شناسایی باکتریهای اندوفیت در برخی سبزیجات منتخب رایج منطقه و بررسی کارایی آنها در کنترل بیولوژیک بیماری پوسیدگی نرم باکتریایی
Identification of endophytic bacteria in some selected native vegetable plants and their efficiency in biological control of bacterial soft rot disease
/نازی ارزقی زنوز
: کشاورزی
، ۱۳۹۷
، میرزائی
۱۰۲ص
چاپی - الکترونیکی
کارشناسی ارشد
گیاهپزشکی - بیماریشناسی گیاهی
۱۳۹۷/۱۱/۱۵
تبریز
بیماری پوسیدگی نرم باکتریایی در سبزیجات یکی از بیماریهای مهم اقتصادی در جهان از جمله ایران میباشد که به اندامهای ذخیرهای مثل ریشه هویج، ترب، غدههای پیاز، سیب زمینی، ساقه کرفس، میوه گوجهفرنگی، سبزیهای برگدار و غیره حمله میکند .باکتریهای مختلفی میتوانند در گیاهان پوسیدگی نرم ایجاد کنند ولی یکی از مهمترین و شایعترین آنها، گونههای مختلف جنس Pectobacterium میباشد .جنس Pectobacterium یکی از مهمترین بیمارگرهای گیاهی گرم منفی متعلق به خانوادهPectobacteriaceae و راسته Enterobacteriales میباشد .این گروه از باکتریها عمدتا باعث ایجاد بیماری لهیدگی در بافت پارانشیمی گیاه میزبان میصشوند که دارای پراکنش جهانی بوده و عمدتا محدودیت میزبانی ندارند .کنترل پکتوبکتریومها به علت حضور این بیمارگرها در داخل بافتهای گیاهی و قدرت بقای بسیار بالای آنها در خاک، دشوار میباشد .برای کنترل و کاهش خسارت این بیماری استفاده از روشصهای مختلف از جمله روشصهای زراعی، شیمیایی و بیولوژیک توصیه شده است .ولی به طور کلی محلولپاشی با سموم شیمیایی برای کنترل پوسیدگیهای نرم توصیه نمیشود .از این رو روش کنترل بیولوژیک میتواند در تلفیق با دیگر روشهای کنترل برای کاهش مصرف سموم مورد استفاده قرار گیرد .یکی از روشهای کنترل بیولوژیک استفاده از باکتریهای اندوفیت میباشد .این باکتریها درون بافتهای گیاهی بدون ایجاد آسیب ظاهری زندگی میکنند و با تولید فاکتورهای رشد باعث افزایش متابولیسم، رشد و مقاومت گیاه در برابر عوامل بیماریزا و تنشهای محیطی میشوند .برای این منظور در این تحقیق باکتریهای اندوفیت موجود در چند سبزی منتخب) کاهو، کرفس، پیاز، هویج و سیبصزمینی (جداسازی و خالص سازی گردید و اثر کنترل این باکتریها روی پوسیدگی نرم باکتریایی به روش آزمون کلروفرم در قالب طرح کاملا تصادفی و با سه تکرار مورد بررسی قرار گرفت .در نهایت پنج نمونه از باکتریصهایی که هالهص بازدارندهصصصی قابل ملاحظهصصای بین ۳-۱ سانتیصمتر(۲/۸۳- ۲/۷۲- ۲/۴۴- ۱/۹- ۱/۸۸ (نسبت به باکتری بیمارگر از خود نشان دادند انتخاب گردید و شناسایی باکتریصهای ناحیه ۱۶s با استفاده از جفت آغازگر عمومیF ۸ و R۱۴۹۲ طی واکنش زنجیرهصای پلیصمراز تکثیر گردید .این جفت آغازگر قطعهصای به طول ۱۵۰۰ جفت بازی را از پنج جدایه باکتری تکثیر نمود و محصول واکنش برای توالیصیابی ارسال شد و مقایسه نتایج حاصل از تعیین ترادف ناحیهصی۱۶S rDNA ، با سایر باکتریصهای موجود در پایگاه اطلاعات داده، نشان داد که نمونهصهای مذکور حدود ۹۸ درصد با باکتریصهایBacillus muralis ،Bacillus albus ،Stenotrophomonas maltophilia ، Pseudomonas reinekei و Chryseobacterium soli همخوانی دارند و تستصهای بیوشیمیایی نتایج حاصل از شناسایی مولکولی را تایید کردند .در نهایت مکانیسمصهای موثر در خاصیت آنتاگونیستی که شامل آزمون تولید سیدروفور ,تولید سیانید هیدروژن و تولید اکسین توسط جدایهصهای باکتریایی میصباشد در مورد ۵ جدایه باکتری مورد ارزیابی قرار گرفت که باکتریصهای Pseudomonas reinekei و Stenotrophomonas maltophiliaبه ترتیب به میزان ۱۵۷/۶۲و ۱۲۷/۰۹ میلیصگرم بر لیتر بیشترین میزان تولید اکسین را داشتند و همچنین باکتری Chryseobacterium soli با گرفتن درجه۵ ( آجری رنگ (بیشترین میزان تولید سیانید هیدروژن را داشته است
Bacterial soft rot is one of the most important and common diseases in plant crops; particularly in tuber products and vegetables. Various bacterial species have been reported as causal agent(s) for this disease, but Pectobacterium carotovorum is known as the main one. Control of Pectobacterium is difficult due to their presence in herbal tissues and the power of survival in the soil. It is recommended to control this pathogen by using certified seed tubers; disinfection with chemical compounds in the store; use of resistant cultivars; crop rotation and disinfection of soil before planting. Among the new controlling methods, the use of endophytic microorganims is a novelty approach. These endophytic bacteria live within plant tissues without causing harm, and by generating growth factors, they increase plant metabolism, growth, and resistance to pathogens and environmental stresses. For this purpose, endophytic bacteria in selected selected vegetable were isolated and purified and the effect of control of these bacteria on bacterial soft decay was investigated using chloroform test in a completely randomized design with three replications. Finally, five samples of bacteria with a significant inhibitory effect between 1-3 cm (2.83- 2.72- 2.44- 1.9- 1.88) were selected for detection of bacteria. The results of 16S rDNA sequencing, indicated that there are 98 similarity with Bacillus muralis, Bacillus albus, Stenotrophomonas maltophilia, Pseudomonas reinekei, Chryseobacterium soli which biochemical tests confirmed the results of molecular identification. The suplimentary experiments showed that Pseudomonas reinekei and Stenotrophomonas maltophilia had the highest auxin production amount (157.62 and 127.09 mg/l) and Chryseobacterium soli had the highest levels of hydrogen cyanide
Identification of endophytic bacteria in some selected native vegetable plants and their efficiency in biological control of bacterial soft rot disease