۲۲۹۸۰پ
per
بررسی بیان ژن RNA بلند غیرکدکنندهAS۱- MCM۳APدر بافت توموری و حاشیه غیرتوموری بیماران مبتلا به سرطان پستان
Study of LncRNA MCM۳AP-AS۱ gene expression in tumor and marginal non-tumor tissues of Breast Cancer patients
/آتوسا ریاحی
: علوم طبیعی
، ۱۳۹۹
، میرزائی
۷۹ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
زیست شناسی گرایش ژنتیک
۱۳۹۹/۰۶/۱۵
تبریز
سرطان پستان اولین سرطان شایع و پنجمین عامل مرگ و میر به علت سرطان در جهان است .کشف نشانگر های مولکولی جدید که در پیشرفت سرطان پستان نقش دارند ، برای مدیریت بهبود نتایج بیماران مبتلا به سرطان پستان و کاهش نرخ مرگ و میر بالای آن ضروری است .مطالعات نشان داده است که RNA های بلند غیرکد کننده (lncRNAs) که بیش از ۲۰۰ نوکئوتید طول دارند ، در پاتولوژی بیماری های مختلف از جمله سرطان و همچنین در فرآیند های سرطان زایی و توسعه تومورها نقش دارند .بنابراین آن ها می توانند به عنوان یک نشانگر مناسب تشخیصی در درمان سرطان استفاده شوند .با وجود اینکه نقشAS۱ - MCM۳APدر برخی از سرطان ها مشخص شده است ، با این حال هنوز نقش و مکانیسمAS۱ - MCM۳APدر سرطان پستان ناشناخته باقی مانده است .در مطالعه ی حاضر ، هدف ما آنالیز و مقایسه بیان ژنAS۱ -lncRNA MCM۳APدر بافت توموری و نرمال حاشیه تومور افراد مبتلا به سرطان پستان است .مواد و روش ها :در این مطالعه ، ابتدا ۱۰۲ جفت از نمونه های توموری و نرمال حاشیه توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان تهیه و پس از استخراج RNA ، سنتز cDNA از تمامی نمونه ها انجام شده و برای بررسی تفاوت در میزان بیان ژنAS۱ - MCM۳APاز تکنیک Real time PCR استفاده شده است .در نهایت آزمون هایWhitney - Mannو Independent Sample test توسط نرم افزارهای SPSS و Graphpad برای آنالیز داده های بیان ژن و همچنین تست ROC برای ارزیابی عملکرد ژن مورد نظر به عنوان بیومارکر انجام گردیده است .یافته ها :بر طبق نتایج به دست آمده از آنالیز بیان ژن، افزایش بیان معنادارAS۱ - MCM۳APدر بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان در مقایسه با بافت های مجاور غیر توموری مشاهده شدvalue < ۰.۰۰۰۱). - (pهمچنین بررسی ارتباط بین تغییرات بیان ژنAS۱ - MCM۳APدر نمونه های توموری پستان همبستگی معنی داری را با درصد گیرنده های پروژسترونیvalue= ۰.۰۰۰) - (PR ) (Pو استروژنیvalue=۰.۰۲۳) (ER ) - (pنشان داد .پس از آنالیز داده ها برای منحنی ROC ، مقدار AUC ، حساسیت و اختصاصیت ژنAS۱ - MCM۳APبه ترتیب ۶۷/۰ ، ۵۸ ، ۷۶ تعیین شد .نتیجه گیری :با توجه به افزایش بیان قابل توجهAS۱ - MCM۳APدر بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان پستان نسبت به بافت حاشیه غیرتوموری ، ممکن استAS۱ - MCM۳APبتواند به عنوان یک lncRNA انکوژن در سرطان پستان در نظر گرفته شود .همچنین بررسی های بیشتری برای عنوان کردنAS۱ - MCM۳APبه عنوان یک بیومارکر در تشخیص بین توموری و غیر توموری بودن بافت سرطان پستان نیاز است
Background: Breast cancer (BC) is the first common cancer and the fifth leading cause of cancer death in the world. Discovering novel molecular markers that contribute to the development of BC is essential to managing the improvement of outcomes patients with BC and reducing their high mortality rates. Studies have revealed that long non-coding RNAs (lncRNAs) with more than 200 nucleotides in length are involved in the pathology of various diseases, such as cancer, and the processes of carcinogenesis and tumor development. Therefore, they can be used as potential diagnostic biomarkers in the treatment of cancer. Although the role of MCM3AP-AS1 in some malignancies has been identified, the role and mechanism of MCM3AP-AS1 in BC remains unknown. In the present study, we aimed to analyze and compare MCM3AP-AS1 gene expression in tumor and marginal non-tumor tissues of BC patients. Materials and methods: In this study, 102 pairs of tumor and marginal non-tumor of BC patients were collected. After RNA extraction, cDNA synthesis for all samples was performed. Then the differential of MCM3AP-AS1 gene expression levels was performed using the Quantitative Real-Time PCR Technique. Finally, Mann-Whitney and Independent-Samples t-test were performed by SPSS and Graphpad software to analyze gene expression data. Also, ROC analysis was performed to evaluate the function of the mentioned gene as a biomarker. Results: Based on the results of gene expression data, significant overexpression of MCM3AP-AS1 was observed in the tumor tissue of BC patients compared to marginal non-tumor tissues (p-value 0.0001). Also, the MCM3AP-AS1 gene expression changes in breast tumor tissues showed a significant association with clinicopathological features such as the tumor progesterone (PR ) (p-value=0.000) and estrogen receptors percentage (ER )(p-value = 0.023). After analyzing the data for the ROC curve, the AUC, sensitivity and specificity percentages of MCM3AP-AS1 was determined to be 0.67, 58 and 76 , respectively (95 CI = 0.596 - 0.747, p-value < 0.001). Conclusion: Given the significant overexpression of MCM3AP-AS1 in BC patients tumor tissue compared to marginal non-tumor tissues, MCM3AP-AS1 may be considered as an oncogenic lncRNA in BC. Besides, Further evaluation is needed to designate MCM3AP-AS1 as a biomarker in the recognition of BC tumor from non-tumor tissues
Study of LncRNA MCM۳AP-AS۱ gene expression in tumor and marginal non-tumor tissues of Breast Cancer patients
ریاحی، آتوسا
Riahi, Atousa
صفرعلیزاده، رضا، استاد راهنما
حسینپور فیضی، محمدعلی، استاد راهنما
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
