غربالگری جهش های ژن های BBS۱۰ و BBS۱۲ در مبتلایان به نشانگان باردت-بیدل استان خوزستان
/عماد نیک خواه
: علوم طبیعی
، ۱۳۹۶
، افشاری
چاپی
دکتری
علوم جانوری
۱۳۹۶/۰۶/۲۰
تبریز
نشانگان باردت بیدل یک بیماری هتروژنیک و مولتی سیستمیک است که ۱۹ ژن در بروز این نشانگان نقش دارند .ژن های درگیر در بروز این نشانگان متفاوت بوده و برحسب منطقه جغرافیایی متفاوت است .در این مطالعه جهش ها و ژن های دخیل در بروز نشانگان باردت بیدل را در ۱۲ خانواده ی ایرانی را با استفاده از تکنیک NGS مورد بررسی قرار دادیم .نمونه خون بیماران در تیوب های محتوی EDTA جمع آوری شد و سپس DNA ژنومی آنها با استفاده از تکنیک Salting out استخراج شد .بعد از استخراج، DNA توسط تکنیک های۱۳) NGS - (BBS۱و توالی یابی سنگر مورد بررسی قرار گرفت .این آنالیز با هدف شناسایی واریانت های پاتوژن جدید صورت گرفت .بیماران اکثرا متعلق به دو قومیت عرب و لر بودند که ازدواج فامیلی در این قومیت ها شایع است .از ۱۲ خانواده مورد بررسی در ۷ خانواده جهش درگیر در بروز بیماری شناسایی شد و ۵ تا از خانواده ها جهشی در آنها گزارش نشد .از جهش های گزارش شده در این مطالعه، دو جهش جدید شناسایی شد که عبارتند از (c.۵۶T>G(p.leul۹Arg) :و (c.۱۱۵۶C>T(p.Arg۳۸۶Trp) به صورت هتروزیگوت مرکب در ژن BBS۱۲ و c.۱۲۷۷A>G (p.Asn۴۲۶Ser) در ژن BBS۱ نتایج حاصله از این مطالعه نشاندهنده ی اهمیت ژن BBS۱۲ در بروز این نشانگان در جمعیت ایرانی است .پس می توان از جهش های شناسایی شده در این مطالعه بویژه در BBS۱۲ به عنوان پانلی برای تشخیص نشانگان BBS در مشاوره ژنتیک افراد در معرض خطر بیماری در جمعیت ایرانی بهره برد
Bardet-Biedl syndrome(OMIM 209900) is a Heterogeneous and Multisystemic disease, in which nineteen genes seems to be involved. Causative genes vary among different geographical region. This study was aimed to find the causative genes of Bardet-Biedl syndrome in twelve Iranian families suffering from the disease using next generation sequencing strategy(NGS). Twelve Iranian families having Bardet-Biedl syndrome children were included in this study. Blood samples were collected in EDTA-containing tube. Genomic DNA was extracted using salting out procedure and analyzed by targeted NGS (BBS1-13) and Sanger sequencing. This analysis performed to reveal if the novel variants are pathogenic. Generally patients belonged to Arab and Lur races that have had consanguineous marriage. Mutations involved in occurrence of BBS were detected in 7 out of 12 studied families, and no mutations were reported for other 5 families. Two new mutations were detected from all reports of this study which are: c.56T>G (p.leul9Arg) c.1156C>T (p.Arg386Trp) in Compound Heterozygote in BBS12 gene and c.1277A>G (p.Asn426Ser) in BBS1 gene. Owing to for mentioned results, it seems that BBS12plays an important role in pathogenesis of Iranian cases of Bardet-Beidl syndrome. This finding suggests that BBS12 gene should be considered during the genetic counseling of Iranian patients