۲۲۲۹۹پ
per
ارزیابی تنوع ژنتیکی هندوانه‌های محلی ایران با استفاده از نشانگر مولکولیSRAP
Assesment of genetic diversity of Iranian watermelon (Citrullus lanatus Thumb) landraces using SRAP markers
/فاطمه سرائی سرای
: کشاورزی
، ۱۳۹۸
، میرزائی
۶۷ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
باغبانی
۱۳۹۸/۰۵/۰۹
تبریز
هندوانه بانام علمی (Citrullus lanatus Thumb) یک گیاه علفی یک ساله متعلق به خانواده‌ی کدوئیان و بومی آفریقا است که به خاطر میوه آبدار و شیرین پرورش داده می‌شود .مطالعه‌صی تنوع ژنتیکی فرآیندی است که تفاوت‌ها و شباهت‌های گونه‌صها، جمعیت‌صها و یا افراد را با استفاده از روش‌صها و مدل‌صهای آماری خاص بر اساس صفات مورفولوژیک، اطلاعات شجره‌صای و یا خصوصیات مولکولی افراد بیان می‌صکند .جمع‌صآوری و ارزیابی توده‌صهای بومی یک محصول اولین قدم در راه اصلاح آن گیاه است چرا که ارقام محلی به شرایط آب و هوایی خاصی سازگاری پیدا کرده‌اند و دارای صفات خاصی می‌صباشند که ممکن است در ارقام تجاری اصلا یافت نشود .این تحقیق، به‌منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ۳۰ توده هندوانه‌صی محلی ایران با استفاده از نشانگر مولکولیSRAP ، مورد بررسی قرار گرفت DNA .ژنومی هر توده با استفاده از روش CTAB تغیر یافته استخراج و سپس کمیت و کیفیت آن‌ها بررسی شد .با استفاده از ۲۰ ترکیب آغازگری SRAP واکنش زنجیره‌صای پلیمراز (PCR) انجام شد ۲۰ .ترکیب آغازگرSRAP ، ۲۷۳ باند تکثیر شده‌ی قابل امتیازدهی تولید کردند که از میان آن‌ها ۱۰ باند (۶۶/۳ درصد (یک شکل و ۲۵۷ باند (۱۴/۹۴ درصد (چند شکل بودند .میانگین تعداد باندهای چند شکل به ازای هر ترکیب آغازگر ۶۵/۱۳ بود .بیشترین تعداد باندهای چند شکل مربوط به نشانگرME۸ - EM۱با ۱۹ آلل و کمترین تعداد باندهای چند شکل مربوط به نشانگرME۴ - EM۳با ۸ آلل بود .بیشترین تشابه بین توده‌های سیستان و اصفهان و کمترین تشابه بین توده‌های آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی بود .پس از محاسبه تجزیه خوشه‌صای با استفاده از نرم‌صافزار NTSYS و ترسیم دندروگرام بر اساس الگوریتمJoining - Neighborو ضریب تشابه جاکارد هندوانه به پنج گروه اصلی خوشه‌بندی شد .تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) برای درک روابط بین توده‌صها توسط نرم-افزار GenAlex ۶.۴۱ انجام شد و درنهایت به منظور بررسی تنوع آللی در توده‌صهای مورد بررسی از تجزیه به مؤلفه‌صهای اصلی با استفاده از نرم‌صافزار Landmark صورت گرفت .نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که تنوع ژنتیکی زیادی میان توده‌های جمع‌آوری شده از مناطق مختلف ایران وجود دارد و این مطالعه سودمندی نشانگر SRAP را در تعیین تنوع ژنتیکی بین توده‌ای هندوانه نشان داد
The scientific watermelon (Citrullus lanatus Thumb.) is a one-year-old herbaceous plant belonging to the family of pumpkins native to Africa that is grown for aqueous and sweet fruit. Genetic diversity study is a process that expresses the differences and similarities of species, populations, or individuals using specific statistical methods and models based on morphological traits, pedigree information, or molecular characteristics. Gathering and evaluating indigenous populations of a crop is a first step towards improving the plant because local varieties are adapted to specific climates and have certain traits that may not be found in commercial varieties. This study was conducted to evaluate the genetic diversity of 30 Iranian watermelon populations using SRAP molecular marker. Genomic DNA of each biomass was extracted using modified CTAB method and then their quantity and quality were evaluated. Twenty-six SRAP primer combinations were performed by polymerase chain reaction (PCR). The 20 SRAP primer combinations produced 273 scalable amplified bands, of which 10 (3.66 ) bands were single-form and 257 bands (94.14 ) polymorphic. The average number of polymorphic bands per primer combination was 13.65. The highest number of polymorphic bands belonged to the EM1-ME8 marker with 19 alleles and the lowest number of polymorphic bands belonged to the EM3-ME4 marker with 8 alleles. The highest similarity was between Sistan and Isfahan populations and the least similarity between East Azarbaijan and West Azarbaijan. After calculating the cluster analysis using NTSYS software and dendrograms based on Neighbor-Joining algorithm and Jacquard watermelon similarity coefficient were clustered into five main groups. Molecular variance analysis (AMOVA) was performed to understand the relationships between masses using GenAlex 6.41 software and finally to investigate the allelic variation in the studied populations from principal component analysis using Landmark software. The results of this study showed that there is a great genetic diversity among the populations collected from different regions of Iran and this study showed the usefulness of SRAP marker in determining the genetic diversity of watermelon
Assesment of genetic diversity of Iranian watermelon (Citrullus lanatus Thumb) landraces using SRAP markers
سرائی سرای، فاطمه
Sarair sarai, Fateme
مطلبی آذر، علیرضا، استاد راهنما
زارع نهندی، فریبرز، استاد راهنما
پناهنده، جابر، استاد مشاور
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
