İnfluenza virüsü Nuklear Eksport Proteini Ile Nukleoporin Proteinleri arasındaki ilişkinin moleküler düzeyde araştırılması
[Thesis]
Şenbaş, Burçak
Turan, Kadir
Marmara Universitesi (Turkey)
2019
130 p.
Master's
Marmara Universitesi (Turkey)
2019
Amaç: İnfluenza A virüsleri insanlarda tekrarlayan grip salgınlarına yol açan viral bir patojendir. Diğer RNA virüslerinin aksine bu virüslerin replikasyon ve transkripsiyonları konak hücre nukleusunda gerçekleşir. Dolayısıyla viral ribonukleoprotein partiküllerinin nukleo-sitoplazmik transportu gereklidir. Virüs replikasyonu için önemli olan bu olayda viral nuklear eksport proteini (NEP) olarak da bilinen NS2 proteini ve konak hücre nukleoporinleri işlev görmektedir. Transport olayının moleküler düzeyde mekanizması çok iyi bilinmemektedir. Bu çalışmada, nuklear transportta iş gören NUP214 ve NUPL2 proteinleri ile viral NS2 proteininin memeli hücrelerinde ilişkilerinin aydınlatılması amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Farklı bir çalışma kapsamında maya ikili-hibrit metodu ile ilişkilendirilen NUP214 ve NUPL2 ile viral NS2 proteinleri arasındaki etkileşimi memeli hücrelerinde araştırmak için birlikte immün-lokalizsayon ve birlikte çöktürme testlerinden yararlanıldı. Bunun için insan NUP214 ve NUPL2 ile viral NS2 proteinlerini kodlayan plazmitler oluşturuldu. Bu plazmitler ile geçici olarak transfekte edilen HeLa hücrelerinde nuklear por kompleksi proteinleri ile influenza A virüsü NS2 proteinin hücre içi lokalizasyonları immünfloresan teknikler ile saptandı. Benzer şekilde plazmitler ile transfekte edilen HEK293 hücrelerinden hazırlanan lizatlarda spesifik antikorlar kullanılarak ya da glutatyon sefaroz ile söz konusu proteinler çöktürüldü ve çökelen proteinler SDS-PAGE / western melezleme tekniği ile analiz edildi. Bulgular ve Sonuç: İmmünfloresan testler, geçici olarak transfekte edilen HeLa hücrelerinde NS2 ve NUP214 proteinlerinin birlikte lokalize olduklarını saptadı. İmmün çöktürme ve glutatyon sefaroz ile çöktürme testlerinde de NS2 ve NUP214 proteinlerin birlikte çökeldiği görüldü. HEK214 hücrelerinde NUP214'ün aşırı ekpresyonunun influenza A virüsü replikasyonunu negatif yönde etkilediği saptandı. İnfluenza NS2 proteini ile NUPL2 arasında uygulanan koşullarda beklenen etkileşim saptanamadı.