عنوان

Investigation on the expressional signatures of lncRNAs GUARDIN, TP53TG1, MIR22HG in Luminal A Breast Cancer and Evaluation of the knock-down effect of one of the non-coding RNAs on cell apoptosis through p53 regulatory pathway,بررسی بیان lncRNAهای GAURDIN، TP53TG1، MIR22HG و در سرطان پستان لومينال A و ارزيابی اثر ناك داون يكی از اين RNA های غير كد كننده بر آپاپتوز سلولی از طريق مسير تنظيمی p53

98790P

انگلیسی

Investigation on the expressional signatures of lncRNAs GUARDIN, TP53TG1, MIR22HG in Luminal A Breast Cancer and Evaluation of the knock-down effect of one of the non-coding RNAs on cell apoptosis through p53 regulatory pathway

بررسی بیان lncRNAهای GAURDIN، TP53TG1، MIR22HG و در سرطان پستان لومينال A و ارزيابی اثر ناك داون يكی از اين RNA های غير كد كننده بر آپاپتوز سلولی از طريق مسير تنظيمی p53

[Dissertation]

Ahmad Alaa Hossein Alkateb

علا حسین الکاتب

Tehran University of Medical Sciences, Medicine school

1401

150p

Spciality(PHD)

دکتری تخصصی (PHD)

Medical Genetics

1401/09/26

1401/09/26

19.8

19.8

Background: Breast cancer is a heterogeneous disease classified into four molecular subtypes, each with its own set of biological characteristics and clinical implications. Several studies demonstrate that long non-coding RNAs (lncRNAs) are dysregulated in breast cancer and have the potential to become biomarkers in this disease.Aim: This study aimed to interrogate the MIR22HG, LNCTAM34A, and TP53TG1 lncRNA gene signatures in breast cancer subtypes, their association with clinical outcomes, examine how well these gene signatures predict prognosis, and to investigate the function of these lncRNAs.Methods: The expression profiles of the chosen LncRNAs were compared in 150 tumor tissues to the corresponding tumor-adjacent normal tissues (TANs) by qPCR and their correlations with clinical features were assessed. In order to decipher molecular mechanism of these LncRNAs in breast cancer pathogenesis functional analysis, including Small interfering RNA (siRNA)-mediated knockdown assay, cell proliferation experiment, apoptosis analysis, and western blot test have been carried out. Statistical analyses were performed with SPSS 22.Results: A significantly decreased expression of the selected lncRNAs was observed in tumor tissues than TANs in all BC subtypes (P < 0.05) excluding TP53TG1 in Luminal B and LNCTAM34A in the TNBC subtype (P > 0.05). Furthermore, expression levels of MIR22HG, LNCTAM34A, and TP53TG1 lncRNAs showed a significant association with different clinicopathological characteristics including age, LNM status, tumor size, grade, and TNM stage in four subtypes of BC (P < 0.05). The results showed that tumor growth and apoptosis inhibition could be prompted upon MIR22HG, LNCTAM34A, and TP53TG1 knockdown, indicating that down-regulation of these lncRNAs in BC may also contribute to increased cell proliferation and poor prognosis.Conclusion: Our results indicate that the tumor-suppressive role of MIR22HG, LNCTAM34A, and TP53TG1 in a lncRNA-mediated regulatory mechanism may provide a new therapeutic strategy.

پیش زمینه: سرطان پستان بیماری هتروژنی است که به چهار سابتایپ مولکولی دسته بندی شده که هرکدام از آن ها خصوصیات بیولوژیک و ویژگی های بالینی خاص خود را دارند. مطالعات متعددی نشان داده اند که در اثر سرطان پستان، تعادل lncRNA ها دچار اختلال شده و در نتیجه، به نظر می رسد که بتوان آن ها را به عنوان بیومارکر این بیماری در نظر گرفت. هدف: در این پژوهش سطح بیان سه lncRNA، به ترتیب MIR22HG، LNCTAM34A ، و TP53TG1، در سابتایپ های مختلف سرطان پستان مورد مطالعه قرار گرفتند تا عملکرد و ارتباط آنها با ویژگی های بالینی بررسی شود و همچنین میزان کاربرد آنها در تعیین پیش آگهی سرطان مورد بررسی قرار بگیرد. روش: پروفایل بیانی lncRNA های مورد نظر در 150 بافت تومور و بافت نرمال مجاور آن ها (TANs) به روش PCR کمی مقایسه شده و ارتباط آن ها با ویژگی های بالینی مورد بررسی قرار گرفته شده است. همچنین، برای کشف مکانیزم مولکولی این سه lncRNA ، آنالیزهای کارکردی گوناگونی از جمله آزمایش ناکداون با استفاده از RNA های مداخله گر کوچک، بررسی تکثیر سلولی ، آنالیز آپوپتوز و تست وسترن بلات انجام گرفت. نتایج: به غیر از TP53TG1 در ساپتایپ لومینال B و LNCTAM34A در سابتایب TNBC (P>0.05) ، میزان بیان lncRNA های انتخابی در بافت تومور انواع سرطان پستان نسبت به TAN ها به میزان قابل توجهی کاهش پیدا کرد (P<0.05) . همچنین رابطه ی قابل توجهی میان میزان بیان MIR22HG، LNCTAM34A، و TP53TG1 و ویژگی های بالینی/ آسیب شناسی از جمله سن ، وضعیت LNM، سایز تومور، درجه تومور (grade) و وضعیت TNM در انواع سرطان پستان مشاهده شد. نتایج پژوهش نشان دادند که ناکداون کردن MIR22HG ، LNCTAM34A و TP53TG1 می تواند منجر به رشد تومور و مانع آپوپتوز شود. این مشاهده نشانگر این است که کاهش بیان این lncRNA ها می تواند یکی از عوامل افزایش تکثیر سلولی و پیش آگهی ضعیف در سرطان پستان شود. جمع بندی: نتایج این پژوهش نشانگر این است که ممکن است در آینده بتوان از خواص مهاری MIR22HG ، LNCTAM34A و TP53TG1 در استراتژی های تشخیصی و درمانی سرطان پستان استفاده کرد.

پستان

Breast

شاخص‌های زیست‌شیمیایی

Biochemical markers

-- سرطان

-- Cancet

a04

a04

a07

a07

سابتایپ

Subtypes

Long non-coding RNA

Biomarker

lncRNA

GUARDIN

TP53TG1

MIR22HG

Luminal A Breast Cancer

knock-down effect

non-coding RNA

p53 regulatory pathway

Aسرطان پستان لومينال

اثر ناك داون

آپاپتوز سلولی

مسیر تنظیمی P53

RNA های غیر کد کننده

, Author

, Author

Alkateb, Ahmad Alaa Hossein

الکاتب، احمد علا حسین

, Thesis advisor

, Thesis advisor

, Thesis advisor

, Thesis advisor

Modarressi, Mohammad Hossein

مدرسی، محمد حسین

Akrami, Mohammad

اکرمی، محمد

Tehran University of Medical Sciences, Medical school

ایران

20230110

2393F

p

TL

276903

a

Y