیه خوشهصای مبتنی بر مدل، بیشترین تمایز بین زیرجمعیتصها در K = ۳ بدست آمد .در تجزیه به بردارصهای اصلی، ۴۲/۵۷ درصد از تغییرات مولکولی کل توسط سه بردار اصلی اول تبیین شد .نتایج این پژوهش نشان دهنده تنوع ژنتیکی قابلصتوجهی در نمونهصهای Ae. tauschii مورد مطالعه بود که میصتواند در برنامهصهای اصلاحی گندم استفاده شود
s genetic diversity index was 0.30. In molecular variance analysis, intra- and inter-group variance explained 80 and 20 of total molecular variance, respectively. Cluster analysis using Neighbor-Joining algorithm and Kimura 2-parameter distance coefficient assigned the accessions into five groups that were in accordance with their geographical origins. But in model-based cluster analysis, the most significant difference between sub-populations was obtained at K3. In the Principal coordinate analysis (PCoA), 57.42 of the total molecular variation was explained by the first three principal coordinates. The results of this study indicate significant genetic variation in the studied Ae. tauschii accessions which can be used in wheat breeding programsلإThe narrow genetic base of modern wheat cultivars has made inevitable the utilization of landraces and wild relatives to identify suitable genotypes to use in wheat breeding programs. The aim of this study was to investigate the transferability of wheat EST-SSR markers to study genetic diversity of 82 Aegilops tauschii accessions collected from Gilan, Golestan, Mazandaran, East Azarbaijan, West Azarbaijan provinces and three accessions with unknown origin. Out of 48 used primer pairs, 18 were amplified. In total, 56 allells with a range 2-9 and an average of 3.73 allells per locus were amplified. The highest and the lowest of polymorphic information content (PIC) were 0.8 and 0.07, with a mean of 0.296, respectively. The mean Nei
Transferability of wheat EST-SSR markers in analysis of Aegilops tauschii accessions genetic diversity and population structure