بررسی متیلاسیون و تغییرات در سطح ترانسکر یپتوم و پرئتئوم ژن های FKBP51 - PHLDA3 - GRHL3 در بیماران مبتلا به سرطان سلول های سنگفرشی سر وگردن
[پایان نامه]
نگین صفارزاده
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
۱۳۹۹
۱۵۷ص.
جدول،نمودار
سی دی
دکتری تخصصی(PHD)
ژنتیک پزشکی
۲۰
سرطان سلول های سنگفرشی سروگردن HNSCC (Head and Neck Squamous Cell Carcinoma) ششمین بدخیمی شایع در دنیا است و سالانه حدود 500 هزار مورد جدید و 300 هزار مرگ در ارتباط با این سرطان گزارش می شود. میزان مرگ و میر بالا و عوارض شدید 2 ویژگی مهم سرطان سر و گردن می باشد. مسیرهای RAS/MAPK ، PI3-K/AKT و STATمسیرهای سیگنالینگ پایین دست رسپتورهای تیروزین کینازی میباشند. تغییر در مسیرهای سیگنالینگ درون سلولی مکانسیم عمومی در ایجاد و پیشرفت تومور است.با توجه به اینکه در سرطان سر و گردن، مسیر PI3K نقش بسیار مهمی را ایفا میکند، لذا در مطالعه حال حاضر با بررسی سطح بیان ژنهای پایین دست دخیل در تنظیم و پیشرفت مسیر سیگنالینگ بخصوص تنظیم کننده های منفی دخیل در این مسیر مانند GRHL3 ,PHLDA3 ,FKBP51 که کاهش بیان آنها در بدخیمیها گزارش شده است، در صورت مشاهده تغییرات در سطح ترانسکریپتوم، پروتئوم و متیلاسیون این ژن ها میتوان به نتایج قابل توجهی در تشخیص، پیش آگهی، پیش گویی و درمان هدفمند HNSCC دست یافت. روش: 45 نمونه تازه سرطان سلولهای سنگفرشی سر و گردن و 45 نمونه کنترل از بیمارستان امام خمینی و بیمارستان امیر اعلم جمع آوری شد. پس از استخراج RNA از بافت، cDNA سنتز شد. بیان سه ژن GRHL3، PHLDA3 و FKBP51 توسط Real Time PCR ارزیابی شد و در ژنهایی که تغییر بیان معنادار بود، تغییر بیان در سطح پروتئین نیز توسط وسترن بلات مورد مطالعه قرار گرفت. در این مطالعه برای مشاهده تغییرات تنظیم کننده های پروموتری، متیلاسیون پروموتر توسط روشqMSP بررسی شد.نتایج: نتایج حاکی از آن است که تغییر بیان در GRHL3 با کاهش و در PHLDA3 با افزایش معنادار مواجه بود، در FKBP51 تغییر بیان معنادار نبود. البته تغییر بیان در سطح پروتئین تایید نشد. همچنین تجزیه و تحلیل متیلاسیون نشان داد که تنظیم کننده های پروموتری در GRHL3 هایپرمتیله و در PHLDA3 هیپومتیله شده بودند. همچنین نتایج حاصل از وسترن بلات، تغییر بیان در سطح پروتئین در PHLDA3 معنادار بود.نتیجه گیری: این مطالعه برای اولین بار ژنهای GRHL3، PHLDA3 و FKBP51 را در سطح ترانسکریپتوم، پروتئوم و متیلاسیون پروموتری مورد بررسی قرارداد با توجه به نتایج حاصل شده، امیدواریم با مطالعات بیشتر در آینده بتوان GRHL3 و PHLDA3 را بعنوان بیومارکرهای پروگنوستیک معرفی نمود.