عنوان

Identification, Genotyping and Drug Susceptibility Patterns of Mycobacteria Isolated from HIV Positive Patients at Tehran Province, Iran,شناسایی، ژنوتایپینگ و بررسی الگوی حساسیت دارویی مایکوباکترم جدا شده از بیماران مبتلا به HIV در استان تهران-ایران

95658P

انگلیسی

Identification, Genotyping and Drug Susceptibility Patterns of Mycobacteria Isolated from HIV Positive Patients at Tehran Province, Iran

شناسایی، ژنوتایپینگ و بررسی الگوی حساسیت دارویی مایکوباکترم جدا شده از بیماران مبتلا به HIV در استان تهران-ایران

[Dissertation]

Seifu Gizaw Feyisa

سیفو گیزا فیزا

Tehran University of Medical Sciences, Medicine school

2019

62p

PHD

دکتری تخصصی(phd)

Medical Bacteriology

باکتری شناسی پزشکی

1398

Background: Mycobacterial infections have radically increased worldwide due to the increase in HIV infections. The disease activity increases with progressive immunodeficiency. Objective: The objectives of this study were to identify, genotyping and determining drug susceptibility patterns of mycobacteria isolated from HIV positive patients. Moreover, it was to evaluate the clinical significance of the identified species.Methods: A total of 217 HIV seropositive patients suspected of having mycobacterial infection were recruited for this study from April 2018 to August 2019 at Emam Khomeini referral hospital, and Regional tuberculosis laboratory in Tehran, Iran. Clinical samples were collected from each patient and cultured on Lowenstein-Jensen media. Drug susceptibility patterns of M. tuberculosis isolates were determined for 7 drugs. The NTM isolates were subjected to sequencing of multiple genes, including 16S-23S rRNA internal transcribed spacer (ITS), and hsp65 sequence and drug susceptibility test for 10 drugs were performed. Results: Of 217 patients 28 (12.9%) were culture positive and 20 (9.2%) and 3.7% were positive for Mycobacterium tuberculosis and nontuberculous mycobacteria respectively. In this study, 4 rapid and 4 slow-growing NTM species were isolated and identified. Mycobacterium fortuitum was the most common NTM species, 3/8 (37.5%), followed by Mycobacterium kansasii, 2/8 (25%). The cases were identified as pulmonary disease, 5/8 (62.5 %), disseminated infection, 2/8 (25%), and skin abscess, 1/8 (12.5%). M. chelonae and Mycobacterium avium were isolated from patients diagnosed with disseminated infection. The skin abscess was caused by infection with M. simia. The results of the MIC testing were as follow: 1 (5%) and 3 (15%) MTB isolates were resistant to INH and EMB, respectively; of which 1 was resistant to INH and EMB, while 17/20 (85%) MTB isolates were susceptible to all the tested drugs in this study.M. kansasii and M. fortuitum were susceptible to amikacin (AMK); M. avium to clarithromycin (CLA); M. fortuitum 2/3 (67%) to ciprofloxacin (CIP); M. kansasii isolates to CLA and AMK, and M. chelonae to AMK and linezolid (LIN) Conclusion: The incidence of NTM to MTB complex in the HIV coinfected patients was 1:2.5 in Tehran province and the prevalence of drug resistance MTB strains was statically insignificant in this study (p > 0.05), none of the isolates were MDR TB. Also the prevalence of TB was significantly low in females. AMK showed incredible in vitro activity against M. kansasii, M. avium and M. fortuitum, whereas M. simia was resistant to the entire tested drugs.

