پ۲۹۴۵۲
per
(Camelina sativa L.) روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت لاینهاي هاپلوئید مضاعف شده کاملینا براساس نشانگرهاي رتروترانسپوزونی و پروفیل اسیدهاي چرب
امیر عونی کهنموئی
کشاورزی
۱۴۰۲
۶۸ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
بیوتکنولوژی کشاورزی
۱۴۰۲/۰۶/۲۶
کاملینا یک گیاه روغنی می باشد که در سالهای اخیر به دلیل ویژگیهای منحصر به فرد از جمله سازگاری به طیف وسیعی از شرایط محیطی، تحمل به تنشهای غیرزیستی، دوره رشد کوتاه و ویژگی¬های خاص روغن مورد توجه قرار گرفته است. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت 128 لاین هاپلوئید مضاعف شده کاملینا با استفاده از نشانگرهای رتروترانسپوزونی و پروفیل اسیدهای چرب مورد بررسی قرار گرفت. در تکنیک IRAP با استفاده از هفت آغازگر LTR، در مجموع 84 نشانگر چند شکل با میانگین82/7 نشانگر به ازای هر آغازگر و میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) 4/0 تکثیر شد. با استفاده از ترکیب شش آغازگر LTR با شش آغازگر ISSR در تکنیک REMAP، در مجموع 88 نشانگر چند شکل با میانگین 67/14 نشانگر به ازای هر ترکیب آغازگری و PIC 4/0 تکثیر گردید. در تجزیه واریانس مولکولی بر اساس داده¬های هر دو سیستم نشانگری، تنوع ژنتیکی درون گروهی بیشتر از بین گروهی به دست آمد. بیشترین میزان تنوع ژنتیکی درون گروهی در لاین¬های هاپلوئید حاصل از تلاقی Voronezskij349×Kirgizskij1 (تلاقی 1) مشاهده شد. تجزیه خوشه¬ای مبتنی بر فاصله و مدل بر اساس مجموع داده¬های IRAP و REMAP، لاین¬های مورد مطالعه را به دو گروه منتسب کردند. در تجزیه به بردارهای اصلی بر اساس مجموع داده های نشانگری، سه بردار اول در مجموع 59/26 درصد از تغییرات کل را تبیین کردند. در هیچ کدام از گروه بندی های حاصل، ساختار مشخصی بین لاین های مورد مطالعه مشاهد نشد. بر اساس مدل خطی مخلوط، 26 نشانگر شامل 16 نشانگر REMAP و 10 نشانگر IRAP با صفات مورد مطالعه ارتباط معنی دار نشان دادند. نشانگر 235 جفت بازی حاصل از ترکیب آغازگری 5'LTR2-ISSR23-4 با میزان اسید استئاریک، اسید ایکوزانوئیک و اسید بهینیک ارتباط معنی دار داشت. مطالعه حاضر نشان داد که نشانگرهای رتروترانسپوزی می توانند برای مطالعات مولکولی در کاملینا مورد استفاده قرار گیرند.
Camelina, an oilseed crop, has garnered significant attention in recent years due to its distinct attributes, including its adaptability to diverse environmental conditions, resilience in the presence of abiotic stressors, short growth cycles, and the unique properties of its oil. In this study, the genetic diversity and population structure of 128 doubled haploid lines have been quantified utilizing retrotransposon markers and fatty acid profiles. In the IRAP technique employing seven LTR primers, a total of 84 polymorphic markers were amplified, with an average of 7.82 markers per primer and an average Polymorphic Information Content (PIC) of 0.4. Using the combination of six LTR primers with six ISSR primers in the REMAP technique, a total of 88 polymorphic markers were amplified with an average of 14.67 markers per primer combination and an average PIC of 0.4. In the analysis of molecular variance based on the data from both marker systems, it was evident that genetic diversity within the group exceeded that between the groups. Notably, the highest level of genetic diversity within the group was observed in the haploid lines generated from the cross between Voronezskij349 and Kirgizskij1. Cluster analysis, employing both distance-based and model-based approaches using the complete dataset of IRAP and REMAP markers, categorized the examined lines into two distinct groups. Furthermore, the principal coordinate analysis, conducted on the complete marker dataset, demonstrated that the first three coordinates jointly explained 26.59% of the total observed variations. No specific structural patterns were observed among the studied lines in any of the resulting groupings. However, through the implementation of a mixed linear model, it was identified that 26 markers, comprising 16 REMAP markers and 10 IRAP markers, exhibited a significant association with the studied traits. The 235 bp marker, generated from the primer combination 5'LTR2-ISSR23-4, displayed a significant association with the levels of stearic acid, eicosanoic acid, and behenic acid. This current characterization underscores the utility of retrotransposon markers for conducting molecular investigations in Camelina.
Thesis Title: Genetic relationships and population structure of Camelina (Camelina sativa L.) doubled haploid lines based on retrotransposon markers and fatty acids profile
عونی کهنموییُ،
امیر
تهیه کننده
محمدیُ،
کهریزیُ،
سید ابوالقاسم
دانیال
استاد راهنما
استاد مشاور
تبریز
