بررسی بیان lncRNA FER۱L۴ و ژن هدف آن (RB۱) در سرطان کولورکتال
Evaluation of lncRNA FER۱L۴ expression and its target gene (RB۱) in the colorectal cancer
/مرجان استوارپور
: علوم طبیعی
، ۱۳۹۸
، میرزائی
۸۹ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
زیست شناسی سلولی و مولکولی گرایش ژنتیک
۱۳۹۸/۱۱/۱۶
تبریز
مقدمه :سرطان کولورکتال به عنوان بدخیمی دستگاه گوارش، شامل سرطان کولون و رکتوم است .این بیماری، سومین سرطان شایع در جهان و یکی از علل عمده مرگ و میر ناشی از سرطان است .اکثر مرگ و میر وابسته به سرطان کولورکتال، به دلیل متاستاز دوردست و بازگشت بیماری است .در دههصهای اخیر به دلیل تغییر شیوه زندگی، بروز این بیماری رو به افزایش است .مطالعات اخیر نشان دادهصاست که برخی long noncoding RNA (lncRNA) ها، نقش مهمی در رشد و توسعه سرطان ایفا میصکنند .مطالعات نشان میصدهد کهlike protein ۴ (FER۱L۴) -۱- Ferدر تومورزایی و پیشرفت تومور نقش دارد و در برخی سرطانصها از جمله سرطان معده، استئوسارکوما و کبد کاهش بیان نشان دادهصاست .اگرچه اهمیت بیولوژیکی FER۱L۴ در سرطان کولورکتال مشخص نیست .هدف :هدف از این مطالعه بررسی بیان FER۱L۴ و RB۱ به عنوان ژن هدف آن در نمونهصهای سرطان کولورکتال و پولیپ آدنوماتوز نسبت به نمونهصهای سالم مجاور است .روششناسی پژوهش :در این بررسی ۵۰ جفت نمونه تومور و حاشیه تومور، و ۳۰ جفت نمونه پولیپ و حاشیه پولیپ از بیماران تهیه شد RNA .کل از هر نمونه بافتی استخراج شد و پس از سنجش کیفیت و کمیت آن، سنتز cDNA صورت گرفت .بیان lncRNA FER۱L۴ و ژن هدف آن (RB۱) با استفاده از روش qReal time PCR مورد ارزیابی قرار گرفت .سرانجام دادهصها با نرمصافزارهایGenEx ۷ ، SPSS v۲۵ و GraphPad Prism v۸ آنالیز گردید .یافتهها :نتایج حاکی از کاهش بیان معنیصدار FER۱L۴ و افزایش بیان معنیصدار RB۱ در نمونهصهای بافت توموری نسبت به حاشیه تومور، پولیپ و حاشیه پولیپ است .تفاوت بیان معنیصداری بین نمونهصهای پولیپ و حاشیه پولیپ مشاهده نشد؛ بین بیان FER۱L۴ و RB۱ با ویژگیصهای کلینیکی- پاتولوژی مبتلایان به سرطان کولورکتال و افراد دارای پولیپ، رابطه معنی-داری مشاهده نشد .همچنین بیان FER۱L۴ باRB۱ ، در نمونهصهای تومور همبستگی منفی غیر معنادار نشان داد .نتیجهگیری :نتایج این بررسی پیشنهاد میصکند که این دو ژن میصتوانند در پیشرفت سرطان کولورکتال نقش داشته باشند .همچنین FER۱L۴ و RB۱ دارای پتانسیل بیومارکری برای تشخیص سرطان کولورکتال میصباشند .مطالعات بیشتر برای شناسایی مسیرهای مولکولی وعملکرد FER۱L۴ و RB۱ در تومورزایی سرطان کولورکتال مورد نیاز است
Colorectal cancer (CRC) as a gastrointestinal malignancy consists of colon and rectal cancer. It is the third most common cancer in the world and also one of the leading causes of cancer-related deaths. Distant metastasis and recurrence of disease are the cause of most CRC-related deaths. In recent decades, CRC incidence rates is increasing due to lifestyle changes. Recent researches demonstrated that some long noncoding RNAs (lncRNAs) play an important role in the development and progression of cancer. Studies demonstrated Fer-1-like protein 4 (FER1L4) involved in tumorigenesis and tumor progression. FER1L4 has been shown downregulation in some cancers, including gastric cancer, osteosarcoma and hepatocellular carcinoma. However, the biological importance of FER1L4 in colorectal cancer is unclear. Research Aim: The purpose of this study was to investigate the expression of FER1L4 and RB1 as its target gene in colorectal cancer and polyp samples compared with their matched adjacent normal tissues. Research Method: In this study, 50 pairs of tumor specimens and tumor margins, and 30 pairs of adenomatous colorectal polyps (ACPs) and their matched adjacent normal tissues were obtained from patients. Total RNA was extracted from tissue sample and cDNA was synthesized after checking the quality and quantity of RNA. The Expression levels of FER1L4 lncRNA and its target gene (RB1) were evaluated by qReal time PCR. Finally, Statistical analysis was done using GenEx 7, SPSS v25 and GraphPad Prism v8 software programs. Findings: The results showed low expression of FER1L4 and overexpression of RB1 in tumor tissue samples compared to their normal adjacent tissues and polyps. No significant expression differences were found between polyp and polyp margins. There were no significant associations between FER1L4 and RB1 expression with clinicopathological outcomes. FER1L4 expression was also correlated with RB1 in tumor samples. Conclusion: The results of this study suggest that these two genes may be involved in the development of colorectal cancer. Also, FER1L4 and RB1 have biomarker potential for colorectal cancer diagnosis. Further studies are needed to identify the molecular pathways and function of FER1L4 and RB1 in colorectal cancer tumorigenesis
Evaluation of lncRNA FER۱L۴ expression and its target gene (RB۱) in the colorectal cancer