مقدمه و هدف: به علت افزایش عفونت HIV، عفونت های ایجاد شده توسط مایکوباکتریوم در حال افزایش می باشد. در واقع عفونت های مایکوباکتریوم، با نقص سیستم ایمنی افزایش می یابند. هدف از این مطالعه بررسی انتشار گونه های مایکوباکتریوم جدا شده از نمونه های بالینی با روش تایپینگ مبتنی بر تعیین توالی چند ژن و ارزیابی اهمیت بالینی گونه های شناسایی شده، می باشد.روش کار: در این مطالعه 217 بیمار مبتلا به HIV، جهت عفونت مایکوباکتریوم مورد بررسی قرار گرفتند. نمونه گیری در بیمارستان امام خمینی و آزمایشگاه تشخیص سل شهر تهران از تیر 1397 تا شهریور 1398 انجام شد. نمونه های بالینی جمع آوری شده از بیماران در محیط لون اشتاین جانسون کشت داده شدند. الگوی مقاومت دارویی ایزوله های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس برای 7 دارو تعیین شد. تعیین حساسیت ایزوله های غیرتوبرکلوزیس برای 10 دارو انجام شد و ژن های 16S-23S rRNA، ITS و hsp65 تعیین توالی شدند. یافته ها: از 217 بیمار، نتیجه کشت در 28 (9/12 %) مورد مثبت شد که 20 (2/9 %) مورد از آن مایکوباکتریوم توبرکلوزیس و 8 مورد مایکوباکتریوم های غیر توبرکلوزیس جداسازی شد. تست حساسیت آنتی بیوتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس برای 7 آنتی بیوتیک انجام شد. همچنین، تعیین توالی ناحیه ژنی 6S-23S rRNA internal transcribed spacer (ITS) و hsp65 و بررسی حساسیت آنتی بیوتیکی سویه های مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس برای 10 آنتی بیوتیک انجام شد. اطلاعات بالینی و تاریخچه بیماران مورد بررسی و آنالیز قرار گرفت. همچنین با روش مبتنی بر تعیین توالی، مایکوباکتریوم های غیرتوبرکلوزیس جدا شده از بیماران تا سطح گونه شناسایی شد.در این مطالعه، 4 گونه تند رشد و 4 گونه کند رشد مایکوباکتریوم غیر توبرکلوزیس جداسازی و شناسایی شد. شایع ترین گونه های جدا شده شامل 3 (5/37 %) گونه مایکوباکتریوم فورتئیتوم و 2 (25 %) گونه مایکوباکتریوم کانزاسی بود. 5 (5/62 %) ایزوله از عفونت های تنفسی و 2 (25 %) ایزوله از عفونت منتشره و 1 (5/12 %) ایزوله از آبسه پوست جداسازی شد. مایکوباکتریوم چلونی و مایکوباکتریوم اویوم از عفونت منتشره در بیماران با نقص درمان، جداسازی شدند. مایکوباکتریوم سیمیه از آبسه پوست جداسازی شد. نتیجه آنتی بیوگرام نشان داد که به ترتیب 1 (5 %) و 3 (15%) مایکوباکتریوم های توبرکلوزیس به ایزونیازید و اتامبوتول مقاوم اند. این در حالی است که 17 (85 %) از سویه های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به تمام آنتی بیوتیک های مورد بررسی در این مطالعه دارای حساسیت بودند.مایکوباکتریوم کانزاسی و فورتئیتوم به آمیکاسین، مایکوباکتریوم اویوم به کلاریتومایسین، 2 (67%) مایکوباکتریوم فورتئیتوم به سیپروفلوکساسین، مایکوباکتریوم کانزاسی به کلاریتومایسین، آمیکاسین و مایکوباکتریوم چلونه به آمیکاسین و لینزولاید حساس بودند.نتیجه گیری: بروز همزمان عفونت HIV-مایکوباکتریم توبرکلوزیس و HIV-مایکوباکتریم غیرتوبرکلوزیس در این مطالعه به ترتیب 1 و 5/2 بود. هیچ کدام از ایزوله های مایکوباکتریم توبرکلوزیس، به چند دارو مقاوم نبودند. شیوع مایکوباکتریم توبرکلوزیس به طور معناداری در زنان کمتر بود. آمیکاسین اثر فوق العاده ای را در شرایط آزمایشگاهی در مقابل مایکوباکتریوم کانزاسی، مایکوباکتریوم آویوم و مایکوباکتریوم فورتئیتوم داشت. درحالی که مایکوباکتریوم سیمیه به تمام داروها مقاوم بود.

مایکوباکتری سل

Mycobacterium tuberculosis

اشخاص مبتلا به اچ. آی. وی.

HIV - positive persons

a07

a07

a17

a17

16S-23S rRNA internal transcribed spacer

hsp65

Minimum inhibitory concentration

nontuberculous mycobacteria

حداقل غلظت مهاری

مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

مایکوباکتریوم غیرتوبرکلوزیس

ژنوتایپینگ

Genotyping

drug susceptibility patterns

الگوی حساسیت دارویی

مایکوباکترم

Myobacteria

, Author

, Author

Gizaw Feyisa, Seifu

گیزا فیزا، سیفو

, Thesis advisor

, Thesis advisor

, Thesis advisor

, Thesis advisor

Feizabadi, Mohammod Mehdi

فیض آبادی، محمدمهدی

Hasannejad, Malihe

حسن نژاد، ملیحه

Tehran University of Medical Sciences, Medicine school

ایران

20230524

1947F

p

TL

276903

a

Y