پ۲۷۸۲۳
per
بررسی بیان RNA غیر کدکننده CBR3_AS1 و PCA3 در سرطان معده
پریسا نجاری
علوم طبیعی
۱۴۰۱
۷۶ص.
سی دی
کارشناسی ارشد
زیست‌شناسی جانوری
۱۴۰۱/۰۶/۳۰
سرطان معده پنجمین سرطان شایع درجهان و سومین علت مرگ و میر ناشی از سرطان است. سرطان معده یک بیماری چندعاملی است که عوامل ژنتیکی و محیطی در ایجاد و پیشرفت بیماری دخالت دارند. مطالعات نشان می دهد LncRNA تاثیر به سزایی در شروع و توسعه سرطان ها دارند. شواهد زیادی حاکی از تغییر بیان LncRNAهای متفاوت در سرطان معده است که این LncRNAها می توانند در متاستاز، آپوپتوز، چرخه سلولی و... نقش ایفا کنند. ژن CBR3-AS1 روی کروموزوم21 قرار دارد و در کارسینوم سلول های سنگفرشی مری، سرطان کلورکتال، استئوسارکوما و رتینوبلاستوما نقش دارد. ژن PCA3 روی کروموزوم 9 قرار دارد و یک بیومارکر تشخیصی در سرطان پروستات است. همچنین این LncRNA در سرطان تخمدان نیز افزایش بیان نشان می دهد. با توجه به نقش آنکوژنی LncRNAهای فوق، هدف این مطالعه بررسی میزان بیان ژن های نام برده در سرطان معده است. در مطالعه موردی-شاهدی حاضر، نمونه های جامد بافت توموری و حاشیه تومور معده از 100بیمار مبتلا به سرطان معده، گردآوری شد. RNAکل با پروتکل Trizol استخراج شد. از RNAکل بدست آمده به کمک کیت سنتز cDNA، DNAمکمل (cDNA) ساخته شد و واکنش Real-time PCR انجام شد. تجزیه و تحلیل داده های حاصل به کمک نرم افزار های SPSS نسخه26 و GraphPad نسخه9 انجام گرفت. نتایج نشانگر افزایش بیان معنی دار PCA3 (0.0001P-vale<) و CBR3-AS1 (0.0001P-vale<) در بافت توموری بیماران مبتلا به سرطان معده می باشد. نتایج آماری حاصل از میزان بیان ژن های PCA3 و CBR3-AS1 در دو جنس زن و مرد، گروه سنی زیر50 سال و بالای 50 سال، متاستاز و عدم متاستاز به گره های غدد لنفی، سایز توموری بیشتر از 5 سانتی متر و کمتر از 5 سانتی متر و دو نوع سرطان معده ی منتشر و روده ای، نشانگر عدم ارتباط معنی دار در گروه های ذکر شده می باشد. با توجه به نتابج حاصل شده از منحنی ROC میتوان به این نتیجه رسید ژن های PCA3و CBR3-AS1 با AUC به ترتیب 0.68 و 0.79 به عنوان یک آنکوژن در سرطان معده است و به ترتیب یک بیومارکرضعیف و متوسط تشخیصی در این بیماری هستند.
Gastric cancer is the fifth most common cancer and the third cause of death from Gastric cancer. Gastric cancer is a multifactorial disease in which genetic and environmental factors are involved in the development and progression of the disease. Studies show that LncRNAs have a significant effect on the initiation and development of cancers. Many evidences indicate the change in the expression of different LncRNAs in gastric cancer, that these LncRNAs can play a role in metastasis, apoptosis, cell cycle, etc. The CBR3-AS1 gene is located on chromosome 21 and is involved in esophageal squamous cell carcinoma, colorectal cancer, osteosarcoma, and retinoblastoma. PCA3 gene is located on chromosome 9 and is a diagnostic biomarker in prostate cancer. Also, this LncRNA shows increased expression in ovarian cancer. Considering the oncogenic role of the above LncRNAs, the aim of this study is to investigate the expression level of the mentioned genes in gastric cancer. In this case-control study, solid tumor tissue and gastric tumor margins were collected from 100 patients with gastric cancer. Total RNA was extracted with Trizol protocol. Complementary DNA (cDNA) was made from total RNA obtained with the cDNA synthesis kit and real-time PCR reaction was performed. Analysis of the obtained data was done with the help of SPSS version 26 and GraphPad version 9 software. The results show a significant increase in the expression of PCA3 (P-vale < 0.0001) and CBR3-AS1 (P- vale < 0.0001) in the tumor tissue of patients with gastric cancer in compare with adjacent marginal tissues. Statistical analysis results of PCA3 and CBR3-AS1 gene expression in both men and women, age groups under 50 years and over 50 years, metastasis and non-metastasis to lymph nodes, tumor size greater than 5 cm and less than 5 cm and two types of disseminated gastric and intestinal cancer indicate no significant relationship in the mentioned groups. According to the results obtained from the ROC curve, it can be concluded that PCA3 and CBR3-AS1 genes with AUC of 0.68 and 0.79 respectively could have oncogenic role in gastric cancer and consider as weak and moderate diagnostic biomarkers in GC.
Investigation of Long non-coding RNA CBR3_AS1 and PCA3 expression in Gastric cancer
نجاری،
پریسا
تهیه کننده
حسین‌پور فیضی،
صفر علیزاده،
محمدعلی
رضا
استاد راهنما
استاد راهنما
تبریز
