عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
۹۳۹۶۸پ
فارسی
فارسی
بررسي اپیدمیولوژی مولكولي ویروس سینسشیال تنفسي انساني (hRSV) و ردیابي موتاسیون های ژن Fدر ناحیه اثرکننده آنتي بادی مونوکلونال Palivizumab
[پایان نامه]
شقایق رزاقی پور
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
۱۳۹۷
۱۰۹ص.
جدول نمودار
سی دی
کارشناسی ارشد
میکروب شناسی پزشکی
ویروس سینسشیال تنفسی انسان پاتوژنی مطرح در نوزادان و کودکان و عامل عمده عفونت حاد دستگاه تنفسی تحتانی کودکان در سراسر دنیا می باشد. با توجه به نقش پروتئین سطحی فیوژن در پاتوژنز، ایجاد پاسخ های سیستم ایمنی و استراتژیهای پیشگیری، اطلاعات اندکی در زمینه تکامل مولکولی این پروتئین در نمونه های بالینی وجود دارد که دلیل کندی پیشرفت تولید واکسن و راهکارهای درمانی hRSV محسوب می شود. هدف این مطالعه ارائه اطلاعات در خصوص تغییرات تکاملی پروتئینF، گزارش سویه های در گردش در نمونه های بالینی در ایران، ردیابی موتاسیون در سایت اتصال آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، با هدف پيش بيني عملکرد واكسن نوترکیب نسل آینده در جمعیت ایران می باشد. مطالعه حاضر بر پایه تعیین سکانس کامل ژن F، تعیین ژنوتایپ ویروس، بررسی تغییرات نوکلئوتیدی، تغییرات اسیدهای آمینه و آنالیز فیلوژنتیک طراحی شده است. مواد و روش کار: از RNA استخراج شده از نمونه های بالینی، جهت سنتز cDNA، PCR ژن نوکلئوپروتئین (N) به منظور تایید ویروس در نمونه ها و تکثیر آمپلیکونهای ژن فیوژن (F) با پرایمرهای اختصاصی استفاده گردید. تعیین سکانس کامل ژن F با سكانس دو طرفه توالي (Bidirectional sequencing) انجام شد. سکانس ها تعیین ژنوتایپ شدند. تغییرات نوکلئوتیدی و تغییرات آمینواسیدی در نواحی مهم سکانس های F در مقایسه با سه سویه رفرانس Long، A2 و ON1 بررسی شد. به منظور مقایسه فواصل تکاملی، درختهای فیلوژنتیک برای سکانس های ما و سکانس های ثبت شده RSVA-F در سایر مناطق جغرافیایی، رسم شدند. نتایج: ژنوتایپ تمام سکانسهای این مطالعه ON1 بود. تغییرات نوکلئوتیدی و آمینواسیدی سکانسها، هومولوژی بالا و اختلاف ژنتیکی کم بین سکانس ها با هم و با سویه های رفرانس را نشان داد. در سایت اتصال آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، هیچ موتاسیونی نداشتیم ولی موتاسیونهایی در اپی توپ های اختصاصی آنتی بادی ها و Cytotoxic T-lymphocytes به چشم خورد. بیشترین موتاسیون ها در مناطق not defined2، not defined4 و Heptad repeat domain2 رخ داده بود. سکانس های ما به همراه سایر سکانس های ON1 ثبت شده در جهان در 6 Lineage و 5 Sublineage قرار گرفتند. هیچ سایتی در سکانسها با فشار گزینش کننده مثبت مشاهده نشد ولی سایت هایی با فشار گزینش کننده منفی وجود داشتند. بحث: تغییر الگوی ژنوتایپیک شایع hRSV در ایران و گزارش سویه ON1 برای اولین بار نشان می دهد که ژنوتایپ ON1 سویه ای Emergent بوده و در حال حاضر در جمعیت ایران غالب شده است. وجود Herd immunity در برابر ژنوتایپ های شایع قبلی و یا سازگاری بهتر ژنوتایپ جدید با محیط و سیستم ایمنی میزبان می تواند توجیهی بر غالب شدن ژنوتایپ ON1 در ایران باشد. عدم وجود موتاسیون در سایت هدف آنتی بادی مونوکلونال Palivizumab، اثربخشی دارو در بیماران با عفونت حاد تنفسی ناشی از hRSV در صورت ورود به ایران را تایید کرده و همچنین این سایت را به عنوان اپی توپ مناسبی در طراحی واکسن نسل آینده معرفی می کند.
ویروس سینسشیال تنفسی انسانی
پروتئین F
Palivizumab
تغییرپذیری ژن F
آنالیز فیلوژنتیک
اپیدمیولوژی مولکولی
واکسن نوترکیب
، پدیدآور
رزاقی پور، شقایق
، استاد راهنما
، استاد مشاور
، استاد مشاور
بنکدار هاشمی، فرهاد
سلیمی، وحید
شاطی زاده ملک شاهی، سمیه
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
ایران
20230226
۱۸۲۹ف
دانشگاه علوم پزشکی تهران، کتابخانه دانشکده پزشکی
p
TF
92029
a
Y
