بررسي متیلاسیون و بیان ژن IRF7 و STAT1 در سلولهای تکهستهای خون محیطی بیماران سیستمیک اسکلروزیس
[پایان نامه]
رمضان رضائی
دانشگاه علوم پزشکی تهران، دانشکده پزشکی
1396
87 ص.
جدول نمودار
سی دی
کارشناسی ارشد
ایمونولوژی
اسكلرودرما از جمله بیماریهای خودايمن است كه به علت درگير كردن بافتهای همبند در دستهی بیماریهای بافت همبند نيز قرار میگیرد. شاخصههای اصلی بیماری شامل فیبروز وسیع، تغییرات عروقی و وجود اتوآنتی بادی برعلیه آنتیژنهای مختلف سلولی است که وجود فیبروز یکی از عوامل اصلی مرگ میر بیماران مبتلا به SScاست. نقش اصلی فاکتورهای القاکنندهی اینترفرون یا IFN signature genes بهصورت فزایندهای در مطالعات مختلف برای بررسی اتیولوژی و پاتوژنز بیماری نشان داده شده است. IRF ها عمدتاً فاکتورهای رونویسی اینترفرون¬های تیپ I و IFN signature genesها (همانند IRF7 و STAT1) در نظر گرفته میشوند و نقش اساسی در تنظیم بسیاری از جنبههای سیستم ایمنی ذاتی و آداپتیو به عهده دارد. بهعنوان فاکتور رونویسی، IRF7 حاوی یک موتیف حفاظتشده متصل به DNA در قسمت انتهای آمینی و یک توالی مورد توافق DNA به نام ISRE در ناحیهی پروموتر ژنهای هدف است. هدف مطالعهی حاضر ارزیابی وضعیت متیلاسیون نواحی CpG در ناحیهی پروموتر ژنهای IRF7 و STAT1 و اینکه آیا وضعیت متیلاسیون نواحی CpG در ناحیهی پروموتر این ژنها میتواند بیان این ژنهای را در سلولهای تکهستهای خون محیطی (PBMC) بیماران سیستمیک اسکلروزیس تحت تأثیر قرار دهد.مواد و روشها: PBMC از سلولهای خون محیطی ۵۰ بیمار SSc و ۳۰ فرد سالم جداسازی گردید. بعد از جداسازی محتوای DNA و RNA سلولهای تکهستهای خون محیطی، آنالیز کمی بهوسیلهی روش Real Time PCR انجام گردید. برای بررسی پروفایل متیلاسیون در ناحیهی پروموتر ژن IRF7 بر روی نمونههای DNA استخراج شده، تیمار بیسولفیت انجام شد و پس از انجام Nested PCR نمونهها تعیین توالی شدند و با نرم افزار Codone code aligner آنالیز گردیدند.یافتهها: تعیین بیان ژن STAT1 در گروه بیمار نسبت به گروه کنترل تفاوت معناداری نداشت اما بیان ژن IRF7 در بیماران نسبت به گروه کنترل بهصورت معناداری افزایش یافته بود. علاوه بر این CpG2 در گروه بیمار نسبت به گروه کنترل هیپومتیله شده بود. بین بیان ژن IRF7 و درصد متیلاسیون ناحیهی پروموتر این ژن یک همبستگی منفی وجود دارد (r= -0.66, P=0.002). با این وجود، همبستگی معناداری بین Rodnan Score با متیلاسیون و بیان ژن IRF7 مشاهده نگردید (به ترتیب r=0.48, P=0.09 و r= -0.42, p=0.51). نتیجهگیری: با در نظر گرفتن مشاهدات فوق، این مطالعه پیشنهاد کرد که هیپومتیلاسیون پروموتر ژن IRF7 در افزایش بیان این ژن و در نتیجه ممکن است در پاتوژنز SSc دخیل باشد.